当前蛋白身份：Q9P0U3
重新检索
差异标签只比较当前检索结果；所有PDB和assembly原始记录仍分别保留。
相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2CKG The structure of SENP1 SUMO-2 co-complex suggests a structural basis for discrimination between SUMO paralogues during processing 提交 2006-04-18 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
419–643（225 aa）
片段：RESIDUES 419-643
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 4.5；pH 4.50
|
分辨率 2.45 Å R-free 0.279 |
| 2CKG The structure of SENP1 SUMO-2 co-complex suggests a structural basis for discrimination between SUMO paralogues during processing 提交 2006-04-18 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
419–643（225 aa）
片段：RESIDUES 419-643
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 4.5；pH 4.50
|
分辨率 2.45 Å R-free 0.279 |
| 2CKH SENP1-SUMO2 complex 提交 2006-04-18 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
419–643（225 aa）
片段：PROTEASE DOMAIN, RESIDUES 419-643
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 5；pH 5.00
|
分辨率 3.20 Å R-free 0.294 |
| 2G4D Crystal structure of human SENP1 mutant (C603S) in complex with SUMO-1 提交 2006-02-22 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
440–643（204 aa）
片段：protease catalytic domain
|
突变：C603S | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 10.5；289 K；0.1M CAPS, 40% PEG400, pH 10.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 289K
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.278 |
| 2G4D Crystal structure of human SENP1 mutant (C603S) in complex with SUMO-1 提交 2006-02-22 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 C
440–643（204 aa）
片段：protease catalytic domain
|
突变：C603S | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 10.5；289 K；0.1M CAPS, 40% PEG400, pH 10.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 289K
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.278 |
| 2IY0 SENP1 (mutant) SUMO1 RanGAP 提交 2006-07-11 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
419–592（174 aa）
片段：C-TERMINAL FRAGMENT, RESIDUES 419-643
链 A
593–643（51 aa）
片段：C-TERMINAL FRAGMENT, RESIDUES 419-643
|
突变：YES 突变：YES | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 2.77 Å R-free 0.279 |
| 2IY1 SENP1 (mutant) full length SUMO1 提交 2006-07-11 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
419–592（174 aa）
片段：C-TERMINAL FRAGMENT, RESIDUES 419-643
链 A
593–643（51 aa）
片段：C-TERMINAL FRAGMENT, RESIDUES 419-643
|
突变：YES 突变：YES | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 2.46 Å R-free 0.281 |
| 2IY1 SENP1 (mutant) full length SUMO1 提交 2006-07-11 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 C
419–592（174 aa）
片段：C-TERMINAL FRAGMENT, RESIDUES 419-643
链 C
593–643（51 aa）
片段：C-TERMINAL FRAGMENT, RESIDUES 419-643
|
突变：YES 突变：YES | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 2.46 Å R-free 0.281 |
| 2IYC SENP1 native structure 提交 2006-07-14 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
419–592（174 aa）
片段：CATALYTIC FRAGMENT, RESIDUES 419-643
链 A
593–643（51 aa）
片段：CATALYTIC FRAGMENT, RESIDUES 419-643
链 B
419–592（174 aa）
片段：CATALYTIC FRAGMENT, RESIDUES 419-643
链 B
593–643（51 aa）
片段：CATALYTIC FRAGMENT, RESIDUES 419-643
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 2.45 Å R-free 0.267 |
| 2IYD SENP1 covalent complex with SUMO-2 提交 2006-07-14 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
419–592（174 aa）
片段：CATALYTIC FRAGMENT, RESIDUES 419-643
链 A
593–643（51 aa）
片段：CATALYTIC FRAGMENT, RESIDUES 419-643
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 3.20 Å R-free 0.288 |
| 2XPH Crystal structure of human SENP1 with the bound cobalt 提交 2010-08-26 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
415–644（230 aa）
片段：CATALYTIC FRAGMENT, RESIDUES 415-644
|
未记录 | GOL GLYCEROL × 5 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
CRYSTALS FORMED FROM 1 TO 1 OF RESERVOIR SOLUTION (1.8 M AMMONIUM SULFATE, 50 MM COCL2 AND 100 MM MES PH 6.5) AND PROTEIN SOLUTION (20 MG/ML IN 20 MM TRIS/HCL (PH 8.0), AND 50 MM NACL).
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.313 |
| 2XPH Crystal structure of human SENP1 with the bound cobalt 提交 2010-08-26 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
415–644（230 aa）
片段：CATALYTIC FRAGMENT, RESIDUES 415-644
|
未记录 | GOL GLYCEROL × 1 CO COBALT (II) ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
CRYSTALS FORMED FROM 1 TO 1 OF RESERVOIR SOLUTION (1.8 M AMMONIUM SULFATE, 50 MM COCL2 AND 100 MM MES PH 6.5) AND PROTEIN SOLUTION (20 MG/ML IN 20 MM TRIS/HCL (PH 8.0), AND 50 MM NACL).
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.313 |
| 2XRE Detection of cobalt in previously unassigned human SENP1 structure 提交 2010-09-14 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
415–644（230 aa）
片段：CATALYTIC FRAGMENT, RESIDUES 415-644
链 B
415–644（230 aa）
片段：CATALYTIC FRAGMENT, RESIDUES 415-644
|
未记录 | GOL GLYCEROL × 10 CO COBALT (II) ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；CRYSTALLIZATION WAS PERFORMED USING A SITTING-DROP VAPOUR-DIFFUSION METHOD. CRYSTALS APPEARED FROM EQUAL VOLUMES OF PROTEIN SOLUTION (20 MG/ML IN 20 MM TRIS/HCL, PH 8.0, AND 50 MM NACL) AND RESERVOIR SOLUTION CONTAINING 100 MM COCL2, 0.1M MES, PH 6.5, AND 1.8 M (NH4)2SO4.
|
分辨率 2.45 Å R-free 0.317 |
| 2XRE Detection of cobalt in previously unassigned human SENP1 structure 提交 2010-09-14 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
415–644（230 aa）
片段：CATALYTIC FRAGMENT, RESIDUES 415-644
链 B
415–644（230 aa）
片段：CATALYTIC FRAGMENT, RESIDUES 415-644
|
未记录 | GOL GLYCEROL × 10 CO COBALT (II) ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；CRYSTALLIZATION WAS PERFORMED USING A SITTING-DROP VAPOUR-DIFFUSION METHOD. CRYSTALS APPEARED FROM EQUAL VOLUMES OF PROTEIN SOLUTION (20 MG/ML IN 20 MM TRIS/HCL, PH 8.0, AND 50 MM NACL) AND RESERVOIR SOLUTION CONTAINING 100 MM COCL2, 0.1M MES, PH 6.5, AND 1.8 M (NH4)2SO4.
|
分辨率 2.45 Å R-free 0.317 |
| 2XRE Detection of cobalt in previously unassigned human SENP1 structure 提交 2010-09-14 | Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
415–644（230 aa）
片段：CATALYTIC FRAGMENT, RESIDUES 415-644
|
未记录 | GOL GLYCEROL × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；CRYSTALLIZATION WAS PERFORMED USING A SITTING-DROP VAPOUR-DIFFUSION METHOD. CRYSTALS APPEARED FROM EQUAL VOLUMES OF PROTEIN SOLUTION (20 MG/ML IN 20 MM TRIS/HCL, PH 8.0, AND 50 MM NACL) AND RESERVOIR SOLUTION CONTAINING 100 MM COCL2, 0.1M MES, PH 6.5, AND 1.8 M (NH4)2SO4.
|
分辨率 2.45 Å R-free 0.317 |
| 2XRE Detection of cobalt in previously unassigned human SENP1 structure 提交 2010-09-14 | Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
415–644（230 aa）
片段：CATALYTIC FRAGMENT, RESIDUES 415-644
|
未记录 | GOL GLYCEROL × 6 CO COBALT (II) ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；CRYSTALLIZATION WAS PERFORMED USING A SITTING-DROP VAPOUR-DIFFUSION METHOD. CRYSTALS APPEARED FROM EQUAL VOLUMES OF PROTEIN SOLUTION (20 MG/ML IN 20 MM TRIS/HCL, PH 8.0, AND 50 MM NACL) AND RESERVOIR SOLUTION CONTAINING 100 MM COCL2, 0.1M MES, PH 6.5, AND 1.8 M (NH4)2SO4.
|
分辨率 2.45 Å R-free 0.317 |
| 6NNQ Non-covalent structure of SENP1 in complex with SUMO2 提交 2019-01-15 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
421–643（223 aa）
片段：residues 421-643
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293.15 K；20% PEG 6000, 0.1M HEPES, pH 7.5
|
分辨率 2.62 Å R-free 0.277 |