当前蛋白身份：Q9HBA0
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 4DX1 Crystal structure of the human TRPV4 ankyrin repeat domain 提交 2012-02-27 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
149–397（249 aa）
片段：N-terminal domain (UNP residues 149-397)
|
未记录 | PO4 PHOSPHATE ION × 2 GOL GLYCEROL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；277 K；0.35M sodium potassium phosphate, 0.1M HEPES, 10% glycerol, pH 7.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 2.85 Å R-free 0.279 |
| 4DX1 Crystal structure of the human TRPV4 ankyrin repeat domain 提交 2012-02-27 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
149–397（249 aa）
片段：N-terminal domain (UNP residues 149-397)
|
未记录 | PO4 PHOSPHATE ION × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；277 K；0.35M sodium potassium phosphate, 0.1M HEPES, 10% glycerol, pH 7.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 2.85 Å R-free 0.279 |
| 4DX2 Crystal structure of the human TRPV4 ankyrin repeat domain 提交 2012-02-27 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
149–397（249 aa）
片段：N-terminal domain (UNP residues 149-397)
|
未记录 | BGC beta-D-glucopyranose × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；277 K；3.5% PEG4000, 0.1M HEPES, 10% glycerol, pH 7.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 2.95 Å R-free 0.220 |
| 4DX2 Crystal structure of the human TRPV4 ankyrin repeat domain 提交 2012-02-27 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
149–397（249 aa）
片段：N-terminal domain (UNP residues 149-397)
|
未记录 | GOL GLYCEROL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；277 K；3.5% PEG4000, 0.1M HEPES, 10% glycerol, pH 7.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 2.95 Å R-free 0.220 |
| 7AA5 Human TRPV4 structure in presence of 4a-PDD 提交 2020-09-03 | Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
148–787（640 aa）
链 B
148–787（640 aa）
链 C
148–787（640 aa）
链 D
148–787（640 aa）
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；blot for 3 seconds before plunging
|
分辨率 4.18 Å |
| 8FC7 Cryo-EM structure of the human TRPV4 - RhoA in complex with GSK2798745 提交 2022-12-01 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8） 与蛋白数一致 |
链 A
1–871（871 aa）
链 B
1–871（871 aa）
链 C
1–871（871 aa）
链 D
1–871（871 aa）
|
未记录 | XPW 1-({(5S,7S)-3-[5-(2-hydroxypropan-2-yl)pyrazin-2-yl]-7-methyl-2-oxo-1-oxa-3-azaspiro[4.5]decan-7-yl}methyl)-1H-benzimidazole-6-carbonitrile × 4 MG MAGNESIUM ION × 4 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 4 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.30 Å |
| 8FC8 Cryo-EM structure of the human TRPV4 in complex with GSK1016790A 提交 2022-12-01 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
1–871（871 aa）
链 B
1–871（871 aa）
链 C
1–871（871 aa）
链 D
1–871（871 aa）
|
未记录 | XQ3 N-[(2S)-1-{4-[N-(2,4-dichlorobenzene-1-sulfonyl)-L-seryl]piperazin-1-yl}-4-methyl-1-oxopentan-2-yl]-1-benzothiophene-2-carboxamide × 4 Y01 CHOLESTEROL HEMISUCCINATE × 4 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.47 Å |
| 8FC9 Cryo-EM structure of the human TRPV4 - RhoA, apo condition 提交 2022-12-01 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8） 与蛋白数一致 |
链 A
1–871（871 aa）
链 B
1–871（871 aa）
链 C
1–871（871 aa）
链 D
1–871（871 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 4 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 4 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.75 Å |
| 8FCA Cryo-EM structure of the human TRPV4 - RhoA in complex with 4alpha-Phorbol 12,13-didecanoate 提交 2022-12-01 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
1–871（871 aa）
链 B
1–871（871 aa）
链 C
1–871（871 aa）
链 D
1–871（871 aa）
|
未记录 | XS9 (1aR,1bS,4aS,7aS,7bS,8R,9R,9aS)-9a-(decanoyloxy)-4a,7b-dihydroxy-3-(hydroxymethyl)-1,1,6,8-tetramethyl-5-oxo-1a,1b,4,4a,5,7a,7b,8,9,9a-decahydro-1H-cyclopropa[3,4]benzo[1,2-e]azulen-9-yl decanoate × 4 Y01 CHOLESTEROL HEMISUCCINATE × 4 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.41 Å |
| 8FCB Cryo-EM structure of the human TRPV4 - RhoA in complex with GSK1016790A 提交 2022-12-01 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8） 与蛋白数一致 |
链 A
1–871（871 aa）
链 B
1–871（871 aa）
链 C
1–871（871 aa）
链 D
1–871（871 aa）
|
未记录 | XQ3 N-[(2S)-1-{4-[N-(2,4-dichlorobenzene-1-sulfonyl)-L-seryl]piperazin-1-yl}-4-methyl-1-oxopentan-2-yl]-1-benzothiophene-2-carboxamide × 4 Y01 CHOLESTEROL HEMISUCCINATE × 4 GSP 5'-GUANOSINE-DIPHOSPHATE-MONOTHIOPHOSPHATE × 4 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.52 Å |
| 8JU5 Structure of human TRPV4 with antagonist A1 提交 2023-06-24 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
1–871（871 aa）
链 B
1–871（871 aa）
链 C
1–871（871 aa）
链 D
1–871（871 aa）
|
未记录 | F3L 4-[(3~{S},4~{S})-4-(aminomethyl)-1-(5-chloranylpyridin-2-yl)sulfonyl-4-oxidanyl-pyrrolidin-3-yl]oxy-2-fluoranyl-benzenecarbonitrile × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.74 Å |
| 8JU6 Structure of human TRPV4 with antagonist GSK279 提交 2023-06-24 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
1–871（871 aa）
链 B
1–871（871 aa）
链 C
1–871（871 aa）
链 D
1–871（871 aa）
|
未记录 | XPW 1-({(5S,7S)-3-[5-(2-hydroxypropan-2-yl)pyrazin-2-yl]-7-methyl-2-oxo-1-oxa-3-azaspiro[4.5]decan-7-yl}methyl)-1H-benzimidazole-6-carbonitrile × 4 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.45 Å |
| 8JVI Structure of human TRPV4 with antagonist A2 提交 2023-06-28 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
1–871（871 aa）
链 B
1–871（871 aa）
链 C
1–871（871 aa）
链 D
1–871（871 aa）
|
未记录 | F9M [6-[[4-(2,4-dimethyl-1,3-thiazol-5-yl)-1,3-thiazol-2-yl]amino]pyridin-3-yl]-[(1~{S},5~{R})-3-[5-(trifluoromethyl)pyrimidin-2-yl]-3,8-diazabicyclo[3.2.1]octan-8-yl]methanone × 4 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.21 Å |
| 8JVJ Structure of human TRPV4 with antagonist A2 and RhoA 提交 2023-06-28 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8） 与蛋白数一致 |
链 A
1–871（871 aa）
链 B
1–871（871 aa）
链 C
1–871（871 aa）
链 D
1–871（871 aa）
|
未记录 | F9M [6-[[4-(2,4-dimethyl-1,3-thiazol-5-yl)-1,3-thiazol-2-yl]amino]pyridin-3-yl]-[(1~{S},5~{R})-3-[5-(trifluoromethyl)pyrimidin-2-yl]-3,8-diazabicyclo[3.2.1]octan-8-yl]methanone × 4 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.44 Å |
| 8T1B Cryo-EM structure of full-length human TRPV4 in apo state 提交 2023-06-02 | Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
1–871（871 aa）
链 B
1–871（871 aa）
链 C
1–871（871 aa）
链 D
1–871（871 aa）
|
未记录 | 9ZR [(2~{R})-2-[(~{Z})-hexadec-9-enoyl]oxy-3-[oxidanyl-[2-(trimethyl-$l^{4}-azanyl)ethoxy]phosphoryl]oxy-propyl] (~{Z})-docos-13-enoate × 40 YJ0 (2R)-2-{[(4-O-hexopyranosyl-beta-D-glucopyranosyl)oxy]methyl}-4-{[(25R)-5beta,14beta,17beta-spirostan-3beta-yl]oxy}butyl 4-O-alpha-D-glucopyranosyl-beta-D-glucopyranoside × 8 NA SODIUM ION × 4 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.00 Å |
| 8T1C Cryo-EM structure of human TRPV4 ankyrin repeat domain in complex with GTPase RhoA 提交 2023-06-02 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–871（871 aa）
|
未记录 | GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.49 Å |
| 8T1D Open-state cryo-EM structure of full-length human TRPV4 in complex with agonist 4a-PDD 提交 2023-06-02 | Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
1–871（871 aa）
链 B
1–871（871 aa）
链 C
1–871（871 aa）
链 D
1–871（871 aa）
|
未记录 | XS9 (1aR,1bS,4aS,7aS,7bS,8R,9R,9aS)-9a-(decanoyloxy)-4a,7b-dihydroxy-3-(hydroxymethyl)-1,1,6,8-tetramethyl-5-oxo-1a,1b,4,4a,5,7a,7b,8,9,9a-decahydro-1H-cyclopropa[3,4]benzo[1,2-e]azulen-9-yl decanoate × 4 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.35 Å |
| 8T1E Closed-state cryo-EM structure of full-length human TRPV4 in the presence of 4a-PDD 提交 2023-06-02 | Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
1–871（871 aa）
链 B
1–871（871 aa）
链 C
1–871（871 aa）
链 D
1–871（871 aa）
|
未记录 | 9ZR [(2~{R})-2-[(~{Z})-hexadec-9-enoyl]oxy-3-[oxidanyl-[2-(trimethyl-$l^{4}-azanyl)ethoxy]phosphoryl]oxy-propyl] (~{Z})-docos-13-enoate × 32 YJ0 (2R)-2-{[(4-O-hexopyranosyl-beta-D-glucopyranosyl)oxy]methyl}-4-{[(25R)-5beta,14beta,17beta-spirostan-3beta-yl]oxy}butyl 4-O-alpha-D-glucopyranosyl-beta-D-glucopyranoside × 8 NA SODIUM ION × 3 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.77 Å |
| 8T1F Cryo-EM structure of full-length human TRPV4 in complex with antagonist HC-067047 提交 2023-06-02 | Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
1–871（871 aa）
链 B
1–871（871 aa）
链 C
1–871（871 aa）
链 D
1–871（871 aa）
|
未记录 | X7N 2-methyl-1-[3-(morpholin-4-yl)propyl]-5-phenyl-N-[3-(trifluoromethyl)phenyl]-1H-pyrrole-3-carboxamide × 4 POV (2S)-3-(hexadecanoyloxy)-2-[(9Z)-octadec-9-enoyloxy]propyl 2-(trimethylammonio)ethyl phosphate × 4 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.49 Å |
| 9IQX Cryo-EM structure of the human TRPV4-RhoA in complex with AH001 提交 2024-07-13 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 A
148–787（640 aa）
链 B
148–787（640 aa）
链 C
148–787（640 aa）
链 D
148–787（640 aa）
|
未记录 | P5S O-[(R)-{[(2R)-2,3-bis(octadecanoyloxy)propyl]oxy}(hydroxy)phosphoryl]-L-serine × 2 U6L (1~{R})-1-(3-ethylphenyl)ethane-1,2-diol × 2 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.37 Å |
| 9IQY Cryo-EM structure of human TRPV4 intracellular domain in complex with GTPase RhoA 提交 2024-07-13 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 B
148–787（640 aa）
链 C
148–787（640 aa）
|
未记录 | GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.16 Å |