当前蛋白身份:Q9NPP4 重新检索
本组结构的主要差异维度
构建体不同 突变/修饰不同 组装状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量指标不同

差异标签只比较当前检索结果;所有PDB和assembly原始记录仍分别保留。

相关结构差异明细

一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。

PDB 条目 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法 实验环境 结构质量
6K8J Structure of NLRC4 CARD filament 提交 2019-06-12 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 12 PDB 声明:dodecameric(12) 与蛋白数一致
链 A 1–85(85 aa)
链 B 1–85(85 aa)
链 C 1–85(85 aa)
链 D 1–85(85 aa)
链 E 1–85(85 aa)
链 F 1–85(85 aa)
链 G 1–85(85 aa)
链 H 1–85(85 aa)
链 I 1–85(85 aa)
链 J 1–85(85 aa)
链 K 1–85(85 aa)
链 L 1–85(85 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å R-free 0.306
6MKS Cryo-EM structure of NLRC4-CARD filament 提交 2018-09-26 Assembly 1 信息不足 同源多聚体;蛋白 × 31 PDB 声明:31-meric(31) 与蛋白数一致
链 A 1–96(96 aa)
链 B 1–96(96 aa)
链 C 1–96(96 aa)
链 D 1–96(96 aa)
链 E 1–96(96 aa)
链 F 1–96(96 aa)
链 G 1–96(96 aa)
链 H 1–96(96 aa)
链 I 1–96(96 aa)
链 J 1–96(96 aa)
链 K 1–96(96 aa)
链 L 1–96(96 aa)
链 M 1–96(96 aa)
链 N 1–96(96 aa)
链 O 1–96(96 aa)
链 P 1–96(96 aa)
链 Q 1–96(96 aa)
链 R 1–96(96 aa)
链 S 1–96(96 aa)
链 T 1–96(96 aa)
链 U 1–96(96 aa)
链 V 1–96(96 aa)
链 W 1–96(96 aa)
链 X 1–96(96 aa)
链 Y 1–96(96 aa)
链 Z 1–96(96 aa)
链 a 1–96(96 aa)
链 b 1–96(96 aa)
链 c 1–96(96 aa)
链 d 1–96(96 aa)
链 e 1–96(96 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7;20mM HEPES at pH 7.4, 400mM NaCl, 10% glycerol, 1mM EDTA and 1mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
6N1I Cryo-EM structure of NLRC4-CARD filament 提交 2018-11-08 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 16 PDB 声明:hexadecameric(16) 与蛋白数一致
链 A 1–85(85 aa) 片段:CARD (UNP residues 1-85)
链 B 1–85(85 aa) 片段:CARD (UNP residues 1-85)
链 C 1–85(85 aa) 片段:CARD (UNP residues 1-85)
链 D 1–85(85 aa) 片段:CARD (UNP residues 1-85)
链 E 1–85(85 aa) 片段:CARD (UNP residues 1-85)
链 F 1–85(85 aa) 片段:CARD (UNP residues 1-85)
链 G 1–85(85 aa) 片段:CARD (UNP residues 1-85)
链 H 1–85(85 aa) 片段:CARD (UNP residues 1-85)
链 I 1–85(85 aa) 片段:CARD (UNP residues 1-85)
链 J 1–85(85 aa) 片段:CARD (UNP residues 1-85)
链 K 1–85(85 aa) 片段:CARD (UNP residues 1-85)
链 L 1–85(85 aa) 片段:CARD (UNP residues 1-85)
链 M 1–85(85 aa) 片段:CARD (UNP residues 1-85)
链 N 1–85(85 aa) 片段:CARD (UNP residues 1-85)
链 O 1–85(85 aa) 片段:CARD (UNP residues 1-85)
链 P 1–85(85 aa) 片段:CARD (UNP residues 1-85)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.58 Å
8FVU Cryo-EM structure of human Needle/NAIP/NLRC4 (R288A) 提交 2023-01-19 Assembly 1 信息不足 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 B 1–1024(1024 aa)
突变:R288A ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
8FW2 Cryo-EM structure of full-length human NLRC4 inflammasome with C11 symmetry 提交 2023-01-20 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 A 1–1024(1024 aa)
链 B 1–1024(1024 aa)
链 C 1–1024(1024 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
8FW9 Cryo-EM structure of full-length human NLRC4 inflammasome with C12 symmetry 提交 2023-01-20 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 A 1–1024(1024 aa)
链 B 1–1024(1024 aa)
链 C 1–1024(1024 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.46 Å