当前蛋白身份:Q9H0H5 重新检索
本组结构的主要差异维度
构建体不同 突变/修饰不同 组装状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量指标不同

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相关结构差异明细

一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。

PDB 条目 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法 实验环境 结构质量
2OVJ The crystal structure of the human Rac GTPase activating protein 1 (RACGAP1) MgcRacGAP. 提交 2007-02-14 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 348–546(199 aa) 片段:Rho-GAP domain
未记录 7PE 2-(2-(2-(2-(2-(2-ETHOXYETHOXY)ETHOXY)ETHOXY)ETHOXY)ETHOXY)ETHANOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 5.5;298 K;25% PEG 3350, 0.1M BIS-TRIS, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
分辨率 1.49 Å R-free 0.176
3W6R Crystal structure of the GAP domain of human MgcRacGAP 提交 2013-02-21 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 348–546(199 aa) 片段:Rho-GAP domain, UNP RESIDUES 348-546
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 5.7;295 K;100mM sodium cacodylate buffer, 13% polyethylene glycol 6000, 25% glycerol, pH 5.7, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K
分辨率 1.90 Å R-free 0.259
3WPQ crystal structure of the GAP domain of MgcRacGAP(S387A) 提交 2014-01-15 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 346–546(201 aa) 片段:UNP residues 346-546
突变:S387A 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;1.0M Na Citrate, 0.1M Hepes, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
分辨率 1.84 Å R-free 0.200
3WPQ crystal structure of the GAP domain of MgcRacGAP(S387A) 提交 2014-01-15 Assembly 2 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 B 346–546(201 aa) 片段:UNP residues 346-546
突变:S387A 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;1.0M Na Citrate, 0.1M Hepes, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
分辨率 1.84 Å R-free 0.200
3WPS crystal structure of the GAP domain of MgcRacGAP(S387D) 提交 2014-01-15 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 346–546(201 aa) 片段:UNP residues 346-546
链 B 346–546(201 aa) 片段:UNP residues 346-546
突变:S387D 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 突变:S387D 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) SO4 SULFATE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293 K;2.0M magnesium sulfate, 0.1M MES, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
分辨率 2.70 Å R-free 0.259
4B6D Structure of the atypical C1 domain of MgcRacGAP 提交 2012-08-09 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 284–339(56 aa) 片段:C1 DOMAIN, RESIDUES 284-339
未记录 GOL GLYCEROL × 1 ZN ZINC ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7.1;1.3 M SODIUM CITRATE, PH 7.1 AND 0.3 M DIMETHYLETHYLAMMONIUM PROPANE SULFONATE
分辨率 2.20 Å R-free 0.235
4B6D Structure of the atypical C1 domain of MgcRacGAP 提交 2012-08-09 Assembly 2 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 B 284–339(56 aa) 片段:C1 DOMAIN, RESIDUES 284-339
未记录 ZN ZINC ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7.1;1.3 M SODIUM CITRATE, PH 7.1 AND 0.3 M DIMETHYLETHYLAMMONIUM PROPANE SULFONATE
分辨率 2.20 Å R-free 0.235
4B6D Structure of the atypical C1 domain of MgcRacGAP 提交 2012-08-09 Assembly 3 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 C 284–339(56 aa) 片段:C1 DOMAIN, RESIDUES 284-339
未记录 ZN ZINC ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7.1;1.3 M SODIUM CITRATE, PH 7.1 AND 0.3 M DIMETHYLETHYLAMMONIUM PROPANE SULFONATE
分辨率 2.20 Å R-free 0.235
4B6D Structure of the atypical C1 domain of MgcRacGAP 提交 2012-08-09 Assembly 4 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 D 284–339(56 aa) 片段:C1 DOMAIN, RESIDUES 284-339
未记录 ZN ZINC ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7.1;1.3 M SODIUM CITRATE, PH 7.1 AND 0.3 M DIMETHYLETHYLAMMONIUM PROPANE SULFONATE
分辨率 2.20 Å R-free 0.235
4B6D Structure of the atypical C1 domain of MgcRacGAP 提交 2012-08-09 Assembly 5 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 E 284–339(56 aa) 片段:C1 DOMAIN, RESIDUES 284-339
未记录 ZN ZINC ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7.1;1.3 M SODIUM CITRATE, PH 7.1 AND 0.3 M DIMETHYLETHYLAMMONIUM PROPANE SULFONATE
分辨率 2.20 Å R-free 0.235
4B6D Structure of the atypical C1 domain of MgcRacGAP 提交 2012-08-09 Assembly 6 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 F 284–339(56 aa) 片段:C1 DOMAIN, RESIDUES 284-339
未记录 ZN ZINC ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7.1;1.3 M SODIUM CITRATE, PH 7.1 AND 0.3 M DIMETHYLETHYLAMMONIUM PROPANE SULFONATE
分辨率 2.20 Å R-free 0.235
5C2J Complex structure of the GAP domain of MgcRacGAP and Cdc42 提交 2015-06-16 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 346–546(201 aa) 片段:GAP domain, UNP residues 346-546
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 AF3 ALUMINUM FLUORIDE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 5.5;293 K;PEG3350, Bis-Tris
分辨率 2.50 Å R-free 0.263
5C2K Crystal structure of the fusion protein linked by RhoA and the GAP domain of MgcRacGAP 提交 2015-06-16 Assembly 1 信息不足 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 346–546(201 aa) 片段:GAP domain, UNP residues 346-546
突变:S249D MG MAGNESIUM ION × 1 AF3 ALUMINUM FLUORIDE × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 5.5;293 K;PEG3350, Bis-Tris
分辨率 1.42 Å R-free 0.206