当前蛋白身份:Q9HC62
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1TGZ Structure of human Senp2 in complex with SUMO-1 提交 2004-05-31 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 A
364–589(226 aa)
片段:catalytic domain
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 5 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.5;291 K;2M AMMONIUM SULFATE, 5% PEG 400, 0.1M BIS-TRIS PH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.276 |
| 1TGZ Structure of human Senp2 in complex with SUMO-1 提交 2004-05-31 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致 |
链 A
364–589(226 aa)
片段:catalytic domain
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 10 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.5;291 K;2M AMMONIUM SULFATE, 5% PEG 400, 0.1M BIS-TRIS PH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.276 |
| 1TH0 Structure of human Senp2 提交 2004-05-31 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致 |
链 A
364–589(226 aa)
片段:catalytic domain
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.25;277 K;20% PEG 4000, 0.2M AMMONIUM SULFATE, 3% XYLITOL, 50MM SODIUM CITRATE, PH6.25, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.247 |
| 1TH0 Structure of human Senp2 提交 2004-05-31 | Assembly 2 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致 |
链 B
364–589(226 aa)
片段:catalytic domain
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.25;277 K;20% PEG 4000, 0.2M AMMONIUM SULFATE, 3% XYLITOL, 50MM SODIUM CITRATE, PH6.25, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.247 |
| 2IO0 Crystal structure of human Senp2 in complex with preSUMO-2 提交 2006-10-09 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 A
364–589(226 aa)
片段:catalytic domain
|
突变:C548S | SO4 SULFATE ION × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8;291 K;15% PEG 4000, 0.2M Lithium sulfate, 0.1mM Tris-HCl, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.249 |
| 2IO1 Crystal structure of human Senp2 in complex with preSUMO-3 提交 2006-10-09 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 A
364–589(226 aa)
片段:catalytic domain
|
突变:C548S | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8.5;291 K;7% PEG 4000, 0.1M Sodium acetate, 0.2M Magnesium chloride, 0.1M Tris-HCl, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.230 |
| 2IO1 Crystal structure of human Senp2 in complex with preSUMO-3 提交 2006-10-09 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 C
364–589(226 aa)
片段:catalytic domain
|
突变:C548S | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8.5;291 K;7% PEG 4000, 0.1M Sodium acetate, 0.2M Magnesium chloride, 0.1M Tris-HCl, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.230 |
| 2IO1 Crystal structure of human Senp2 in complex with preSUMO-3 提交 2006-10-09 | Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 E
364–589(226 aa)
片段:catalytic domain
|
突变:C548S | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8.5;291 K;7% PEG 4000, 0.1M Sodium acetate, 0.2M Magnesium chloride, 0.1M Tris-HCl, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.230 |
| 2IO2 Crystal structure of human Senp2 in complex with RanGAP1-SUMO-1 提交 2006-10-09 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 12 PDB 声明:dodecameric(12) 与蛋白数一致 |
链 A
364–589(226 aa)
片段:catalytic domain
|
突变:C548S | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8.5;291 K;12% PEG 4000, 0.1M Lithium chloride, 0.1M Tris-HCl, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
|
分辨率 2.90 Å R-free 0.301 |
| 2IO3 Crystal structure of human Senp2 in complex with RanGAP1-SUMO-2 提交 2006-10-09 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 12 PDB 声明:dodecameric(12) 与蛋白数一致 |
链 A
364–589(226 aa)
片段:catalytic domain
|
突变:C548S | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8.5;291 K;12% PEG 4000, 0.1M Lithium chloride, 0.1M Tris-HCl, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
|
分辨率 3.20 Å R-free 0.306 |
| 3ZO5 Structure of SENP2-Loop1 in complex with preSUMO-2 提交 2013-02-20 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 A
363–392(30 aa)
片段:RESIDUES 363-589
链 A
395–589(195 aa)
片段:RESIDUES 363-589
|
突变:YES 突变:YES | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 2.15 Å R-free 0.236 |
| 5AEK Crystal structure of the human SENP2 C548S in complex with the human SUMO1 K48M F66W 提交 2014-12-23 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 A
366–589(224 aa)
片段:CATALYTIC DOMAIN
|
突变:YES | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
291 K;2M AMMONIUM SULFATE, 5% PEG 400, 0.1M BIS-TRIS PH 6.5 291K
|
分辨率 3.00 Å R-free 0.326 |
| 5AEK Crystal structure of the human SENP2 C548S in complex with the human SUMO1 K48M F66W 提交 2014-12-23 | Assembly 10 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 S
366–589(224 aa)
片段:CATALYTIC DOMAIN
|
突变:YES | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
291 K;2M AMMONIUM SULFATE, 5% PEG 400, 0.1M BIS-TRIS PH 6.5 291K
|
分辨率 3.00 Å R-free 0.326 |
| 5AEK Crystal structure of the human SENP2 C548S in complex with the human SUMO1 K48M F66W 提交 2014-12-23 | Assembly 11 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 U
366–589(224 aa)
片段:CATALYTIC DOMAIN
|
突变:YES | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
291 K;2M AMMONIUM SULFATE, 5% PEG 400, 0.1M BIS-TRIS PH 6.5 291K
|
分辨率 3.00 Å R-free 0.326 |
| 5AEK Crystal structure of the human SENP2 C548S in complex with the human SUMO1 K48M F66W 提交 2014-12-23 | Assembly 12 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 W
366–589(224 aa)
片段:CATALYTIC DOMAIN
|
突变:YES | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
291 K;2M AMMONIUM SULFATE, 5% PEG 400, 0.1M BIS-TRIS PH 6.5 291K
|
分辨率 3.00 Å R-free 0.326 |
| 5AEK Crystal structure of the human SENP2 C548S in complex with the human SUMO1 K48M F66W 提交 2014-12-23 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 C
366–589(224 aa)
片段:CATALYTIC DOMAIN
|
突变:YES | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
291 K;2M AMMONIUM SULFATE, 5% PEG 400, 0.1M BIS-TRIS PH 6.5 291K
|
分辨率 3.00 Å R-free 0.326 |
| 5AEK Crystal structure of the human SENP2 C548S in complex with the human SUMO1 K48M F66W 提交 2014-12-23 | Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 E
366–589(224 aa)
片段:CATALYTIC DOMAIN
|
突变:YES | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
291 K;2M AMMONIUM SULFATE, 5% PEG 400, 0.1M BIS-TRIS PH 6.5 291K
|
分辨率 3.00 Å R-free 0.326 |
| 5AEK Crystal structure of the human SENP2 C548S in complex with the human SUMO1 K48M F66W 提交 2014-12-23 | Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 G
366–589(224 aa)
片段:CATALYTIC DOMAIN
|
突变:YES | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
291 K;2M AMMONIUM SULFATE, 5% PEG 400, 0.1M BIS-TRIS PH 6.5 291K
|
分辨率 3.00 Å R-free 0.326 |
| 5AEK Crystal structure of the human SENP2 C548S in complex with the human SUMO1 K48M F66W 提交 2014-12-23 | Assembly 5 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 I
366–589(224 aa)
片段:CATALYTIC DOMAIN
|
突变:YES | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
291 K;2M AMMONIUM SULFATE, 5% PEG 400, 0.1M BIS-TRIS PH 6.5 291K
|
分辨率 3.00 Å R-free 0.326 |
| 5AEK Crystal structure of the human SENP2 C548S in complex with the human SUMO1 K48M F66W 提交 2014-12-23 | Assembly 6 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 K
366–589(224 aa)
片段:CATALYTIC DOMAIN
|
突变:YES | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
291 K;2M AMMONIUM SULFATE, 5% PEG 400, 0.1M BIS-TRIS PH 6.5 291K
|
分辨率 3.00 Å R-free 0.326 |
| 5AEK Crystal structure of the human SENP2 C548S in complex with the human SUMO1 K48M F66W 提交 2014-12-23 | Assembly 7 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 M
366–589(224 aa)
片段:CATALYTIC DOMAIN
|
突变:YES | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
291 K;2M AMMONIUM SULFATE, 5% PEG 400, 0.1M BIS-TRIS PH 6.5 291K
|
分辨率 3.00 Å R-free 0.326 |
| 5AEK Crystal structure of the human SENP2 C548S in complex with the human SUMO1 K48M F66W 提交 2014-12-23 | Assembly 8 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 O
366–589(224 aa)
片段:CATALYTIC DOMAIN
|
突变:YES | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
291 K;2M AMMONIUM SULFATE, 5% PEG 400, 0.1M BIS-TRIS PH 6.5 291K
|
分辨率 3.00 Å R-free 0.326 |
| 5AEK Crystal structure of the human SENP2 C548S in complex with the human SUMO1 K48M F66W 提交 2014-12-23 | Assembly 9 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 Q
366–589(224 aa)
片段:CATALYTIC DOMAIN
|
突变:YES | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
291 K;2M AMMONIUM SULFATE, 5% PEG 400, 0.1M BIS-TRIS PH 6.5 291K
|
分辨率 3.00 Å R-free 0.326 |