当前蛋白身份：Q9NRY4
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2K85 p190-A RhoGAP FF1 domain 提交 2008-09-02 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
267–331（65 aa）
片段：UNP residues 267-331
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未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 7.2；285 K；离子强度（mmCIF原始值）0.2；压力 ambient
NMR样品组成
1 mM p190-A RhoGAP FF1 domain, 50 mM sodium phosphate, 150 mM sodium chloride, 0.5 mM sodium azide, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
0.5 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] p190-A RhoGAP FF1 domain, 50 mM sodium phosphate, 150 mM sodium chloride, 0.5 mM sodium azide, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
0.5 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] p190-A RhoGAP FF1 domain, 50 mM sodium phosphate, 150 mM sodium chloride, 0.5 mM sodium azide, 100% D2O | 100% D2O
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分辨率未提供 |
| 3C5H Crystal structure of the Ras homolog domain of human GRLF1 (p190RhoGAP) 提交 2008-01-31 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
13–249（237 aa）
片段：Ras homolog domain: Residues 13-249
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未记录 | MG MAGNESIUM ION × 2 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 UNX UNKNOWN LIGAND × 5 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
Native crystal, used for model refinement: 26% PEG 4000, 0.1M Tris-HCl, 0.2M Magnesium chloride, 0.1mM DTT, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 291K
X-ray结晶条件
Seleno-methionine derivative crystal, used for MAD phasing: 33% PEG 4000, 0.1M Tris-HCl, 0.2M Magnesium chloride, 0.1mM DTT, pH 9.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 291K. A ten-fold excess of GppNHp was added to the protein samples prior to crystallization.
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分辨率 1.80 Å R-free 0.247 |
| 3FK2 Crystal structure of the RhoGAP domain of human glucocorticoid receptor DNA-binding factor 1 提交 2008-12-15 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1212–1439（228 aa）
片段：UNP residues 1212-1439
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未记录 | UNX UNKNOWN LIGAND × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；291 K；26% PEG 3350, 0.1M Bis-Tris, 0.2M lithium sulfate, 0.001M DTT, 1:100 (w/w) trypsin, pH 6.0, vapor diffusion, sitting drop, temperature 291K
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分辨率 2.80 Å R-free 0.273 |
| 3FK2 Crystal structure of the RhoGAP domain of human glucocorticoid receptor DNA-binding factor 1 提交 2008-12-15 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1212–1439（228 aa）
片段：UNP residues 1212-1439
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未记录 | UNX UNKNOWN LIGAND × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；291 K；26% PEG 3350, 0.1M Bis-Tris, 0.2M lithium sulfate, 0.001M DTT, 1:100 (w/w) trypsin, pH 6.0, vapor diffusion, sitting drop, temperature 291K
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分辨率 2.80 Å R-free 0.273 |
| 3FK2 Crystal structure of the RhoGAP domain of human glucocorticoid receptor DNA-binding factor 1 提交 2008-12-15 | Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 C
1212–1439（228 aa）
片段：UNP residues 1212-1439
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未记录 | UNX UNKNOWN LIGAND × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；291 K；26% PEG 3350, 0.1M Bis-Tris, 0.2M lithium sulfate, 0.001M DTT, 1:100 (w/w) trypsin, pH 6.0, vapor diffusion, sitting drop, temperature 291K
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分辨率 2.80 Å R-free 0.273 |
| 3FK2 Crystal structure of the RhoGAP domain of human glucocorticoid receptor DNA-binding factor 1 提交 2008-12-15 | Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 D
1212–1439（228 aa）
片段：UNP residues 1212-1439
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未记录 | UNX UNKNOWN LIGAND × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；291 K；26% PEG 3350, 0.1M Bis-Tris, 0.2M lithium sulfate, 0.001M DTT, 1:100 (w/w) trypsin, pH 6.0, vapor diffusion, sitting drop, temperature 291K
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分辨率 2.80 Å R-free 0.273 |
| 6WAY C-terminal SH2 domain of p120RasGAP in complex with p190RhoGAP phosphotyrosine peptide 提交 2020-03-26 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 V
1086–1093（8 aa）
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非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；293 K；1.2 M Sodium citrate tribasic dihydrate, 0.1 M Tris pH 8.5
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分辨率 1.50 Å R-free 0.190 |
| 8DGQ Crystal structure of p120RasGAP SH2-SH3-SH2 in complex with p190RhoGAP doubly phosphorylated peptide 提交 2022-06-24 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 U
1083–1111（29 aa）
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非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | MLI MALONATE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5；293 K；0.5 M Sodium Malonate pH 5.0, 0.1 M sodium acetate trihydrate salt, 6% PEG 20,000
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分辨率 1.95 Å R-free 0.256 |
| 8DGQ Crystal structure of p120RasGAP SH2-SH3-SH2 in complex with p190RhoGAP doubly phosphorylated peptide 提交 2022-06-24 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 V
1083–1111（29 aa）
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非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | MLI MALONATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5；293 K；0.5 M Sodium Malonate pH 5.0, 0.1 M sodium acetate trihydrate salt, 6% PEG 20,000
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分辨率 1.95 Å R-free 0.256 |