当前蛋白身份：Q9R194
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一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 4I6E A vertebrate cryptochrome 提交 2012-11-29 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–512（512 aa）
片段：UNP residues 1-512
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277 K；0.1M MES-imadzole, pH6.5,
7.2% PEG8000,
20% Ethylene glycol (v/v),
0.03M NaF,NaBr,NaI, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 2.70 Å R-free 0.287 |
| 4I6G a vertebrate cryptochrome with FAD 提交 2012-11-29 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–512（512 aa）
片段：UNP residues 1-512
|
未记录 | FAD FLAVIN-ADENINE DINUCLEOTIDE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277 K；0.1M MES-imadzole, pH 6.5,
7.2% PEG8000,
20% ethylene glyco(v/v),
0.03M NaF,NaBr,NaI, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.238 |
| 4I6G a vertebrate cryptochrome with FAD 提交 2012-11-29 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1–512（512 aa）
片段：UNP residues 1-512
|
未记录 | FAD FLAVIN-ADENINE DINUCLEOTIDE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277 K；0.1M MES-imadzole, pH 6.5,
7.2% PEG8000,
20% ethylene glyco(v/v),
0.03M NaF,NaBr,NaI, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.238 |
| 4I6J A ubiquitin ligase-substrate complex 提交 2012-11-29 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
1–544（544 aa）
片段：UNP residues 1-544
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；277 K；0.2M ammonium citrate,
13-14% PEG3350
7% Acetonitrile, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 2.70 Å R-free 0.265 |
| 4MLP Mammalian cryptochrome in complex with a small molecule competitor of its ubiquitin ligase 提交 2013-09-06 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 C
1–512（512 aa）
片段：photolyase homology region UNP residues 1-512
|
未记录 | 2CX N-[(2S)-3-(9H-carbazol-9-yl)-2-hydroxypropyl]-N-(furan-2-ylmethyl)methanesulfonamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277 K；0.1 M MES and 4-5% PEG8K, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 1.94 Å R-free 0.217 |
| 4MLP Mammalian cryptochrome in complex with a small molecule competitor of its ubiquitin ligase 提交 2013-09-06 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–512（512 aa）
片段：photolyase homology region UNP residues 1-512
|
未记录 | 2CX N-[(2S)-3-(9H-carbazol-9-yl)-2-hydroxypropyl]-N-(furan-2-ylmethyl)methanesulfonamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277 K；0.1 M MES and 4-5% PEG8K, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 1.94 Å R-free 0.217 |
| 4MLP Mammalian cryptochrome in complex with a small molecule competitor of its ubiquitin ligase 提交 2013-09-06 | Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1–512（512 aa）
片段：photolyase homology region UNP residues 1-512
|
未记录 | 2CX N-[(2S)-3-(9H-carbazol-9-yl)-2-hydroxypropyl]-N-(furan-2-ylmethyl)methanesulfonamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277 K；0.1 M MES and 4-5% PEG8K, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 1.94 Å R-free 0.217 |
| 4MLP Mammalian cryptochrome in complex with a small molecule competitor of its ubiquitin ligase 提交 2013-09-06 | Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 D
1–512（512 aa）
片段：photolyase homology region UNP residues 1-512
|
未记录 | 2CX N-[(2S)-3-(9H-carbazol-9-yl)-2-hydroxypropyl]-N-(furan-2-ylmethyl)methanesulfonamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277 K；0.1 M MES and 4-5% PEG8K, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 1.94 Å R-free 0.217 |
| 4U8H Crystal Structure of Mammalian Period-Cryptochrome Complex 提交 2014-08-03 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–510（510 aa）
片段：Photolyase/cryptochrome alpha/beta domain, residues 1-510
|
未记录 | ZN ZINC ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；277 K；0.1 M HEPES, 0.2 M NaCl, 15% PEG3350
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.278 |
| 4U8H Crystal Structure of Mammalian Period-Cryptochrome Complex 提交 2014-08-03 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 C
1–510（510 aa）
片段：Photolyase/cryptochrome alpha/beta domain, residues 1-510
|
未记录 | ZN ZINC ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；277 K；0.1 M HEPES, 0.2 M NaCl, 15% PEG3350
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.278 |
| 6KX8 Crystal structure of mouse Cryptochrome 2 in complex with TH301 compound 提交 2019-09-10 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–512（512 aa）
|
未记录 | DYX 1-(4-chlorophenyl)-N-[2-(4-methoxyphenyl)-5,5-bis(oxidanylidene)-4,6-dihydrothieno[3,4-c]pyrazol-3-yl]cyclopentane-1-carboxamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；100 mM HEPES-NaOH pH 7.0, 15% (w/v) PEG3350, 200 mM NaCl
|
分辨率 2.25 Å R-free 0.219 |
| 6KX8 Crystal structure of mouse Cryptochrome 2 in complex with TH301 compound 提交 2019-09-10 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1–512（512 aa）
|
未记录 | DYX 1-(4-chlorophenyl)-N-[2-(4-methoxyphenyl)-5,5-bis(oxidanylidene)-4,6-dihydrothieno[3,4-c]pyrazol-3-yl]cyclopentane-1-carboxamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；100 mM HEPES-NaOH pH 7.0, 15% (w/v) PEG3350, 200 mM NaCl
|
分辨率 2.25 Å R-free 0.219 |
| 7D0N Crystal structure of mouse CRY2 apo form 提交 2020-09-11 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–512（512 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；0.1 M HEPES pH 7.0, 100 mM NaCl, 10% w/v PEG 3350
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.293 |
| 7EJ9 Alternative crystal structure of mouse Cryptochrome 2 in complex with TH301 compound 提交 2021-04-01 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–512（512 aa）
链 B
1–512（512 aa）
|
未记录 | DYX 1-(4-chlorophenyl)-N-[2-(4-methoxyphenyl)-5,5-bis(oxidanylidene)-4,6-dihydrothieno[3,4-c]pyrazol-3-yl]cyclopentane-1-carboxamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；0.1 M HEPES-NaOH pH 7.0, 0.35 M NaCl, 18% (w/v) PEG 3350
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.234 |
| 7V8Y Crystal structure of mouse CRY2 in complex with SHP1703 compound 提交 2021-08-23 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–512（512 aa）
|
未记录 | 5YH 1-[(2R)-3-[3,6-bis(fluoranyl)carbazol-9-yl]-2-oxidanyl-propyl]imidazolidin-2-one × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；0.1 M HEPES pH 7.0, 0.15 M NaCl, 12% PEG 3350
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.206 |
| 7V8Z Crystal structure of mouse CRY2 in complex with SHP656 compound 提交 2021-08-23 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–512（512 aa）
|
未记录 | 5YH 1-[(2R)-3-[3,6-bis(fluoranyl)carbazol-9-yl]-2-oxidanyl-propyl]imidazolidin-2-one × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；0.1 M HEPES pH 7.0, 0.1 M NaCl, 16% PEG 3350
|
分辨率 1.95 Å R-free 0.202 |