当前蛋白身份:Q9BYB0 重新检索
本组结构的主要差异维度
构建体不同 组装状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量指标不同

差异标签只比较当前检索结果;所有PDB和assembly原始记录仍分别保留。

相关结构差异明细

一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。

PDB 条目 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法 实验环境 结构质量
6CPK Solution structure of SH3 domain from Shank3 提交 2018-03-13 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 352–411(60 aa)
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 6.8;298 K;离子强度(mmCIF原始值)100;压力 1
NMR样品组成 1 mM [U-99% 13C; U-99% 15N] Shank3 SH3, 20 mM Bis-Tris, 100 mM KCl, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 1 mM [U-99% 13C; U-99% 15N] Shank3 SH3, 20 mM Bis-Tris, 100 mM KCl, 100% D2O | 100% D2O
NMR样品组成 1 mM [U-99% 15N] Shank3 SH3, 20 mM Bis-Tris, 100 mM KCl, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 1 mM Shank3 SH3, 20 mM Bis-Tris, 100 mM KCl, 100% D2O | 100% D2O
分辨率未提供
7C7I Crystal structure of SHANK3 SPN domain in complex with GTP-bound Rap1b(E30D,K31E) 提交 2020-05-25 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致
链 C 1–99(99 aa)
链 D 1–99(99 aa)
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 CA CALCIUM ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;289 K;14.4% (w/v) PEG 8000, Sodium cacodylate/Hydrochloric acid (pH 6.5), 160 mM Calcium acetate, 20% (v/v) Glycerol
分辨率 2.28 Å R-free 0.246
7C7J Crystal structure of SHANK3 SPN domain in complex with GTP-bound Rap1b(G12V,Q63E) 提交 2020-05-25 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 C 1–99(99 aa)
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 CA CALCIUM ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;289 K;10% (w/v) PEG 8000, 100 mM Imidazole/Hydrochloric acid (pH 8.0), 200 mM Calcium acetate
分辨率 2.39 Å R-free 0.255
7C7J Crystal structure of SHANK3 SPN domain in complex with GTP-bound Rap1b(G12V,Q63E) 提交 2020-05-25 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 D 1–99(99 aa)
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;289 K;10% (w/v) PEG 8000, 100 mM Imidazole/Hydrochloric acid (pH 8.0), 200 mM Calcium acetate
分辨率 2.39 Å R-free 0.255