当前蛋白身份:Q9BZ29 重新检索
本组结构的主要差异维度
构建体不同 突变/修饰不同 组装状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量指标不同

差异标签只比较当前检索结果;所有PDB和assembly原始记录仍分别保留。

相关结构差异明细

一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。

PDB 条目 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法 实验环境 结构质量
1WG7 Solution structure of pleckstrin homology domain from human KIAA1058 protein 提交 2004-05-27 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 165–301(137 aa) 片段:PH domain
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 6;298 K;离子强度(mmCIF原始值)100mM NaCl;压力 ambient
NMR样品组成 0.69mM 13C, 15N-labeled protein; 20mM phosphate buffer; 100mM NaCl; 1mM d10-DTT; 0.02% NaN3 | 90% H2O/10% D2O
分辨率未提供
2WM9 Structure of the complex between DOCK9 and Cdc42. 提交 2009-06-30 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致
链 A 1605–1652(48 aa) 片段:DHR2 DOMAIN, RESIDUES 1605-1652,1676-2053
链 A 1676–2053(378 aa) 片段:DHR2 DOMAIN, RESIDUES 1605-1652,1676-2053
未记录 GOL GLYCEROL × 6 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6;293 K;THE PROTEIN WAS CONCENTRATED TO 6 MG/ML. CRYSTALS WERE GROWN USING HANGING DROP VAPOUR DIFFUSION. 1 UL OF COMPLEX WITH 200 MM NDSB-201 ADDED TO PROTEIN PRIOR TO CRYSTALLIZATION WAS MIXED WITH EQUAL VOLUME OF CRYSTALLIZATION BUFFER: 14% (W/V) PEG3350,100 MM MES (PH 6.0), 200 MM AMMONIUM ACETATE, 12% GLYCEROL. CRYSTALS WERE GROWN AT 20C.
分辨率 2.20 Å R-free 0.251
2WMN Structure of the complex between DOCK9 and Cdc42-GDP. 提交 2009-07-02 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致
链 A 1605–1652(48 aa) 片段:DHR2 DOMAIN, RESIDUES 1605-1652,1676-2053
链 A 1676–2053(378 aa) 片段:DHR2 DOMAIN, RESIDUES 1605-1652,1676-2053
未记录 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 6;pH 6.0
分辨率 2.39 Å R-free 0.276
2WMO Structure of the complex between DOCK9 and Cdc42. 提交 2009-07-02 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致
链 A 1605–1652(48 aa) 片段:DHR2 DOMAIN, RESIDUES 1605-1652,1676-2053
链 A 1676–2053(378 aa) 片段:DHR2 DOMAIN, RESIDUES 1605-1652,1676-2053
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 6;pH 6.0
分辨率 2.20 Å R-free 0.272