当前蛋白身份：Q9NT62
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 4NAW Crystal Structure of Human ATG12~ATG5-ATG16N in complex with a fragment of ATG3 提交 2013-10-22 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 D
140–170（31 aa）
片段：UNP residues 140-170
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 2 NA SODIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；PROTEIN - 10 MG/ML in 0.01M HEPES pH 7.0, 0.15 M NaCl, 0.001 M DTT, RESERVOIR - 0.1M MES pH6.0-6.75, 0.2 M ammonium sulfate, 10-16% PEG 5000 MME, vapor diffusion, sitting drop, temperature 293K
|
分辨率 2.19 Å R-free 0.215 |
| 4NAW Crystal Structure of Human ATG12~ATG5-ATG16N in complex with a fragment of ATG3 提交 2013-10-22 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 H
140–170（31 aa）
片段：UNP residues 140-170
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 2 NA SODIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；PROTEIN - 10 MG/ML in 0.01M HEPES pH 7.0, 0.15 M NaCl, 0.001 M DTT, RESERVOIR - 0.1M MES pH6.0-6.75, 0.2 M ammonium sulfate, 10-16% PEG 5000 MME, vapor diffusion, sitting drop, temperature 293K
|
分辨率 2.19 Å R-free 0.215 |
| 4NAW Crystal Structure of Human ATG12~ATG5-ATG16N in complex with a fragment of ATG3 提交 2013-10-22 | Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 L
140–170（31 aa）
片段：UNP residues 140-170
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未记录 | SO4 SULFATE ION × 4 NA SODIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；PROTEIN - 10 MG/ML in 0.01M HEPES pH 7.0, 0.15 M NaCl, 0.001 M DTT, RESERVOIR - 0.1M MES pH6.0-6.75, 0.2 M ammonium sulfate, 10-16% PEG 5000 MME, vapor diffusion, sitting drop, temperature 293K
|
分辨率 2.19 Å R-free 0.215 |
| 4NAW Crystal Structure of Human ATG12~ATG5-ATG16N in complex with a fragment of ATG3 提交 2013-10-22 | Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 P
140–170（31 aa）
片段：UNP residues 140-170
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未记录 | SO4 SULFATE ION × 3 NA SODIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；PROTEIN - 10 MG/ML in 0.01M HEPES pH 7.0, 0.15 M NaCl, 0.001 M DTT, RESERVOIR - 0.1M MES pH6.0-6.75, 0.2 M ammonium sulfate, 10-16% PEG 5000 MME, vapor diffusion, sitting drop, temperature 293K
|
分辨率 2.19 Å R-free 0.215 |
| 8FKM Human Atg3 with deletions of residues 1 to 25 and 90 to 190 提交 2022-12-21 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–314（314 aa）
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未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 6.5；298 K；离子强度（mmCIF原始值）NaCl 150；压力 1
NMR样品组成
150 mM NaCl, 50 mM HEPES, 2 mM TCEP, 0.5 mM [U-13C; U-15N] human Atg3, 96% H2O/4% D2O | 96% H2O/4% D2O
NMR样品组成
150 mM NaCl, 50 mM HEPES, 2 mM TCEP, 0.5 mM [U-13C; U-15N] human Atg3, 6.5 mg/mL Pf1 phage, 96% H2O/4% D2O | 96% H2O/4% D2O
NMR样品组成
150 mM NaCl, 50 mM HEPES, 2 mM TCEP, 0.5 mM [U-13C; U-15N] human Atg3, 7 % positive gel, 96% H2O/4% D2O | 96% H2O/4% D2O
NMR样品组成
150 mM NaCl, 50 mM HEPES, 2 mM TCEP, 0.5 mM [U-13C; U-15N] human Atg3, 5 % negative gel, 96% H2O/4% D2O | 96% H2O/4% D2O
NMR样品组成
150 mM NaCl, 50 mM HEPES, 2 mM TCEP, 0.5 mM [U-13C; U-15N] human Atg3, 5 % neutral gel, 96% H2O/4% D2O | 96% H2O/4% D2O
NMR样品组成
150 mM NaCl, 50 mM HEPES, 2 mM TCEP, 0.5 mM [U-13C; U-15N] human Atg3, 100% D2O | 100% D2O
NMR样品组成
150 mM NaCl, 50 mM HEPES, 2 mM TCEP, 0.5 mM [U-13C; U-15N] human Atg3, 92% H2O/8% D2O | 92% H2O/8% D2O
|
分辨率未提供 |
| 9E8P Crystal Structure of GABARAP-ATG3 conjugate 提交 2024-11-05 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
26–91（66 aa）
链 A
148–181（34 aa）
链 A
193–314（122 aa）
|
突变：C264K 突变：C264K 突变：C264K | SO4 SULFATE ION × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；277.15 K；0.1 mM Tris pH8.5, 25%(w/v) PEG3550
|
分辨率 2.70 Å R-free 0.249 |
| 9E8P Crystal Structure of GABARAP-ATG3 conjugate 提交 2024-11-05 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
26–91（66 aa）
链 B
148–181（34 aa）
链 B
193–314（122 aa）
|
突变：C264K 突变：C264K 突变：C264K | EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；277.15 K；0.1 mM Tris pH8.5, 25%(w/v) PEG3550
|
分辨率 2.70 Å R-free 0.249 |