当前蛋白身份:Q9DCD6 重新检索
本组结构的主要差异维度
配体/离子不同 实验环境不同 结构质量指标不同

差异标签只比较当前检索结果;所有PDB和assembly原始记录仍分别保留。

相关结构差异明细

一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。

PDB 条目 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法 实验环境 结构质量
5YIR Crystal Structure of AnkB LIR/GABARAP complex 提交 2017-10-06 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 D 1–117(117 aa)
未记录 NI NICKEL (II) ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION;pH 7.5;289 K;12% w/v PEG 3350, 5 mM CoCl2, 5 mM NiCl2, 5 mM CdCl2, 5 mM MgCl2, 0.1 M HEPES buffer (pH 7.5)
分辨率 2.75 Å R-free 0.224
5YIR Crystal Structure of AnkB LIR/GABARAP complex 提交 2017-10-06 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 1–117(117 aa)
未记录 NI NICKEL (II) ION × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION;pH 7.5;289 K;12% w/v PEG 3350, 5 mM CoCl2, 5 mM NiCl2, 5 mM CdCl2, 5 mM MgCl2, 0.1 M HEPES buffer (pH 7.5)
分辨率 2.75 Å R-free 0.224
5YIR Crystal Structure of AnkB LIR/GABARAP complex 提交 2017-10-06 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 B 1–117(117 aa)
未记录 NI NICKEL (II) ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION;pH 7.5;289 K;12% w/v PEG 3350, 5 mM CoCl2, 5 mM NiCl2, 5 mM CdCl2, 5 mM MgCl2, 0.1 M HEPES buffer (pH 7.5)
分辨率 2.75 Å R-free 0.224
6A9X Crystal Structure of AnkG/GABARAP Complex 提交 2018-07-16 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 D 1–117(117 aa)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION;pH 7;289 K;2.0 M ammonium citrate tribasic, 0.1 M BIS-TRIS propane buffer
分辨率 2.20 Å R-free 0.249
7FB5 Crystal structure of FAM134B/GABARAP complex 提交 2021-07-08 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 1–117(117 aa)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8;289 K;containing 0.1 M bis-tris propane pH 8.0, 2.2 M DL-Malic acid
分辨率 2.84 Å R-free 0.244