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Protein Structures and Oligomeric States

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Current Protein Identity：Q9NPP4 New Search
6PDB entries
6Biological assembly
66chain/assembly records
Main Difference Dimensions in This Set
Different construct Different mutation/modification Different assembly state Different ligand/ion Different experimental conditions Different structure-quality metrics

Difference tags compare only the current result set; every original PDB and assembly record remains separate.

Related-Structure Differences

Each row represents one biological assembly in one PDB entry; multiple monomers of the same protein are listed separately.

PDB Entry Assembly / Oligomeric State Construct Mutations and Modifications Ligands, Ions and Non-polymers Experimental Method Experimental Conditions Structure Quality
6K8J Structure of NLRC4 CARD filament Deposited 2019-06-12 Assembly 1 Protein homooligomer Homooligomer；Protein × 12 PDB declaration: dodecameric（12） Consistent with protein count
Chain A 1–85（85 aa）
Chain B 1–85（85 aa）
Chain C 1–85（85 aa）
Chain D 1–85（85 aa）
Chain E 1–85（85 aa）
Chain F 1–85（85 aa）
Chain G 1–85（85 aa）
Chain H 1–85（85 aa）
Chain I 1–85（85 aa）
Chain J 1–85（85 aa）
Chain K 1–85（85 aa）
Chain L 1–85（85 aa）
Not recorded No recorded non-water small molecule ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM buffer pH 8
cryo-EM vitrification conditions Cryogen ETHANE
Resolution 3.30 Å R-free 0.306
6MKS Cryo-EM structure of NLRC4-CARD filament Deposited 2018-09-26 Assembly 1 Insufficient information Homooligomer；Protein × 31 PDB declaration: 31-meric（31） Consistent with protein count
Chain A 1–96（96 aa）
Chain B 1–96（96 aa）
Chain C 1–96（96 aa）
Chain D 1–96（96 aa）
Chain E 1–96（96 aa）
Chain F 1–96（96 aa）
Chain G 1–96（96 aa）
Chain H 1–96（96 aa）
Chain I 1–96（96 aa）
Chain J 1–96（96 aa）
Chain K 1–96（96 aa）
Chain L 1–96（96 aa）
Chain M 1–96（96 aa）
Chain N 1–96（96 aa）
Chain O 1–96（96 aa）
Chain P 1–96（96 aa）
Chain Q 1–96（96 aa）
Chain R 1–96（96 aa）
Chain S 1–96（96 aa）
Chain T 1–96（96 aa）
Chain U 1–96（96 aa）
Chain V 1–96（96 aa）
Chain W 1–96（96 aa）
Chain X 1–96（96 aa）
Chain Y 1–96（96 aa）
Chain Z 1–96（96 aa）
Chain a 1–96（96 aa）
Chain b 1–96（96 aa）
Chain c 1–96（96 aa）
Chain d 1–96（96 aa）
Chain e 1–96（96 aa）
Not recorded No recorded non-water small molecule ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM buffer pH 7；20mM HEPES at pH 7.4, 400mM NaCl, 10% glycerol, 1mM EDTA and 1mM DTT
cryo-EM vitrification conditions Cryogen ETHANE
Resolution 3.40 Å
6N1I Cryo-EM structure of NLRC4-CARD filament Deposited 2018-11-08 Assembly 1 Protein homooligomer Homooligomer；Protein × 16 PDB declaration: hexadecameric（16） Consistent with protein count
Chain A 1–85（85 aa） Fragment：CARD (UNP residues 1-85)
Chain B 1–85（85 aa） Fragment：CARD (UNP residues 1-85)
Chain C 1–85（85 aa） Fragment：CARD (UNP residues 1-85)
Chain D 1–85（85 aa） Fragment：CARD (UNP residues 1-85)
Chain E 1–85（85 aa） Fragment：CARD (UNP residues 1-85)
Chain F 1–85（85 aa） Fragment：CARD (UNP residues 1-85)
Chain G 1–85（85 aa） Fragment：CARD (UNP residues 1-85)
Chain H 1–85（85 aa） Fragment：CARD (UNP residues 1-85)
Chain I 1–85（85 aa） Fragment：CARD (UNP residues 1-85)
Chain J 1–85（85 aa） Fragment：CARD (UNP residues 1-85)
Chain K 1–85（85 aa） Fragment：CARD (UNP residues 1-85)
Chain L 1–85（85 aa） Fragment：CARD (UNP residues 1-85)
Chain M 1–85（85 aa） Fragment：CARD (UNP residues 1-85)
Chain N 1–85（85 aa） Fragment：CARD (UNP residues 1-85)
Chain O 1–85（85 aa） Fragment：CARD (UNP residues 1-85)
Chain P 1–85（85 aa） Fragment：CARD (UNP residues 1-85)
Not recorded No recorded non-water small molecule ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM buffer pH 8
cryo-EM vitrification conditions Cryogen ETHANE
Resolution 3.58 Å
8FVU Cryo-EM structure of human Needle/NAIP/NLRC4 (R288A) Deposited 2023-01-19 Assembly 1 Insufficient information Heteromer；Protein × 3 PDB declaration: trimeric（3） Consistent with protein count
Chain B 1–1024（1024 aa）
Mutation：R288A ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM buffer pH 7.5
cryo-EM vitrification conditions Cryogen ETHANE
Resolution 3.60 Å
8FW2 Cryo-EM structure of full-length human NLRC4 inflammasome with C11 symmetry Deposited 2023-01-20 Assembly 1 Protein homooligomer Homooligomer；Protein × 3 PDB declaration: trimeric（3） Consistent with protein count
Chain A 1–1024（1024 aa）
Chain B 1–1024（1024 aa）
Chain C 1–1024（1024 aa）
Not recorded No recorded non-water small molecule ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM buffer pH 7.5
cryo-EM vitrification conditions Cryogen ETHANE
Resolution 3.80 Å
8FW9 Cryo-EM structure of full-length human NLRC4 inflammasome with C12 symmetry Deposited 2023-01-20 Assembly 1 Protein homooligomer Homooligomer；Protein × 3 PDB declaration: trimeric（3） Consistent with protein count
Chain A 1–1024（1024 aa）
Chain B 1–1024（1024 aa）
Chain C 1–1024（1024 aa）
Not recorded No recorded non-water small molecule ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM buffer pH 7.5
cryo-EM vitrification conditions Cryogen ETHANE
Resolution 4.46 Å

This page presents structural evidence recorded in PDB/mmCIF.“No recorded non-water small molecule” does not prove that the experimental sample was ligand-free; experimental conditions belong to the PDB experiment, while ligands and copy counts are shown for each biological assembly.