当前蛋白身份:Q9ESU6
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2DWW Crystal structure of Bromodomain-containing protein 4 提交 2006-08-21 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 A
347–460(114 aa)
片段:bromodomain, BD2
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | CL CHLORIDE ION × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION;pH 8;293 K;NACL, PH 8.0, VAPOR DIFFUSION, TEMPERATURE 293K
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.245 |
| 2JNS Solution structure of the Bromodomain-containing protein 4 ET domain 提交 2007-02-01 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致 |
链 A
601–683(83 aa)
片段:database sequence residues 601-683
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未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 7;298 K;离子强度(mmCIF原始值)100;压力 AMBIENT
NMR样品组成
1.05 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] Brd4-ET domain, 100 mM sodium chloride, 20 mM [U-2H] TRIS, 1 mM [U-2H] DTT, 0.02 % sodium azide, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
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分辨率未提供 |
| 3JVJ Crystal structure of the bromodomain 1 in mouse Brd4 提交 2009-09-17 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致 |
链 A
42–168(127 aa)
片段:bromodomain, UNP residues 42-168
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未记录 | GOL GLYCEROL × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8;293 K;3.6M Na formate, 10% glycerol, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 1.55 Å R-free 0.219 |
| 3JVK Crystal structure of bromodomain 1 of mouse Brd4 in complex with histone H3-K(ac)14 提交 2009-09-17 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 A
42–168(127 aa)
片段:bromodomain 1, UNP residues 42-168
|
未记录 | EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8;293 K;3.6M Na formate, 10% glycerol, soaked with 10-times excess of histone peptide, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.259 |
| 3JVL Crystal structure of bromodomain 2 of mouse Brd4 提交 2009-09-17 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致 |
链 A
349–464(116 aa)
片段:bromodomain 2, UNP residues 349-464
|
未记录 | EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3 BME BETA-MERCAPTOETHANOL × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8.5;293 K;0.1M Tris/HCl, 25% PEG 2000 MME, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 1.20 Å R-free 0.145 |
| 3JVM Crystal structure of bromodomain 2 of mouse Brd4 提交 2009-09-17 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致 |
链 A
349–464(116 aa)
片段:bromodomain 2, UNP residues 349-464
|
未记录 | BME BETA-MERCAPTOETHANOL × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8.5;293 K;0.1M Tris/HCl, 25% PEG 2000 MME, soaked with 10 mM H3-K(ac)14 octapeptide GGK(ac)APRKQ, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
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分辨率 1.20 Å R-free 0.151 |
| 3MUK Crystal structure of Brd4 bromodomain 1 with propionylated histone H3-K(prop)23 提交 2010-05-03 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 A
42–168(127 aa)
片段:bromodomain, UNP residues 42-168
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未记录 | EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8;293 K;3.6M Na formate, 10% glycerol, soaked with 20-times excess of histone octapeptide, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
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分辨率 1.75 Å R-free 0.219 |
| 3MUL Crystal structure of Brd4 bromodomain 1 with butyrylated histone H3-K(buty)14 提交 2010-05-03 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 A
42–168(127 aa)
片段:bromodomain, UNP residues 42-168
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未记录 | EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8;293 K;3.6M Na formate, 10% glycerol, soaked with 20-times excess of histone octapeptide, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
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分辨率 1.65 Å R-free 0.226 |