当前蛋白身份:Q9NZZ3 重新检索
本组结构的主要差异维度
构建体不同 突变/修饰不同 组装状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量指标不同

差异标签只比较当前检索结果;所有PDB和assembly原始记录仍分别保留。

相关结构差异明细

一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。

PDB 条目 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法 实验环境 结构质量
2LXM Lip5-chmp5 提交 2012-08-29 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 B 139–195(57 aa) 片段:UNP residues 139-195
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 6.3;298 K;离子强度(mmCIF原始值)75;压力 ambient
NMR样品组成 0.5 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] LIP5(1-168), 0.5 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] CHMP5(139-195), 25 mM sodium phosphate, 50 mM sodium chloride, 0.5 mM DTT, 0.1 mM EDTA, 92% H2O/8% D2O | 92% H2O/8% D2O
分辨率未提供
3ULY Crystal Structure of BROX Bro1 Domain in Complex with the C-Terminal Tails of CHMP5 提交 2011-11-11 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致
链 B 151–219(69 aa) 片段:C-terminal tails of CHMP5 151-219
未记录 GOL GLYCEROL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.5;291 K;20% PEG 8000, 0.1M sodium cacodylate, 0.2M magnesium acetate, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
分辨率 2.60 Å R-free 0.211
3ULY Crystal Structure of BROX Bro1 Domain in Complex with the C-Terminal Tails of CHMP5 提交 2011-11-11 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 B 151–219(69 aa) 片段:C-terminal tails of CHMP5 151-219
未记录 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.5;291 K;20% PEG 8000, 0.1M sodium cacodylate, 0.2M magnesium acetate, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
分辨率 2.60 Å R-free 0.211
3UM0 Crystal structure of the Brox Bro1 domain in complex with the C-terminal tail of CHMP5 提交 2011-11-11 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致
链 B 200–219(20 aa) 片段:Synthetic peptide of C-terminal tail of CHMP5 200-219
未记录 GOL GLYCEROL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.5;291 K;20% PEG 8000, 0.1M sodium cacodylate, 0.2M magnesium acetate, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
分辨率 3.10 Å R-free 0.257
3UM0 Crystal structure of the Brox Bro1 domain in complex with the C-terminal tail of CHMP5 提交 2011-11-11 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 B 200–219(20 aa) 片段:Synthetic peptide of C-terminal tail of CHMP5 200-219
未记录 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.5;291 K;20% PEG 8000, 0.1M sodium cacodylate, 0.2M magnesium acetate, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
分辨率 3.10 Å R-free 0.257
3UM1 Crystal structure of the Brox Bro1 domain in complex with the C-terminal tail of CHMP5 提交 2011-11-11 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致
链 B 151–219(69 aa) 片段:C-terminal tail of CHMP5 151-219
链 E 151–219(69 aa) 片段:C-terminal tail of CHMP5 151-219
未记录 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.5;291 K;20% PEG 8000, 0.1M sodium cacodylate, 0.2M magnesium acetate , pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
分辨率 2.71 Å R-free 0.251
3UM2 Crystal structure of the Brox Bro1 domain in complex with the C-terminal tail of CHMP5 提交 2011-11-12 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致
链 B 200–219(20 aa) 片段:Synthetic peptide of C-terminal tail of CHMP5 200-219
链 E 200–219(20 aa) 片段:Synthetic peptide of C-terminal tail of CHMP5 200-219
未记录 GOL GLYCEROL × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.5;291 K;20% PEG 8000, 0.1M sodium cacodylate, 0.2M magnesium acetate, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
分辨率 2.59 Å R-free 0.241
4TXR Crystal structure of LIP5 N-terminal domain complexed with CHMP1B MIM and CHMP5 MIM 提交 2014-07-04 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 C 139–195(57 aa) 片段:UNP residues 139-195
未记录 ACT ACETATE ION × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 9 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 5.5;277.15 K;19% PEG 4000, 0.025 M sodium acetate
分辨率 1.00 Å R-free 0.180