当前蛋白身份:Q9NXF1 重新检索
本组结构的主要差异维度
组装状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量指标不同

差异标签只比较当前检索结果;所有PDB和assembly原始记录仍分别保留。

相关结构差异明细

一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。

PDB 条目 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法 实验环境 结构质量
8FL2 Human nuclear pre-60S ribosomal subunit (State I1) 提交 2022-12-21 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 61 PDB 声明:65-meric(65) 与全部聚合物一致
链 NU 1–929(929 aa)
未记录 MG MAGNESIUM ION × 100 ZN ZINC ION × 5 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 K POTASSIUM ION × 2 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE;Four applications with manual blotting before last blotting with the vitrobot.
分辨率 2.67 Å
8FL3 Human nuclear pre-60S ribosomal subunit (State I2) 提交 2022-12-21 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 60 PDB 声明:63-meric(63) 与全部聚合物一致
链 NU 1–929(929 aa)
未记录 MG MAGNESIUM ION × 100 ZN ZINC ION × 5 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 K POTASSIUM ION × 2 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE;Four applications with manual blotting before last blotting with the vitrobot.
分辨率 2.53 Å
8FL4 Human nuclear pre-60S ribosomal subunit (State I3) 提交 2022-12-21 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 59 PDB 声明:62-meric(62) 与全部聚合物一致
链 NU 1–929(929 aa)
未记录 MG MAGNESIUM ION × 99 ZN ZINC ION × 5 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 K POTASSIUM ION × 2 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE;Four applications with manual blotting before last blotting with the vitrobot.
分辨率 2.89 Å
9DUM Human PELP1-WDR18-TEX10 complex 提交 2024-10-03 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric(6) 与蛋白数一致
链 G 1–929(929 aa)
链 H 1–929(929 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8;20mM Hepes pH8.0, 400mM NaCl, 5mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.56 Å