当前蛋白身份:Q9DCD6
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 5YIR Crystal Structure of AnkB LIR/GABARAP complex 提交 2017-10-06 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 D
1–117(117 aa)
|
未记录 | NI NICKEL (II) ION × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION;pH 7.5;289 K;12% w/v PEG 3350, 5 mM CoCl2, 5 mM NiCl2, 5 mM CdCl2, 5 mM MgCl2, 0.1 M HEPES buffer (pH 7.5)
|
分辨率 2.75 Å R-free 0.224 |
| 5YIR Crystal Structure of AnkB LIR/GABARAP complex 提交 2017-10-06 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 A
1–117(117 aa)
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未记录 | NI NICKEL (II) ION × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION;pH 7.5;289 K;12% w/v PEG 3350, 5 mM CoCl2, 5 mM NiCl2, 5 mM CdCl2, 5 mM MgCl2, 0.1 M HEPES buffer (pH 7.5)
|
分辨率 2.75 Å R-free 0.224 |
| 5YIR Crystal Structure of AnkB LIR/GABARAP complex 提交 2017-10-06 | Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 B
1–117(117 aa)
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未记录 | NI NICKEL (II) ION × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION;pH 7.5;289 K;12% w/v PEG 3350, 5 mM CoCl2, 5 mM NiCl2, 5 mM CdCl2, 5 mM MgCl2, 0.1 M HEPES buffer (pH 7.5)
|
分辨率 2.75 Å R-free 0.224 |
| 6A9X Crystal Structure of AnkG/GABARAP Complex 提交 2018-07-16 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 D
1–117(117 aa)
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION;pH 7;289 K;2.0 M ammonium citrate tribasic, 0.1 M BIS-TRIS propane buffer
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分辨率 2.20 Å R-free 0.249 |
| 7FB5 Crystal structure of FAM134B/GABARAP complex 提交 2021-07-08 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 A
1–117(117 aa)
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8;289 K;containing 0.1 M bis-tris propane pH 8.0, 2.2 M DL-Malic acid
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分辨率 2.84 Å R-free 0.244 |