当前蛋白身份：Q9NZ52
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一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1JPL GGA3 VHS domain complexed with C-terminal peptide from cation-independent mannose 6-phosphate receptor 提交 2001-08-02 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–166（166 aa）
片段：VHS domain
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 10.6；293 K；1.5M Sodium/Potassium Phosphate, 200mM Lithium Sulfate, pH 10.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.257 |
| 1JPL GGA3 VHS domain complexed with C-terminal peptide from cation-independent mannose 6-phosphate receptor 提交 2001-08-02 | Assembly 10 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
1–166（166 aa）
片段：VHS domain
链 B
1–166（166 aa）
片段：VHS domain
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 10.6；293 K；1.5M Sodium/Potassium Phosphate, 200mM Lithium Sulfate, pH 10.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.257 |
| 1JPL GGA3 VHS domain complexed with C-terminal peptide from cation-independent mannose 6-phosphate receptor 提交 2001-08-02 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
1–166（166 aa）
片段：VHS domain
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 10.6；293 K；1.5M Sodium/Potassium Phosphate, 200mM Lithium Sulfate, pH 10.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.257 |
| 1JPL GGA3 VHS domain complexed with C-terminal peptide from cation-independent mannose 6-phosphate receptor 提交 2001-08-02 | Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 C
1–166（166 aa）
片段：VHS domain
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 10.6；293 K；1.5M Sodium/Potassium Phosphate, 200mM Lithium Sulfate, pH 10.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.257 |
| 1JPL GGA3 VHS domain complexed with C-terminal peptide from cation-independent mannose 6-phosphate receptor 提交 2001-08-02 | Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 D
1–166（166 aa）
片段：VHS domain
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 10.6；293 K；1.5M Sodium/Potassium Phosphate, 200mM Lithium Sulfate, pH 10.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.257 |
| 1JPL GGA3 VHS domain complexed with C-terminal peptide from cation-independent mannose 6-phosphate receptor 提交 2001-08-02 | Assembly 5 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8） 与蛋白数一致 |
链 A
1–166（166 aa）
片段：VHS domain
链 B
1–166（166 aa）
片段：VHS domain
链 C
1–166（166 aa）
片段：VHS domain
链 D
1–166（166 aa）
片段：VHS domain
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 10.6；293 K；1.5M Sodium/Potassium Phosphate, 200mM Lithium Sulfate, pH 10.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.257 |
| 1JPL GGA3 VHS domain complexed with C-terminal peptide from cation-independent mannose 6-phosphate receptor 提交 2001-08-02 | Assembly 6 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8） 与蛋白数一致 |
链 A
1–166（166 aa）
片段：VHS domain
链 B
1–166（166 aa）
片段：VHS domain
链 C
1–166（166 aa）
片段：VHS domain
链 D
1–166（166 aa）
片段：VHS domain
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 10.6；293 K；1.5M Sodium/Potassium Phosphate, 200mM Lithium Sulfate, pH 10.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.257 |
| 1JPL GGA3 VHS domain complexed with C-terminal peptide from cation-independent mannose 6-phosphate receptor 提交 2001-08-02 | Assembly 7 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8） 与蛋白数一致 |
链 A
1–166（166 aa）
片段：VHS domain
链 B
1–166（166 aa）
片段：VHS domain
链 C
1–166（166 aa）
片段：VHS domain
链 D
1–166（166 aa）
片段：VHS domain
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 10.6；293 K；1.5M Sodium/Potassium Phosphate, 200mM Lithium Sulfate, pH 10.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.257 |
| 1JPL GGA3 VHS domain complexed with C-terminal peptide from cation-independent mannose 6-phosphate receptor 提交 2001-08-02 | Assembly 8 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8） 与蛋白数一致 |
链 A
1–166（166 aa）
片段：VHS domain
链 B
1–166（166 aa）
片段：VHS domain
链 C
1–166（166 aa）
片段：VHS domain
链 D
1–166（166 aa）
片段：VHS domain
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 10.6；293 K；1.5M Sodium/Potassium Phosphate, 200mM Lithium Sulfate, pH 10.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.257 |
| 1JPL GGA3 VHS domain complexed with C-terminal peptide from cation-independent mannose 6-phosphate receptor 提交 2001-08-02 | Assembly 9 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 C
1–166（166 aa）
片段：VHS domain
链 D
1–166（166 aa）
片段：VHS domain
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 10.6；293 K；1.5M Sodium/Potassium Phosphate, 200mM Lithium Sulfate, pH 10.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.257 |
| 1JUQ GGA3 VHS domain complexed with C-terminal peptide from cation-dependent Mannose 6-phosphate receptor 提交 2001-08-26 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–166（166 aa）
片段：VHS domain
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；Sodium/Potassium phosphate, Lithium Sulfate, CAPS, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.254 |
| 1JUQ GGA3 VHS domain complexed with C-terminal peptide from cation-dependent Mannose 6-phosphate receptor 提交 2001-08-26 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
1–166（166 aa）
片段：VHS domain
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；Sodium/Potassium phosphate, Lithium Sulfate, CAPS, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.254 |
| 1JUQ GGA3 VHS domain complexed with C-terminal peptide from cation-dependent Mannose 6-phosphate receptor 提交 2001-08-26 | Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 C
1–166（166 aa）
片段：VHS domain
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；Sodium/Potassium phosphate, Lithium Sulfate, CAPS, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.254 |
| 1JUQ GGA3 VHS domain complexed with C-terminal peptide from cation-dependent Mannose 6-phosphate receptor 提交 2001-08-26 | Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 D
1–166（166 aa）
片段：VHS domain
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；Sodium/Potassium phosphate, Lithium Sulfate, CAPS, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.254 |
| 1JUQ GGA3 VHS domain complexed with C-terminal peptide from cation-dependent Mannose 6-phosphate receptor 提交 2001-08-26 | Assembly 5 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8） 与蛋白数一致 |
链 A
1–166（166 aa）
片段：VHS domain
链 B
1–166（166 aa）
片段：VHS domain
链 C
1–166（166 aa）
片段：VHS domain
链 D
1–166（166 aa）
片段：VHS domain
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；Sodium/Potassium phosphate, Lithium Sulfate, CAPS, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.254 |
| 1JUQ GGA3 VHS domain complexed with C-terminal peptide from cation-dependent Mannose 6-phosphate receptor 提交 2001-08-26 | Assembly 6 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 A
1–166（166 aa）
片段：VHS domain
链 B
1–166（166 aa）
片段：VHS domain
链 C
1–166（166 aa）
片段：VHS domain
链 D
1–166（166 aa）
片段：VHS domain
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；Sodium/Potassium phosphate, Lithium Sulfate, CAPS, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.254 |
| 1LF8 Complex of GGA3-VHS Domain and CI-MPR C-terminal Phosphopeptide 提交 2002-04-10 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–166（166 aa）
片段：VHS domain (residues 1-166)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；100mM CAPS 10.2-11.0, 200 mM Lithium Sulfate, 1.3-2M Sodium/Potassium phosphate, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.255 |
| 1LF8 Complex of GGA3-VHS Domain and CI-MPR C-terminal Phosphopeptide 提交 2002-04-10 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
1–166（166 aa）
片段：VHS domain (residues 1-166)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；100mM CAPS 10.2-11.0, 200 mM Lithium Sulfate, 1.3-2M Sodium/Potassium phosphate, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.255 |
| 1LF8 Complex of GGA3-VHS Domain and CI-MPR C-terminal Phosphopeptide 提交 2002-04-10 | Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 C
1–166（166 aa）
片段：VHS domain (residues 1-166)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；100mM CAPS 10.2-11.0, 200 mM Lithium Sulfate, 1.3-2M Sodium/Potassium phosphate, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.255 |
| 1LF8 Complex of GGA3-VHS Domain and CI-MPR C-terminal Phosphopeptide 提交 2002-04-10 | Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 D
1–166（166 aa）
片段：VHS domain (residues 1-166)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；100mM CAPS 10.2-11.0, 200 mM Lithium Sulfate, 1.3-2M Sodium/Potassium phosphate, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.255 |
| 1P4U CRYSTAL STRUCTURE OF GGA3 GAE DOMAIN IN COMPLEX WITH RABAPTIN-5 PEPTIDE 提交 2003-04-24 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
571–723（153 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 6.5；1.6M sodium citrate, pH 6.5
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.255 |
| 1P4U CRYSTAL STRUCTURE OF GGA3 GAE DOMAIN IN COMPLEX WITH RABAPTIN-5 PEPTIDE 提交 2003-04-24 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
571–723（153 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 6.5；1.6M sodium citrate, pH 6.5
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.255 |
| 1WR6 Crystal structure of GGA3 GAT domain in complex with ubiquitin 提交 2004-10-12 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
209–319（111 aa）
片段：C-GAT domain(RESIDUES 209-319)
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；PEG3350, Ammonium formate, MES, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.290 |
| 1WR6 Crystal structure of GGA3 GAT domain in complex with ubiquitin 提交 2004-10-12 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
209–319（111 aa）
片段：C-GAT domain(RESIDUES 209-319)
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；PEG3350, Ammonium formate, MES, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.290 |
| 1WR6 Crystal structure of GGA3 GAT domain in complex with ubiquitin 提交 2004-10-12 | Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 C
209–319（111 aa）
片段：C-GAT domain(RESIDUES 209-319)
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；PEG3350, Ammonium formate, MES, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.290 |
| 1WR6 Crystal structure of GGA3 GAT domain in complex with ubiquitin 提交 2004-10-12 | Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 D
209–319（111 aa）
片段：C-GAT domain(RESIDUES 209-319)
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；PEG3350, Ammonium formate, MES, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.290 |
| 1YD8 COMPLEX OF HUMAN GGA3 GAT DOMAIN AND UBIQUITIN 提交 2004-12-23 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 H
208–301（94 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 2.80 Å R-free 0.297 |
| 1YD8 COMPLEX OF HUMAN GGA3 GAT DOMAIN AND UBIQUITIN 提交 2004-12-23 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 G
208–301（94 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 2.80 Å R-free 0.297 |