当前蛋白身份:Q9H0H5
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2OVJ The crystal structure of the human Rac GTPase activating protein 1 (RACGAP1) MgcRacGAP. 提交 2007-02-14 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致 |
链 A
348–546(199 aa)
片段:Rho-GAP domain
|
未记录 | 7PE 2-(2-(2-(2-(2-(2-ETHOXYETHOXY)ETHOXY)ETHOXY)ETHOXY)ETHOXY)ETHANOL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 5.5;298 K;25% PEG 3350, 0.1M BIS-TRIS, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
|
分辨率 1.49 Å R-free 0.176 |
| 3W6R Crystal structure of the GAP domain of human MgcRacGAP 提交 2013-02-21 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致 |
链 A
348–546(199 aa)
片段:Rho-GAP domain, UNP RESIDUES 348-546
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 5.7;295 K;100mM sodium cacodylate buffer, 13% polyethylene glycol 6000, 25% glycerol, pH 5.7, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.259 |
| 3WPQ crystal structure of the GAP domain of MgcRacGAP(S387A) 提交 2014-01-15 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致 |
链 A
346–546(201 aa)
片段:UNP residues 346-546
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突变:S387A | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;1.0M Na Citrate, 0.1M Hepes, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
|
分辨率 1.84 Å R-free 0.200 |
| 3WPQ crystal structure of the GAP domain of MgcRacGAP(S387A) 提交 2014-01-15 | Assembly 2 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致 |
链 B
346–546(201 aa)
片段:UNP residues 346-546
|
突变:S387A | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;1.0M Na Citrate, 0.1M Hepes, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
|
分辨率 1.84 Å R-free 0.200 |
| 3WPS crystal structure of the GAP domain of MgcRacGAP(S387D) 提交 2014-01-15 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 A
346–546(201 aa)
片段:UNP residues 346-546
链 B
346–546(201 aa)
片段:UNP residues 346-546
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突变:S387D 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 突变:S387D 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | SO4 SULFATE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293 K;2.0M magnesium sulfate, 0.1M MES, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
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分辨率 2.70 Å R-free 0.259 |
| 4B6D Structure of the atypical C1 domain of MgcRacGAP 提交 2012-08-09 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致 |
链 A
284–339(56 aa)
片段:C1 DOMAIN, RESIDUES 284-339
|
未记录 | GOL GLYCEROL × 1 ZN ZINC ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 7.1;1.3 M SODIUM CITRATE, PH 7.1 AND 0.3 M DIMETHYLETHYLAMMONIUM PROPANE SULFONATE
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.235 |
| 4B6D Structure of the atypical C1 domain of MgcRacGAP 提交 2012-08-09 | Assembly 2 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致 |
链 B
284–339(56 aa)
片段:C1 DOMAIN, RESIDUES 284-339
|
未记录 | ZN ZINC ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 7.1;1.3 M SODIUM CITRATE, PH 7.1 AND 0.3 M DIMETHYLETHYLAMMONIUM PROPANE SULFONATE
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.235 |
| 4B6D Structure of the atypical C1 domain of MgcRacGAP 提交 2012-08-09 | Assembly 3 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致 |
链 C
284–339(56 aa)
片段:C1 DOMAIN, RESIDUES 284-339
|
未记录 | ZN ZINC ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 7.1;1.3 M SODIUM CITRATE, PH 7.1 AND 0.3 M DIMETHYLETHYLAMMONIUM PROPANE SULFONATE
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.235 |
| 4B6D Structure of the atypical C1 domain of MgcRacGAP 提交 2012-08-09 | Assembly 4 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致 |
链 D
284–339(56 aa)
片段:C1 DOMAIN, RESIDUES 284-339
|
未记录 | ZN ZINC ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 7.1;1.3 M SODIUM CITRATE, PH 7.1 AND 0.3 M DIMETHYLETHYLAMMONIUM PROPANE SULFONATE
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.235 |
| 4B6D Structure of the atypical C1 domain of MgcRacGAP 提交 2012-08-09 | Assembly 5 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致 |
链 E
284–339(56 aa)
片段:C1 DOMAIN, RESIDUES 284-339
|
未记录 | ZN ZINC ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 7.1;1.3 M SODIUM CITRATE, PH 7.1 AND 0.3 M DIMETHYLETHYLAMMONIUM PROPANE SULFONATE
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.235 |
| 4B6D Structure of the atypical C1 domain of MgcRacGAP 提交 2012-08-09 | Assembly 6 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致 |
链 F
284–339(56 aa)
片段:C1 DOMAIN, RESIDUES 284-339
|
未记录 | ZN ZINC ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 7.1;1.3 M SODIUM CITRATE, PH 7.1 AND 0.3 M DIMETHYLETHYLAMMONIUM PROPANE SULFONATE
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.235 |
| 5C2J Complex structure of the GAP domain of MgcRacGAP and Cdc42 提交 2015-06-16 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 A
346–546(201 aa)
片段:GAP domain, UNP residues 346-546
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未记录 | MG MAGNESIUM ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 AF3 ALUMINUM FLUORIDE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 5.5;293 K;PEG3350, Bis-Tris
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分辨率 2.50 Å R-free 0.263 |
| 5C2K Crystal structure of the fusion protein linked by RhoA and the GAP domain of MgcRacGAP 提交 2015-06-16 | Assembly 1 信息不足 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致 |
链 A
346–546(201 aa)
片段:GAP domain, UNP residues 346-546
|
突变:S249D | MG MAGNESIUM ION × 1 AF3 ALUMINUM FLUORIDE × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 5.5;293 K;PEG3350, Bis-Tris
|
分辨率 1.42 Å R-free 0.206 |