当前蛋白身份：Q9NWF9
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 7M4M Crystal structure of RBR E3 ligase RNF216 with ubiquitin 提交 2021-03-21 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
510–784（275 aa）
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未记录 | ZN ZINC ION × 5 GOL GLYCEROL × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；293 K；15% PEG 6000, 0.18 M NaCl, 0.09 M Na HEPES pH7.0, 0.1 M KCl
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分辨率 2.39 Å R-free 0.247 |
| 7M4M Crystal structure of RBR E3 ligase RNF216 with ubiquitin 提交 2021-03-21 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
510–784（275 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 5 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；293 K；15% PEG 6000, 0.18 M NaCl, 0.09 M Na HEPES pH7.0, 0.1 M KCl
|
分辨率 2.39 Å R-free 0.247 |
| 7M4N Crystal structure of RBR E3 ligase RNF216 in complex with K63-linked di-ubiquitin 提交 2021-03-21 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
649–784（136 aa）
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突变：C688A | ZN ZINC ION × 3 SO4 SULFATE ION × 4 GOL GLYCEROL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.9；293 K；0.2M ammonium sulfate, 30% PEG 4000
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分辨率 2.52 Å R-free 0.273 |
| 7M4N Crystal structure of RBR E3 ligase RNF216 in complex with K63-linked di-ubiquitin 提交 2021-03-21 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 B
649–784（136 aa）
|
突变：C688A | ZN ZINC ION × 3 SO4 SULFATE ION × 4 GOL GLYCEROL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.9；293 K；0.2M ammonium sulfate, 30% PEG 4000
|
分辨率 2.52 Å R-free 0.273 |
| 7M4O Crystal structure of phosphorylated RBR E3 ligase RNF216 in complex with K63-linked di-ubiquitin 提交 2021-03-21 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
649–784（136 aa）
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突变：C688A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | ZN ZINC ION × 3 SO4 SULFATE ION × 3 GOL GLYCEROL × 3 PG0 2-(2-METHOXYETHOXY)ETHANOL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 5.22；293 K；0.259 M ammonium sulfate, 30.1 % PEG monomethyl ether 2000, 0.1M sodium acetate-acetic acid pH 5.22
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分辨率 2.21 Å R-free 0.252 |
| 8EB0 RNF216/E2-Ub/Ub transthiolation complex 提交 2022-08-30 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
510–784（275 aa）
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突变：C688A | ZN ZINC ION × 7 SO4 SULFATE ION × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.9；293 K；2 M ammonium sulfate
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分辨率 3.03 Å R-free 0.339 |