当前蛋白身份:Q9P2H5 重新检索
本组结构的主要差异维度
构建体不同 突变/修饰不同 组装状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量指标不同

差异标签只比较当前检索结果;所有PDB和assembly原始记录仍分别保留。

相关结构差异明细

一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。

PDB 条目 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法 实验环境 结构质量
5TXK CRYSTAL STRUCTURE OF USP35 C450S IN COMPLEX WITH UBIQUITIN 提交 2016-11-17 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 423–603(181 aa) 片段:UNP residues 432-603,UNP residues 754-944
链 A 754–944(191 aa) 片段:UNP residues 432-603,UNP residues 754-944
未记录 SO4 SULFATE ION × 3 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3 ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6;296 K;0.95 M ammonium sulphate 0.1 M HEPES
分辨率 1.84 Å R-free 0.183
7Q44 Crystal structure of RCC1-Like domain 2 of ubiquitin ligase HERC2 in complex with DXDKDED motif of deubiquitinase USP35 提交 2021-10-29 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 B 988–1002(15 aa)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8;293.15 K;20% PEG 3350 0.18M tris amonium citrate
分辨率 2.20 Å R-free 0.231
7Q44 Crystal structure of RCC1-Like domain 2 of ubiquitin ligase HERC2 in complex with DXDKDED motif of deubiquitinase USP35 提交 2021-10-29 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 D 988–1002(15 aa)
未记录 CIT CITRIC ACID × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8;293.15 K;20% PEG 3350 0.18M tris amonium citrate
分辨率 2.20 Å R-free 0.231
7Q44 Crystal structure of RCC1-Like domain 2 of ubiquitin ligase HERC2 in complex with DXDKDED motif of deubiquitinase USP35 提交 2021-10-29 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 F 988–1002(15 aa)
未记录 CIT CITRIC ACID × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8;293.15 K;20% PEG 3350 0.18M tris amonium citrate
分辨率 2.20 Å R-free 0.231
9F19 Human USP30 chimera in complex with NK036 inhibitor 提交 2024-04-18 Assembly 1 信息不足 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 833–845(13 aa)
链 B 833–845(13 aa)
未记录 A1H8X 4-fluoranyl-~{N}-[(2~{S})-1-[[4-[(2-methyl-1-oxidanyl-propan-2-yl)sulfamoyl]phenyl]amino]-1-oxidanylidene-3-phenyl-propan-2-yl]benzamide × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;76 mM NaOH, 100 mM Bicine, 10.2% (w/v) PEG 20,000, 1% (v/v) Dioxane, 10 mM L-Proline (Crystal 1)
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;85 mM NaOH, 100 mM Bicine, 10.2% (w/v) PEG 20,000, 1% (v/v) Dioxane, 10 mM L-Proline (Crystal 2)
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;88 mM NaOH, 100 mM Bicine, 11% (w/v) PEG 20,000, 1% (v/v) Dioxane, 10 mM Sarcosine (Crystal 3)
分辨率 2.75 Å R-free 0.266
9F6G Human USP30 chimera bound to Ubiquitin-PA 提交 2024-05-01 Assembly 1 信息不足 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 833–845(13 aa)
未记录 AYE prop-2-en-1-amine × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7;293 K;0.56 M sodium citrate pH 7.0
分辨率 1.50 Å R-free 0.211