当前蛋白身份:Q9ESU6 重新检索
本组结构的主要差异维度
构建体不同 突变/修饰不同 组装状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量指标不同

差异标签只比较当前检索结果;所有PDB和assembly原始记录仍分别保留。

相关结构差异明细

一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。

PDB 条目 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法 实验环境 结构质量
2DWW Crystal structure of Bromodomain-containing protein 4 提交 2006-08-21 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 347–460(114 aa) 片段:bromodomain, BD2
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) CL CHLORIDE ION × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION;pH 8;293 K;NACL, PH 8.0, VAPOR DIFFUSION, TEMPERATURE 293K
分辨率 1.80 Å R-free 0.245
2JNS Solution structure of the Bromodomain-containing protein 4 ET domain 提交 2007-02-01 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 601–683(83 aa) 片段:database sequence residues 601-683
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 7;298 K;离子强度(mmCIF原始值)100;压力 AMBIENT
NMR样品组成 1.05 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] Brd4-ET domain, 100 mM sodium chloride, 20 mM [U-2H] TRIS, 1 mM [U-2H] DTT, 0.02 % sodium azide, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
分辨率未提供
3JVJ Crystal structure of the bromodomain 1 in mouse Brd4 提交 2009-09-17 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 42–168(127 aa) 片段:bromodomain, UNP residues 42-168
未记录 GOL GLYCEROL × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8;293 K;3.6M Na formate, 10% glycerol, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 1.55 Å R-free 0.219
3JVK Crystal structure of bromodomain 1 of mouse Brd4 in complex with histone H3-K(ac)14 提交 2009-09-17 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 42–168(127 aa) 片段:bromodomain 1, UNP residues 42-168
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8;293 K;3.6M Na formate, 10% glycerol, soaked with 10-times excess of histone peptide, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 1.80 Å R-free 0.259
3JVL Crystal structure of bromodomain 2 of mouse Brd4 提交 2009-09-17 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 349–464(116 aa) 片段:bromodomain 2, UNP residues 349-464
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3 BME BETA-MERCAPTOETHANOL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8.5;293 K;0.1M Tris/HCl, 25% PEG 2000 MME, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 1.20 Å R-free 0.145
3JVM Crystal structure of bromodomain 2 of mouse Brd4 提交 2009-09-17 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 349–464(116 aa) 片段:bromodomain 2, UNP residues 349-464
未记录 BME BETA-MERCAPTOETHANOL × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8.5;293 K;0.1M Tris/HCl, 25% PEG 2000 MME, soaked with 10 mM H3-K(ac)14 octapeptide GGK(ac)APRKQ, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 1.20 Å R-free 0.151
3MUK Crystal structure of Brd4 bromodomain 1 with propionylated histone H3-K(prop)23 提交 2010-05-03 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 42–168(127 aa) 片段:bromodomain, UNP residues 42-168
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8;293 K;3.6M Na formate, 10% glycerol, soaked with 20-times excess of histone octapeptide, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 1.75 Å R-free 0.219
3MUL Crystal structure of Brd4 bromodomain 1 with butyrylated histone H3-K(buty)14 提交 2010-05-03 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 42–168(127 aa) 片段:bromodomain, UNP residues 42-168
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8;293 K;3.6M Na formate, 10% glycerol, soaked with 20-times excess of histone octapeptide, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 1.65 Å R-free 0.226