当前蛋白身份：Q9HAU5
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1UW4 The structural basis of the interaction between nonsense mediated decay factors UPF2 and UPF3 提交 2004-01-29 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
768–1015（248 aa）
片段：MIF4G DOMAIN, RESIDUES 768-1015
|
未记录 | BME BETA-MERCAPTOETHANOL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 6.5；100 MM AMMONIUM ACETATE, 15 MM MAGNESIUM ACETATE 50 MM SODIUM CACODYLATE 6.5, 8% ISOPROPANOL, pH 6.50
|
分辨率 1.95 Å R-free 0.227 |
| 1UW4 The structural basis of the interaction between nonsense mediated decay factors UPF2 and UPF3 提交 2004-01-29 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 D
768–1015（248 aa）
片段：MIF4G DOMAIN, RESIDUES 768-1015
|
未记录 | BME BETA-MERCAPTOETHANOL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 6.5；100 MM AMMONIUM ACETATE, 15 MM MAGNESIUM ACETATE 50 MM SODIUM CACODYLATE 6.5, 8% ISOPROPANOL, pH 6.50
|
分辨率 1.95 Å R-free 0.227 |
| 2WJV Crystal structure of the complex between human nonsense mediated decay factors UPF1 and UPF2 提交 2009-06-01 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 D
1105–1198（94 aa）
片段：C-TERMINAL REGION, RESIDUES 1105-1198
|
未记录 | ZN ZINC ION × 3 SO4 SULFATE ION × 13 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 6.5；1.5-1.6M AMMONIUM SULPHATE, 100 MM MES PH 6.3-6.5 AND 2% V/V GLYCEROL
|
分辨率 2.85 Å R-free 0.248 |
| 2WJV Crystal structure of the complex between human nonsense mediated decay factors UPF1 and UPF2 提交 2009-06-01 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 E
1105–1198（94 aa）
片段：C-TERMINAL REGION, RESIDUES 1105-1198
|
未记录 | ZN ZINC ION × 3 SO4 SULFATE ION × 10 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 6.5；1.5-1.6M AMMONIUM SULPHATE, 100 MM MES PH 6.3-6.5 AND 2% V/V GLYCEROL
|
分辨率 2.85 Å R-free 0.248 |
| 4CEK Crystal structure of the second MIF4G domain of human nonsense mediated decay factor UPF2 提交 2013-11-11 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
455–757（303 aa）
片段：MIF4G2, RESIDUES 455-757
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 6；100 MM MES PH 6.0, 19% PEG 3350 AND AT A PROTEIN CONCENTRATION OF 8 MG/ML
|
分辨率 2.35 Å R-free 0.251 |
| 4CEM Crystal structure of the first MIF4G domain of human nonsense mediated decay factor UPF2 提交 2013-11-11 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
121–486（366 aa）
片段：MIF4G1, RESIDUES 121-486
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 9；100 MM BICINE PH 9, 100 MM NACL, 11% PEG 6000 AND AT A PROTEIN CONCENTRATION OF 16 MG/ML
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.251 |
| 4CEM Crystal structure of the first MIF4G domain of human nonsense mediated decay factor UPF2 提交 2013-11-11 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
121–486（366 aa）
片段：MIF4G1, RESIDUES 121-486
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 9；100 MM BICINE PH 9, 100 MM NACL, 11% PEG 6000 AND AT A PROTEIN CONCENTRATION OF 16 MG/ML
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.251 |
| 7NWU Co-crystal structure of UPF3B-RRM-NOPS-L with UPF2-MIF4GIII 提交 2021-03-17 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 B
767–1017（251 aa）
链 D
767–1017（251 aa）
|
未记录 | 1PE PENTAETHYLENE GLYCOL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；293.15 K；0.1M Ca acetate
0.1M MES
15% PEG 400 P 41 2 2
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.256 |
| 7NWU Co-crystal structure of UPF3B-RRM-NOPS-L with UPF2-MIF4GIII 提交 2021-03-17 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 F
767–1017（251 aa）
链 H
767–1017（251 aa）
|
未记录 | 1PE PENTAETHYLENE GLYCOL × 1 PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；293.15 K；0.1M Ca acetate
0.1M MES
15% PEG 400 P 41 2 2
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.256 |
| 7QG6 Co-crystal structure of UPF3A-RRM-NOPS-L with UPF2-MIF4GIII 提交 2021-12-07 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：dimeric（2） 待复核 |
链 B
761–1054（294 aa）
链 D
761–1054（294 aa）
链 F
761–1054（294 aa）
链 H
761–1054（294 aa）
|
未记录 | PGE TRIETHYLENE GLYCOL × 3 CL CHLORIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；293.15 K；0.1 M Sodium HEPES pH 7.0
10% w/v PEG 4000
10% v/v 2-Propanol
|
分辨率 2.95 Å R-free 0.263 |
| 7QG6 Co-crystal structure of UPF3A-RRM-NOPS-L with UPF2-MIF4GIII 提交 2021-12-07 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：dimeric（2） 待复核 |
链 B
761–1054（294 aa）
链 D
761–1054（294 aa）
链 F
761–1054（294 aa）
链 H
761–1054（294 aa）
|
未记录 | PGE TRIETHYLENE GLYCOL × 3 CL CHLORIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；293.15 K；0.1 M Sodium HEPES pH 7.0
10% w/v PEG 4000
10% v/v 2-Propanol
|
分辨率 2.95 Å R-free 0.263 |
| 7QG6 Co-crystal structure of UPF3A-RRM-NOPS-L with UPF2-MIF4GIII 提交 2021-12-07 | Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：dimeric（2） 待复核 |
链 B
761–1054（294 aa）
链 D
761–1054（294 aa）
链 F
761–1054（294 aa）
链 H
761–1054（294 aa）
|
未记录 | PGE TRIETHYLENE GLYCOL × 3 CL CHLORIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；293.15 K；0.1 M Sodium HEPES pH 7.0
10% w/v PEG 4000
10% v/v 2-Propanol
|
分辨率 2.95 Å R-free 0.263 |
| 7QG6 Co-crystal structure of UPF3A-RRM-NOPS-L with UPF2-MIF4GIII 提交 2021-12-07 | Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：dimeric（2） 待复核 |
链 B
761–1054（294 aa）
链 D
761–1054（294 aa）
链 F
761–1054（294 aa）
链 H
761–1054（294 aa）
|
未记录 | PGE TRIETHYLENE GLYCOL × 3 CL CHLORIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；293.15 K；0.1 M Sodium HEPES pH 7.0
10% w/v PEG 4000
10% v/v 2-Propanol
|
分辨率 2.95 Å R-free 0.263 |