当前蛋白身份:Q9HC62 重新检索
本组结构的主要差异维度
构建体不同 突变/修饰不同 组装状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量指标不同

差异标签只比较当前检索结果;所有PDB和assembly原始记录仍分别保留。

相关结构差异明细

一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。

PDB 条目 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法 实验环境 结构质量
1TGZ Structure of human Senp2 in complex with SUMO-1 提交 2004-05-31 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 364–589(226 aa) 片段:catalytic domain
未记录 SO4 SULFATE ION × 5 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.5;291 K;2M AMMONIUM SULFATE, 5% PEG 400, 0.1M BIS-TRIS PH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
分辨率 2.80 Å R-free 0.276
1TGZ Structure of human Senp2 in complex with SUMO-1 提交 2004-05-31 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致
链 A 364–589(226 aa) 片段:catalytic domain
未记录 SO4 SULFATE ION × 10 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.5;291 K;2M AMMONIUM SULFATE, 5% PEG 400, 0.1M BIS-TRIS PH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
分辨率 2.80 Å R-free 0.276
1TH0 Structure of human Senp2 提交 2004-05-31 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 364–589(226 aa) 片段:catalytic domain
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.25;277 K;20% PEG 4000, 0.2M AMMONIUM SULFATE, 3% XYLITOL, 50MM SODIUM CITRATE, PH6.25, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 2.20 Å R-free 0.247
1TH0 Structure of human Senp2 提交 2004-05-31 Assembly 2 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 B 364–589(226 aa) 片段:catalytic domain
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.25;277 K;20% PEG 4000, 0.2M AMMONIUM SULFATE, 3% XYLITOL, 50MM SODIUM CITRATE, PH6.25, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 2.20 Å R-free 0.247
2IO0 Crystal structure of human Senp2 in complex with preSUMO-2 提交 2006-10-09 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 364–589(226 aa) 片段:catalytic domain
突变:C548S SO4 SULFATE ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8;291 K;15% PEG 4000, 0.2M Lithium sulfate, 0.1mM Tris-HCl, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
分辨率 2.30 Å R-free 0.249
2IO1 Crystal structure of human Senp2 in complex with preSUMO-3 提交 2006-10-09 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 364–589(226 aa) 片段:catalytic domain
突变:C548S 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8.5;291 K;7% PEG 4000, 0.1M Sodium acetate, 0.2M Magnesium chloride, 0.1M Tris-HCl, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
分辨率 2.60 Å R-free 0.230
2IO1 Crystal structure of human Senp2 in complex with preSUMO-3 提交 2006-10-09 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 C 364–589(226 aa) 片段:catalytic domain
突变:C548S 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8.5;291 K;7% PEG 4000, 0.1M Sodium acetate, 0.2M Magnesium chloride, 0.1M Tris-HCl, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
分辨率 2.60 Å R-free 0.230
2IO1 Crystal structure of human Senp2 in complex with preSUMO-3 提交 2006-10-09 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 E 364–589(226 aa) 片段:catalytic domain
突变:C548S 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8.5;291 K;7% PEG 4000, 0.1M Sodium acetate, 0.2M Magnesium chloride, 0.1M Tris-HCl, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
分辨率 2.60 Å R-free 0.230
2IO2 Crystal structure of human Senp2 in complex with RanGAP1-SUMO-1 提交 2006-10-09 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 12 PDB 声明:dodecameric(12) 与蛋白数一致
链 A 364–589(226 aa) 片段:catalytic domain
突变:C548S 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8.5;291 K;12% PEG 4000, 0.1M Lithium chloride, 0.1M Tris-HCl, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
分辨率 2.90 Å R-free 0.301
2IO3 Crystal structure of human Senp2 in complex with RanGAP1-SUMO-2 提交 2006-10-09 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 12 PDB 声明:dodecameric(12) 与蛋白数一致
链 A 364–589(226 aa) 片段:catalytic domain
突变:C548S 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8.5;291 K;12% PEG 4000, 0.1M Lithium chloride, 0.1M Tris-HCl, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
分辨率 3.20 Å R-free 0.306
3ZO5 Structure of SENP2-Loop1 in complex with preSUMO-2 提交 2013-02-20 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 363–392(30 aa) 片段:RESIDUES 363-589
链 A 395–589(195 aa) 片段:RESIDUES 363-589
突变:YES 突变:YES 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 2.15 Å R-free 0.236
5AEK Crystal structure of the human SENP2 C548S in complex with the human SUMO1 K48M F66W 提交 2014-12-23 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 366–589(224 aa) 片段:CATALYTIC DOMAIN
突变:YES 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 291 K;2M AMMONIUM SULFATE, 5% PEG 400, 0.1M BIS-TRIS PH 6.5 291K
分辨率 3.00 Å R-free 0.326
5AEK Crystal structure of the human SENP2 C548S in complex with the human SUMO1 K48M F66W 提交 2014-12-23 Assembly 10 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 S 366–589(224 aa) 片段:CATALYTIC DOMAIN
突变:YES 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 291 K;2M AMMONIUM SULFATE, 5% PEG 400, 0.1M BIS-TRIS PH 6.5 291K
分辨率 3.00 Å R-free 0.326
5AEK Crystal structure of the human SENP2 C548S in complex with the human SUMO1 K48M F66W 提交 2014-12-23 Assembly 11 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 U 366–589(224 aa) 片段:CATALYTIC DOMAIN
突变:YES 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 291 K;2M AMMONIUM SULFATE, 5% PEG 400, 0.1M BIS-TRIS PH 6.5 291K
分辨率 3.00 Å R-free 0.326
5AEK Crystal structure of the human SENP2 C548S in complex with the human SUMO1 K48M F66W 提交 2014-12-23 Assembly 12 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 W 366–589(224 aa) 片段:CATALYTIC DOMAIN
突变:YES 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 291 K;2M AMMONIUM SULFATE, 5% PEG 400, 0.1M BIS-TRIS PH 6.5 291K
分辨率 3.00 Å R-free 0.326
5AEK Crystal structure of the human SENP2 C548S in complex with the human SUMO1 K48M F66W 提交 2014-12-23 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 C 366–589(224 aa) 片段:CATALYTIC DOMAIN
突变:YES 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 291 K;2M AMMONIUM SULFATE, 5% PEG 400, 0.1M BIS-TRIS PH 6.5 291K
分辨率 3.00 Å R-free 0.326
5AEK Crystal structure of the human SENP2 C548S in complex with the human SUMO1 K48M F66W 提交 2014-12-23 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 E 366–589(224 aa) 片段:CATALYTIC DOMAIN
突变:YES 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 291 K;2M AMMONIUM SULFATE, 5% PEG 400, 0.1M BIS-TRIS PH 6.5 291K
分辨率 3.00 Å R-free 0.326
5AEK Crystal structure of the human SENP2 C548S in complex with the human SUMO1 K48M F66W 提交 2014-12-23 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 G 366–589(224 aa) 片段:CATALYTIC DOMAIN
突变:YES 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 291 K;2M AMMONIUM SULFATE, 5% PEG 400, 0.1M BIS-TRIS PH 6.5 291K
分辨率 3.00 Å R-free 0.326
5AEK Crystal structure of the human SENP2 C548S in complex with the human SUMO1 K48M F66W 提交 2014-12-23 Assembly 5 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 I 366–589(224 aa) 片段:CATALYTIC DOMAIN
突变:YES 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 291 K;2M AMMONIUM SULFATE, 5% PEG 400, 0.1M BIS-TRIS PH 6.5 291K
分辨率 3.00 Å R-free 0.326
5AEK Crystal structure of the human SENP2 C548S in complex with the human SUMO1 K48M F66W 提交 2014-12-23 Assembly 6 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 K 366–589(224 aa) 片段:CATALYTIC DOMAIN
突变:YES 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 291 K;2M AMMONIUM SULFATE, 5% PEG 400, 0.1M BIS-TRIS PH 6.5 291K
分辨率 3.00 Å R-free 0.326
5AEK Crystal structure of the human SENP2 C548S in complex with the human SUMO1 K48M F66W 提交 2014-12-23 Assembly 7 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 M 366–589(224 aa) 片段:CATALYTIC DOMAIN
突变:YES 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 291 K;2M AMMONIUM SULFATE, 5% PEG 400, 0.1M BIS-TRIS PH 6.5 291K
分辨率 3.00 Å R-free 0.326
5AEK Crystal structure of the human SENP2 C548S in complex with the human SUMO1 K48M F66W 提交 2014-12-23 Assembly 8 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 O 366–589(224 aa) 片段:CATALYTIC DOMAIN
突变:YES 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 291 K;2M AMMONIUM SULFATE, 5% PEG 400, 0.1M BIS-TRIS PH 6.5 291K
分辨率 3.00 Å R-free 0.326
5AEK Crystal structure of the human SENP2 C548S in complex with the human SUMO1 K48M F66W 提交 2014-12-23 Assembly 9 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 Q 366–589(224 aa) 片段:CATALYTIC DOMAIN
突变:YES 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 291 K;2M AMMONIUM SULFATE, 5% PEG 400, 0.1M BIS-TRIS PH 6.5 291K
分辨率 3.00 Å R-free 0.326