当前蛋白身份：Q9C0D3
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 7EP0 Crystal structure of ZYG11B bound to GSTE degron 提交 2021-04-26 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
480–728（249 aa）
链 B
480–728（249 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | CGO sodium 3,3'-(1E,1'E)-biphenyl-4,4'-diylbis(diazene-2,1-diyl)bis(4-aminonaphthalene-1-sulfonate) × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；0.1 M MES pH 6.5, 14.4% (wt/vol) Polyethylene glycol 20,000, 0.033% (wt/vol) Anthrone, 0.033% (wt/vol) Congo Red, 0.033% (wt/vol) N-(2-Acetamido)-2-aminoethanesulfonic acid, 0.002 M HEPES sodium pH 6.8
|
分辨率 2.16 Å R-free 0.222 |
| 7EP1 Crystal structure of ZYG11B bound to GFLH degron 提交 2021-04-26 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
485–728（244 aa）
链 B
485–728（244 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；0.1 M MES pH 6.5, 14.4% (wt/vol) Polyethylene glycol 20,000
|
分辨率 1.85 Å R-free 0.227 |
| 7EP2 Crystal structure of ZYG11B bound to GGFN degron 提交 2021-04-26 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
443–728（286 aa）
链 B
443–728（286 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；0.2 M Ammonium Sulfate, 0.1 M HEPES pH 7.5, 25% (wt/vol) Polyethylene glycol 3,350
|
分辨率 2.38 Å R-free 0.254 |
| 7EP2 Crystal structure of ZYG11B bound to GGFN degron 提交 2021-04-26 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 C
443–728（286 aa）
链 D
443–728（286 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；0.2 M Ammonium Sulfate, 0.1 M HEPES pH 7.5, 25% (wt/vol) Polyethylene glycol 3,350
|
分辨率 2.38 Å R-free 0.254 |
| 7XV7 Crystal structure of ZYG11B bound to ORF10 peptide 提交 2022-05-21 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
485–728（244 aa）
链 B
485–728（244 aa）
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.1 M MES pH 6.5, 1.6 M MgSO4.
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.269 |
| 7XYV Crystal structure of ZYG11B bound to SFLH degron 提交 2022-06-02 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
485–728（244 aa）
链 B
485–728（244 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；0.1 M MES (pH 6.5), 1.6 M MgSO4
|
分辨率 2.52 Å R-free 0.274 |
| 7XYW Crystal structure of ZYG11B bound to AFLH degron 提交 2022-06-02 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
485–728（244 aa）
链 B
485–728（244 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.1 M MES (pH 6.5), 1.6 M MgSO4
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.275 |
| 7XYX Crystal structure of ZYG11B bound to CFLH degron 提交 2022-06-02 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
485–728（244 aa）
链 B
485–728（244 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；0.1 M MES (pH 6.5), 1.6 M MgSO4
|
分辨率 2.87 Å R-free 0.264 |
| 7YC2 Crystal structure of auxiliary protein in complex with human protein 提交 2022-06-30 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
490–728（239 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.2；296 K；1.4 M Sodium phosphate monobasic monohydrate/Potassium phosphate dibasic
|
分辨率 2.90 Å R-free 0.262 |
| 7YC2 Crystal structure of auxiliary protein in complex with human protein 提交 2022-06-30 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
490–728（239 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.2；296 K；1.4 M Sodium phosphate monobasic monohydrate/Potassium phosphate dibasic
|
分辨率 2.90 Å R-free 0.262 |
| 7YC2 Crystal structure of auxiliary protein in complex with human protein 提交 2022-06-30 | Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 C
490–728（239 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.2；296 K；1.4 M Sodium phosphate monobasic monohydrate/Potassium phosphate dibasic
|
分辨率 2.90 Å R-free 0.262 |
| 7YC2 Crystal structure of auxiliary protein in complex with human protein 提交 2022-06-30 | Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 D
490–728（239 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.2；296 K；1.4 M Sodium phosphate monobasic monohydrate/Potassium phosphate dibasic
|
分辨率 2.90 Å R-free 0.262 |
| 9BID human ZYG11B and EloginB/C complex 提交 2024-04-23 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
2–744（743 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.99 Å |
| 9BIE human ZYG11B ElonginB/C complex binding to SARS-CoV2 Orf10 protein 提交 2024-04-23 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
2–744（743 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.40 Å |
| 9BJ8 human CRL2-ZYG11B complex 提交 2024-04-25 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 A
2–744（743 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 3 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.78 Å |
| 9BJ9 Human CRL-2 ZYG11B binding to human NLRP1 Gly/N degron 提交 2024-04-25 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 A
2–744（743 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 3 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.20 Å |
| 9LK2 monomeric ZYG11B-EloB-EloC + substrate peptide GYIND 提交 2025-01-15 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
1–744（744 aa）
|
突变：F821L/S822T/Q837R/F856S/M910T/V920A | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.37 Å |
| 9LK6 dimeric ZYG11B-EloB-EloC + substrate peptide GYIND 提交 2025-01-16 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8） 与蛋白数一致 |
链 A
1–744（744 aa）
链 D
1–744（744 aa）
|
突变：F821L/S822T/Q837R/F856S/M910T/V920A 突变：F821L/S822T/Q837R/F856S/M910T/V920A | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.27 Å |