当前蛋白身份：Q9NR83
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 7DTA Solution structure of the C-clamp domain from human HDBP1 in complex with DNA 提交 2021-01-04 | Assembly 1 蛋白–DNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：trimeric（3） 与全部聚合物一致 |
链 A
355–387（33 aa）
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未记录 | ZN ZINC ION × 1 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 7；298 K；离子强度（mmCIF原始值）10 mM sodium phosphate, 10 mM NaCl；压力 1
NMR样品组成
0.5 mM [U-13C; U-15N] C-clamp, 0.5 mM HD5-DNA, 95% H2O/5% D2O | 95% H2O/5% D2O
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分辨率未提供 |
| 9Z44 Isoreticular co-crystal 1 with symmetrical expanded duplex (31mer) containing insert sequence CCCGGCCGGA and loaded with C-clamp domain 提交 2025-11-08 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric（4） 与全部聚合物一致 |
链 D
355–387（33 aa）
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；298 K；60mM magnesium acetate, 1.8M lithium sulfate, 50mM MES pH 6.5.The crystal was crosslinked with 50 mg/mL EDC overnight, and then looped into a solution of 50mM potassium chloride, 4mM calcium chloride, 10% glycerol, and 10mM Tris hydrochloride for 1 hour. The drop was then supplemented with 90 micromolar C-clamp
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分辨率 7.20 Å R-free 0.345 |