当前蛋白身份：Q9H2K0
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 6NEQ Structure of human mitochondrial translation initiation factor 3 bound to the small ribosomal subunit-Class-II 提交 2018-12-18 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：32-meric（32） 与全部聚合物一致 |
链 z
32–278（247 aa）
片段：residues 32-278
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.32 Å |
| 6NF8 Structure of human mitochondrial translation initiation factor 3 bound to the small ribosomal subunit -Class I 提交 2018-12-19 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：32-meric（32） 与全部聚合物一致 |
链 z
32–278（247 aa）
片段：residues 32-278
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.48 Å |
| 6RW4 Structure of human mitochondrial 28S ribosome in complex with mitochondrial IF3 提交 2019-06-03 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：32-meric（32） 与全部聚合物一致 |
链 8
1–278（278 aa）
|
未记录 | NAD NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE × 1 SPM SPERMINE × 1 SRY STREPTOMYCIN × 1 MG MAGNESIUM ION × 60 K POTASSIUM ION × 17 ZN ZINC ION × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.97 Å |
| 6RW5 Structure of human mitochondrial 28S ribosome in complex with mitochondrial IF2 and IF3 提交 2019-06-03 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 32 PDB 声明：33-meric（33） 与全部聚合物一致 |
链 8
1–278（278 aa）
|
未记录 | NAD NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE × 1 SPM SPERMINE × 1 SRY STREPTOMYCIN × 1 MG MAGNESIUM ION × 61 K POTASSIUM ION × 17 ZN ZINC ION × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.14 Å |
| 7P2E Human mitochondrial ribosome small subunit in complex with IF3, GMPPMP and streptomycin 提交 2021-07-05 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：32-meric（32） 与全部聚合物一致 |
链 8
1–278（278 aa）
|
未记录 | NAD NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE × 1 SPM SPERMINE × 1 5I0 [(2~{S},3~{S},4~{S},5~{R},6~{S})-2-[(2~{R},3~{R},4~{R},5~{S})-2-[(1~{R},2~{S},3~{R},4~{R},5~{S},6~{R})-2,4-bis[[azaniumylidene(azanyl)methyl]amino]-3,5,6-tris(oxidanyl)cyclohexyl]oxy-4-[bis(oxidanyl)methyl]-5-methyl-4-oxidanyl-oxolan-3-yl]oxy-6-(hydroxymethyl)-4,5-bis(oxidanyl)oxan-3-yl]-methyl-azanium × 1 K POTASSIUM ION × 21 MG MAGNESIUM ION × 62 ZN ZINC ION × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.40 Å |
| 8QRM mt-SSU assembly intermediate in GTPBP8 knock-out cells, state 3 提交 2023-10-09 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：32-meric（32） 与全部聚合物一致 |
链 8
1–278（278 aa）
|
未记录 | NAD NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE × 1 SPM SPERMINE × 1 SRY STREPTOMYCIN × 1 MG MAGNESIUM ION × 59 K POTASSIUM ION × 17 ZN ZINC ION × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.05 Å |
| 9HFM Translation-initiation state of human mitochondrial ribosome small subunit (State D) 提交 2024-11-18 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：32-meric（32） 与全部聚合物一致 |
链 8
1–278（278 aa）
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未记录 | MG MAGNESIUM ION × 44 K POTASSIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4；20mM HEPES-HCl, 100mM KCl, 20mM MgCl2, 0.02% DDM, 1mM PMSF, 1x protease-inhibitor mix, 0.5mM GMP-PNP
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.00 Å |
| 9HFN Translation-initiation state of human mitochondrial ribosome small subunit (State E) 提交 2024-11-18 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 32 PDB 声明：33-meric（33） 与全部聚合物一致 |
链 8
1–278（278 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 45 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 K POTASSIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4；20mM HEPES-HCl, 100mM KCl, 20mM MgCl2, 0.02% DDM, 1mM PMSF, 1x protease-inhibitor mix, 0.5mM GMP-PNP
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.30 Å |