当前蛋白身份：Q9NPI1
重新检索
差异标签只比较当前检索结果；所有PDB和assembly原始记录仍分别保留。
相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2I7K Solution Structure of the Bromodomain of Human BRD7 Protein 提交 2006-08-31 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
129–236（108 aa）
片段：bromodomain
|
未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 6.1；293 K；压力 1
NMR样品组成
0.6mM BRD7 bromodomain U-15N; 50mM phosphate buffer (pH 6.1), 50mM NaCl, 1mM DTT, 5mM EDTA; 90% H2O, 10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
0.6mM BRD7 bromodomain U-15N,13C; 50mM phosphate buffer (pH 6.1), 50mM NaCl, 1mM DTT, 5mM EDTA; 90% H2O, 10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
0.6mM BRD7 bromodomain U-15N,13C; 50mM phosphate buffer (pH 6.1), 50mM NaCl, 1mM DTT, 5mM EDTA; 99.96% D2O | 99.96% D2O
|
分辨率未提供 |
| 5MQ1 Crystal structure of the BRD7 bromodomain in complex with BI-9564 提交 2016-12-19 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
129–239（111 aa）
|
未记录 | 5U6 4-[4-[(dimethylamino)methyl]-2,5-dimethoxy-phenyl]-2-methyl-2,7-naphthyridin-1-one × 1 ZN ZINC ION × 2 CL CHLORIDE ION × 3 MG MAGNESIUM ION × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 11 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；277 K；20% PEG6000, 10%EDO, 0.1 M HEPES pH 7.0, 0.01 M ZnCl2
|
分辨率 1.50 Å R-free 0.190 |
| 6PPA Crystal structure of the unliganded bromodomain of human BRD7 提交 2019-07-05 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
130–250（121 aa）
片段：UNP RESIDUES 130-250
|
未记录 | PO4 PHOSPHATE ION × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；291 K；7.5 MG/ML BRD7, 25MM PHOSPHATE PH 6.9, 25MM AMMONIUM SULPHATE, 0.5MM DTT, 25MM BIS-TRIS PH6.5, 15% PENTAERYTHRYTOL ETHOXYLATE 15/4EO/OH
|
分辨率 1.77 Å R-free 0.202 |
| 6PPA Crystal structure of the unliganded bromodomain of human BRD7 提交 2019-07-05 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
130–250（121 aa）
片段：UNP RESIDUES 130-250
|
未记录 | PO4 PHOSPHATE ION × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；291 K；7.5 MG/ML BRD7, 25MM PHOSPHATE PH 6.9, 25MM AMMONIUM SULPHATE, 0.5MM DTT, 25MM BIS-TRIS PH6.5, 15% PENTAERYTHRYTOL ETHOXYLATE 15/4EO/OH
|
分辨率 1.77 Å R-free 0.202 |
| 6V0Q Crystal structure of the bromodomain of human BRD7 bound to TG003 提交 2019-11-19 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
130–250（121 aa）
|
未记录 | EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 PO4 PHOSPHATE ION × 1 CL CHLORIDE ION × 1 EAE (1~{Z})-1-(3-ethyl-5-methoxy-1,3-benzothiazol-2-ylidene)propan-2-one × 1 GOL GLYCEROL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；0.1 M (NH4)2SO4, 0.05 M Bis-tris (pH 6.5), and 30 % Pentaerythritol ethoxylate
|
分辨率 1.69 Å R-free 0.218 |
| 6V0Q Crystal structure of the bromodomain of human BRD7 bound to TG003 提交 2019-11-19 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
130–250（121 aa）
|
未记录 | EAE (1~{Z})-1-(3-ethyl-5-methoxy-1,3-benzothiazol-2-ylidene)propan-2-one × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；0.1 M (NH4)2SO4, 0.05 M Bis-tris (pH 6.5), and 30 % Pentaerythritol ethoxylate
|
分辨率 1.69 Å R-free 0.218 |
| 6V0Q Crystal structure of the bromodomain of human BRD7 bound to TG003 提交 2019-11-19 | Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 C
130–250（121 aa）
|
未记录 | EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 EAE (1~{Z})-1-(3-ethyl-5-methoxy-1,3-benzothiazol-2-ylidene)propan-2-one × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；0.1 M (NH4)2SO4, 0.05 M Bis-tris (pH 6.5), and 30 % Pentaerythritol ethoxylate
|
分辨率 1.69 Å R-free 0.218 |
| 6V0Q Crystal structure of the bromodomain of human BRD7 bound to TG003 提交 2019-11-19 | Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 D
130–250（121 aa）
|
未记录 | EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 EAE (1~{Z})-1-(3-ethyl-5-methoxy-1,3-benzothiazol-2-ylidene)propan-2-one × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；0.1 M (NH4)2SO4, 0.05 M Bis-tris (pH 6.5), and 30 % Pentaerythritol ethoxylate
|
分辨率 1.69 Å R-free 0.218 |
| 6V0Q Crystal structure of the bromodomain of human BRD7 bound to TG003 提交 2019-11-19 | Assembly 5 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
130–250（121 aa）
链 D
130–250（121 aa）
|
未记录 | EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3 PO4 PHOSPHATE ION × 1 CL CHLORIDE ION × 1 EAE (1~{Z})-1-(3-ethyl-5-methoxy-1,3-benzothiazol-2-ylidene)propan-2-one × 2 GOL GLYCEROL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；0.1 M (NH4)2SO4, 0.05 M Bis-tris (pH 6.5), and 30 % Pentaerythritol ethoxylate
|
分辨率 1.69 Å R-free 0.218 |
| 6V0Q Crystal structure of the bromodomain of human BRD7 bound to TG003 提交 2019-11-19 | Assembly 6 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
130–250（121 aa）
链 C
130–250（121 aa）
|
未记录 | EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 EAE (1~{Z})-1-(3-ethyl-5-methoxy-1,3-benzothiazol-2-ylidene)propan-2-one × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；0.1 M (NH4)2SO4, 0.05 M Bis-tris (pH 6.5), and 30 % Pentaerythritol ethoxylate
|
分辨率 1.69 Å R-free 0.218 |
| 6V16 Crystal structure of the bromodomain of human BRD7 bound to TP472 提交 2019-11-19 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
130–250（121 aa）
|
未记录 | QMG 3-(6-acetylpyrrolo[1,2-a]pyrimidin-8-yl)-N-cyclopropyl-4-methylbenzamide × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；0.1 M (NH4)2SO4, 0.05 M Bis-tris (pH 6.5), and 30 % Pentaerythritol ethoxylate
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.222 |
| 6V16 Crystal structure of the bromodomain of human BRD7 bound to TP472 提交 2019-11-19 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
130–250（121 aa）
|
未记录 | QMG 3-(6-acetylpyrrolo[1,2-a]pyrimidin-8-yl)-N-cyclopropyl-4-methylbenzamide × 1 HEZ HEXANE-1,6-DIOL × 1 GOL GLYCEROL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；0.1 M (NH4)2SO4, 0.05 M Bis-tris (pH 6.5), and 30 % Pentaerythritol ethoxylate
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.222 |
| 6V17 Crystal structure of the bromodomain of human BRD7 bound to I-BRD9 提交 2019-11-19 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
130–250（121 aa）
|
未记录 | CL CHLORIDE ION × 1 H1B N'-[1,1-bis(oxidanylidene)thian-4-yl]-5-ethyl-4-oxidanylidene-7-[3-(trifluoromethyl)phenyl]thieno[3,2-c]pyridine-2-carboximidamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；0.1 M (NH4)2SO4, 0.05 M Bis-tris (pH 6.5), and 30 % Pentaerythritol ethoxylate
|
分辨率 2.05 Å R-free 0.241 |
| 6V17 Crystal structure of the bromodomain of human BRD7 bound to I-BRD9 提交 2019-11-19 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
130–250（121 aa）
|
未记录 | H1B N'-[1,1-bis(oxidanylidene)thian-4-yl]-5-ethyl-4-oxidanylidene-7-[3-(trifluoromethyl)phenyl]thieno[3,2-c]pyridine-2-carboximidamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；0.1 M (NH4)2SO4, 0.05 M Bis-tris (pH 6.5), and 30 % Pentaerythritol ethoxylate
|
分辨率 2.05 Å R-free 0.241 |
| 6V17 Crystal structure of the bromodomain of human BRD7 bound to I-BRD9 提交 2019-11-19 | Assembly 3 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
130–250（121 aa）
链 B
130–250（121 aa）
|
未记录 | CL CHLORIDE ION × 1 H1B N'-[1,1-bis(oxidanylidene)thian-4-yl]-5-ethyl-4-oxidanylidene-7-[3-(trifluoromethyl)phenyl]thieno[3,2-c]pyridine-2-carboximidamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；0.1 M (NH4)2SO4, 0.05 M Bis-tris (pH 6.5), and 30 % Pentaerythritol ethoxylate
|
分辨率 2.05 Å R-free 0.241 |
| 6V1E Crystal structure of the bromodomain of human BRD7 bound to BI7273 提交 2019-11-20 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
129–250（122 aa）
|
未记录 | 5SW 4-[4-[(dimethylamino)methyl]-3,5-dimethoxy-phenyl]-2-methyl-2,7-naphthyridin-1-one × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；0.1 M (NH4)2SO4, 0.05 M Bis-tris (pH 6.5), and 30 % Pentaerythritol ethoxylate
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.249 |
| 6V1F Crystal structure of the bromodomain of human BRD7 bound to BI9564 提交 2019-11-20 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
129–250（122 aa）
|
未记录 | 5U6 4-[4-[(dimethylamino)methyl]-2,5-dimethoxy-phenyl]-2-methyl-2,7-naphthyridin-1-one × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；0.05 M (NH4)2SO4, 0.1 M Bis-tris (pH 6.5), and 30 % Pentaerythritol ethoxylate
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.249 |
| 6V1H Crystal structure of the bromodomain of human BRD7 bound to bromosporine 提交 2019-11-20 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
129–250（122 aa）
|
未记录 | BMF Bromosporine × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；0.1 M (NH4)2SO4, 0.05 M Bis-tris (pH 6.5), and 30 % Pentaerythritol ethoxylate
|
分辨率 1.93 Å R-free 0.235 |
| 7VDV The overall structure of human chromatin remodeling PBAF-nucleosome complex 提交 2021-09-07 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 22 PDB 声明：24-meric（24） 与全部聚合物一致 |
链 T
1–652（652 aa）
|
未记录 | BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.40 Å |
| 7Y8R The nucleosome-bound human PBAF complex 提交 2022-06-24 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 25 PDB 声明：27-meric（27） 与全部聚合物一致 |
链 S
1–651（651 aa）
|
未记录 | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.40 Å |