当前蛋白身份：Q9BUZ4
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2EOD Solution structure of TRAF-type zinc finger domains (190- 248) from human TNF receptor-associated factor 4 提交 2007-03-29 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
190–248（59 aa）
片段：zf-TRAF, UNP residues 190-248
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未记录 | ZN ZINC ION × 2 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 7；293 K；离子强度（mmCIF原始值）120mM；压力 ambient
NMR样品组成
1.13mM uniformly 13C,15N-labeled protein; 20mM TrisHCl; 100mM NaCl; 1mM DTT; 0.02% NaN3; 0.05mM ZnCl2; 1mM IDA; 10% D2O, 90% H2O | 10% D2O, 90% H2O
|
分辨率未提供 |
| 2YUC Solution structure of the TRAF-type zinc finger domains (102-164) from human TNF receptor associated factor 4 提交 2007-04-06 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
102–164（63 aa）
片段：TRAF-type zinc finger domains
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未记录 | ZN ZINC ION × 2 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 7；298 K；离子强度（mmCIF原始值）120mM；压力 ambient
NMR样品组成
1.24mM U-15N, 13C-labeled protein; 20mM d-Tris-HCl; 100mM NaCl; 1mM DTT; 0.02% NaN3; 0.05mM ZnCl2; 1mM IDA, 90% H2O, 10%D2O | 90% H2O/10% D2O
|
分辨率未提供 |
| 3ZJB The structure of the TRAF domain of human TRAF4 提交 2013-01-17 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
283–470（188 aa）
片段：MATH DOMAIN, RESIDUES 283-470
链 B
283–470（188 aa）
片段：MATH DOMAIN, RESIDUES 283-470
链 C
283–470（188 aa）
片段：MATH DOMAIN, RESIDUES 283-470
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未记录 | CL CHLORIDE ION × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 7；15% PEG 4000, 0.1M HEPES PH 7.0
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分辨率 1.84 Å R-free 0.200 |
| 4K8U Crystal structure of TRAF4 TRAF domain 提交 2013-04-18 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
281–470（190 aa）
片段：UNP residues 281-470
链 B
281–470（190 aa）
片段：UNP residues 281-470
链 C
281–470（190 aa）
片段：UNP residues 281-470
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；13% PEG 3350, 0.14M Magnessium formate, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.281 |
| 4M4E TRAF domain of human TRAF4 提交 2013-08-07 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
292–466（175 aa）
链 B
292–466（175 aa）
链 C
292–466（175 aa）
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.2；289 K；0.2M Ammonium fluoride, 20%(w/v) Polyethylene glycol 3350, pH 6.2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 289K
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.277 |
| 5YC1 TRAF4_GPIb complex 提交 2017-09-06 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
290–470（181 aa）
片段：UNP residues 290-470
链 B
290–470（181 aa）
片段：UNP residues 290-470
链 C
290–470（181 aa）
片段：UNP residues 290-470
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；magnesium formate dehydrate, polyethylene glycol 3350
|
分辨率 2.51 Å R-free 0.265 |
| 5YC1 TRAF4_GPIb complex 提交 2017-09-06 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 D
290–470（181 aa）
片段：UNP residues 290-470
链 E
290–470（181 aa）
片段：UNP residues 290-470
链 F
290–470（181 aa）
片段：UNP residues 290-470
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；magnesium formate dehydrate, polyethylene glycol 3350
|
分辨率 2.51 Å R-free 0.265 |
| 9OGV Identification of ligands for E3 ligases using fragment-based methods 提交 2025-05-02 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
292–466（175 aa）
链 B
292–466（175 aa）
链 C
292–466（175 aa）
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未记录 | A1CA9 N-(1,3-thiazol-2-yl)quinoxaline-6-carboxamide × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；291 K；10-15% PEG 3350, 0.1 M Bis-TRIS pH 6.5
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.295 |
| 9OLB Identification of ligands for E3 ligases using fragment-based methods 提交 2025-05-12 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
292–466（175 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；10-15% PEG 3350, 0.1 M Bis-TRIS pH 6.5
|
分辨率 2.62 Å R-free 0.276 |
| 9OLB Identification of ligands for E3 ligases using fragment-based methods 提交 2025-05-12 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
292–466（175 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；10-15% PEG 3350, 0.1 M Bis-TRIS pH 6.5
|
分辨率 2.62 Å R-free 0.276 |
| 9OLB Identification of ligands for E3 ligases using fragment-based methods 提交 2025-05-12 | Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 C
292–466（175 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；10-15% PEG 3350, 0.1 M Bis-TRIS pH 6.5
|
分辨率 2.62 Å R-free 0.276 |