当前蛋白身份：Q9N6S8
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1YVB the Plasmodium falciparum Cysteine Protease Falcipain-2 提交 2005-02-15 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
244–484（241 aa）
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未记录 | GOL GLYCEROL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；277 K；0.1 M HEPES pH 7.5 and 4.3 M NaCl , pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
|
分辨率 2.70 Å R-free 0.264 |
| 2GHU Crystal structure of falcipain-2 from Plasmodium falciparum 提交 2006-03-27 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
244–484（241 aa）
片段：Mature wild-type enzyme (residues 1-241)
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5；298 K；0.4-0.8 M ammonium sulfate, 100 mM sodium citrate, pH 5.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298.0K
|
分辨率 3.10 Å R-free 0.274 |
| 2GHU Crystal structure of falcipain-2 from Plasmodium falciparum 提交 2006-03-27 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
244–484（241 aa）
片段：Mature wild-type enzyme (residues 1-241)
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5；298 K；0.4-0.8 M ammonium sulfate, 100 mM sodium citrate, pH 5.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298.0K
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分辨率 3.10 Å R-free 0.274 |
| 2GHU Crystal structure of falcipain-2 from Plasmodium falciparum 提交 2006-03-27 | Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 C
244–484（241 aa）
片段：Mature wild-type enzyme (residues 1-241)
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5；298 K；0.4-0.8 M ammonium sulfate, 100 mM sodium citrate, pH 5.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298.0K
|
分辨率 3.10 Å R-free 0.274 |
| 2GHU Crystal structure of falcipain-2 from Plasmodium falciparum 提交 2006-03-27 | Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 D
244–484（241 aa）
片段：Mature wild-type enzyme (residues 1-241)
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5；298 K；0.4-0.8 M ammonium sulfate, 100 mM sodium citrate, pH 5.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298.0K
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分辨率 3.10 Å R-free 0.274 |
| 2OUL The Structure of Chagasin in Complex with a Cysteine Protease Clarifies the Binding Mode and Evolution of a New Inhibitor Family 提交 2007-02-11 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
244–484（241 aa）
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 7；277 K；20% (v/v) PEG-300, 0.1 M Tris pH 8.5, 5% (w/v) PEG8000, and 10-15% (v/v) glycerol, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K, pH 7.00
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分辨率 2.20 Å R-free 0.232 |
| 3PNR Structure of PbICP-C in complex with falcipain-2 提交 2010-11-19 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
245–484（240 aa）
片段：mature FP-2 (UNP residues 245-484)
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突变：C285A | GOL GLYCEROL × 3 CD CADMIUM ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5；291 K；200 mM sodium acetate, 27.5 mM CdCl2, 100 mM MES, pH 5.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 291K
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.229 |
| 6SSZ Structure of the Plasmodium falciparum falcipain 2 protease in complex with an (E)-chalcone inhibitor. 提交 2019-09-09 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
244–483（240 aa）
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突变：C25A | JV1 (~{E})-3-(1,3-benzodioxol-5-yl)-1-(3-nitrophenyl)prop-2-en-1-one × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；293 K；Mother liquor comprising 0.12 M of monosaccharides mixture (D-glucose; D-mannose; D-galactose; L-fucose; D-xylose; N-acetyl-D-glucosamine), 0.1 M Tris/Bicine (pH 8.5); 20% v/v glycerol, 10% w/v PEG 4000. Crystal soaked for 2 hours with (E)-chalcone #48 inhibitor. Inhibitor prepared in 100% DMSO, 100 mM concentration and then diluted to 1 mM in mother liquor for crystal soaking.
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分辨率 3.45 Å R-free 0.308 |
| 6SSZ Structure of the Plasmodium falciparum falcipain 2 protease in complex with an (E)-chalcone inhibitor. 提交 2019-09-09 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
244–483（240 aa）
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突变：C25A | JV1 (~{E})-3-(1,3-benzodioxol-5-yl)-1-(3-nitrophenyl)prop-2-en-1-one × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；293 K；Mother liquor comprising 0.12 M of monosaccharides mixture (D-glucose; D-mannose; D-galactose; L-fucose; D-xylose; N-acetyl-D-glucosamine), 0.1 M Tris/Bicine (pH 8.5); 20% v/v glycerol, 10% w/v PEG 4000. Crystal soaked for 2 hours with (E)-chalcone #48 inhibitor. Inhibitor prepared in 100% DMSO, 100 mM concentration and then diluted to 1 mM in mother liquor for crystal soaking.
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分辨率 3.45 Å R-free 0.308 |