当前蛋白身份：Q9NP79
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2LXL Lip5(mit)2 提交 2012-08-29 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–183（183 aa）
片段：UNP residues 1-183
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未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 6.3；298 K；离子强度（mmCIF原始值）0.075；压力 ambient
NMR样品组成
0.8 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] LIP5(1-183), 25 mM sodium phosphate, 50 mM sodium chloride, 0.5 mM DTT, 0.1 mM EDTA, 92% H2O/8% D2O | 92% H2O/8% D2O
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分辨率未提供 |
| 2LXM Lip5-chmp5 提交 2012-08-29 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–168（168 aa）
片段：UNP residues 1-168
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未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 6.3；298 K；离子强度（mmCIF原始值）75；压力 ambient
NMR样品组成
0.5 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] LIP5(1-168), 0.5 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] CHMP5(139-195), 25 mM sodium phosphate, 50 mM sodium chloride, 0.5 mM DTT, 0.1 mM EDTA, 92% H2O/8% D2O | 92% H2O/8% D2O
|
分辨率未提供 |
| 4TXP Crystal structure of LIP5 N-terminal domain 提交 2014-07-04 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–162（162 aa）
片段：UNP residues 1-162
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；277.15 K；7.5-9% PEG 8000, 20% 1,4 butanediol, 0.1M cacodylate, 0.2M sodium acetate
|
分辨率 3.01 Å R-free 0.286 |
| 4TXP Crystal structure of LIP5 N-terminal domain 提交 2014-07-04 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1–162（162 aa）
片段：UNP residues 1-162
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；277.15 K；7.5-9% PEG 8000, 20% 1,4 butanediol, 0.1M cacodylate, 0.2M sodium acetate
|
分辨率 3.01 Å R-free 0.286 |
| 4TXP Crystal structure of LIP5 N-terminal domain 提交 2014-07-04 | Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 C
1–162（162 aa）
片段：UNP residues 1-162
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；277.15 K；7.5-9% PEG 8000, 20% 1,4 butanediol, 0.1M cacodylate, 0.2M sodium acetate
|
分辨率 3.01 Å R-free 0.286 |
| 4TXQ Crystal structure of LIP5 N-terminal domain complexed with CHMP1B MIM 提交 2014-07-04 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–162（162 aa）
片段：UNP residues 1-162
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 9；277.15 K；Protein mixture was added in 1:1 ratio with a solution of 16% MPD, 0.1 M Tris and equilibrated against a mother liquid of 8% MPD, 0.1 M Tris
|
分辨率 2.21 Å R-free 0.227 |
| 4TXQ Crystal structure of LIP5 N-terminal domain complexed with CHMP1B MIM 提交 2014-07-04 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
1–162（162 aa）
片段：UNP residues 1-162
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 9；277.15 K；Protein mixture was added in 1:1 ratio with a solution of 16% MPD, 0.1 M Tris and equilibrated against a mother liquid of 8% MPD, 0.1 M Tris
|
分辨率 2.21 Å R-free 0.227 |
| 4TXR Crystal structure of LIP5 N-terminal domain complexed with CHMP1B MIM and CHMP5 MIM 提交 2014-07-04 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
1–162（162 aa）
片段：UNP residues 1-162
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未记录 | ACT ACETATE ION × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 9 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；277.15 K；19% PEG 4000, 0.025 M sodium acetate
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分辨率 1.00 Å R-free 0.180 |
| 4U7E The crystal structure of the complex of LIP5 NTD and IST1 MIM 提交 2014-07-30 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
1–162（162 aa）
片段：N-terminal domain (UNP residues 1-162)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；277.15 K；30% (w/v) PEG5000MME, 0.1 M ammonium sulfate , 0.1 M MES
|
分辨率 1.60 Å R-free 0.201 |