当前蛋白身份：Q9UBP0
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 3EAB Crystal structure of Spastin MIT in complex with ESCRT III 提交 2008-08-25 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
112–196（85 aa）
片段：UNP residues 112 to 196
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.6；288 K；10% PEG 2000 MME, 0.2 M Ammonia Sulfate, 0.1 M Sodium Acetate, pH 4.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 288K
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.268 |
| 3EAB Crystal structure of Spastin MIT in complex with ESCRT III 提交 2008-08-25 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
112–196（85 aa）
片段：UNP residues 112 to 196
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.6；288 K；10% PEG 2000 MME, 0.2 M Ammonia Sulfate, 0.1 M Sodium Acetate, pH 4.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 288K
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.268 |
| 3EAB Crystal structure of Spastin MIT in complex with ESCRT III 提交 2008-08-25 | Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 C
112–196（85 aa）
片段：UNP residues 112 to 196
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.6；288 K；10% PEG 2000 MME, 0.2 M Ammonia Sulfate, 0.1 M Sodium Acetate, pH 4.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 288K
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分辨率 2.50 Å R-free 0.268 |
| 3EAB Crystal structure of Spastin MIT in complex with ESCRT III 提交 2008-08-25 | Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 D
112–196（85 aa）
片段：UNP residues 112 to 196
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.6；288 K；10% PEG 2000 MME, 0.2 M Ammonia Sulfate, 0.1 M Sodium Acetate, pH 4.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 288K
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分辨率 2.50 Å R-free 0.268 |
| 3EAB Crystal structure of Spastin MIT in complex with ESCRT III 提交 2008-08-25 | Assembly 5 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 E
112–196（85 aa）
片段：UNP residues 112 to 196
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.6；288 K；10% PEG 2000 MME, 0.2 M Ammonia Sulfate, 0.1 M Sodium Acetate, pH 4.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 288K
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分辨率 2.50 Å R-free 0.268 |
| 3EAB Crystal structure of Spastin MIT in complex with ESCRT III 提交 2008-08-25 | Assembly 6 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 F
112–196（85 aa）
片段：UNP residues 112 to 196
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.6；288 K；10% PEG 2000 MME, 0.2 M Ammonia Sulfate, 0.1 M Sodium Acetate, pH 4.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 288K
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分辨率 2.50 Å R-free 0.268 |
| 3VFD Human spastin AAA domain 提交 2012-01-09 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
228–616（389 aa）
片段：AAA domain
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突变：E442Q | SO4 SULFATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；296 K；1.6M (NH3)2SO4, 0.1M MES monohydrate (pH 6.5),10% 1,4-dioxane and 4% benzamidine HCl, 1mM ATP, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 296K
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分辨率 3.30 Å R-free 0.275 |
| 5Z6Q Crystal structure of AAA of Spastin 提交 2018-01-25 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
229–616（388 aa）
片段：UNP residues 229-616
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未记录 | CL CHLORIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；3M (NH4)2SO4, 100mM NH4Cl
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分辨率 3.00 Å R-free 0.276 |
| 5Z6R SPASTIN AAA WITH ATP 提交 2018-01-25 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
229–616（388 aa）
片段：UNP RESIDUES 229-616
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突变：E442Q | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.2；293 K；25MM TRIS-HCL, 1MM DTT, 1MM MGCL2, 1MM ATP, 2% PEG 3350, 20MM KSCN
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分辨率 3.00 Å R-free 0.279 |
| 6PEK Structure of Spastin Hexamer (Subunit A-E) in complex with substrate peptide 提交 2019-06-20 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 A
87–584（498 aa）
链 B
87–584（498 aa）
链 C
87–584（498 aa）
链 D
87–584（498 aa）
链 E
87–584（498 aa）
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未记录 | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 5 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 4 MG MAGNESIUM ION × 4 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 4.20 Å |
| 6PEN Structure of Spastin Hexamer (whole model) in complex with substrate peptide 提交 2019-06-20 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric（7） 与蛋白数一致 |
链 A
87–584（498 aa）
链 B
87–584（498 aa）
链 C
87–584（498 aa）
链 D
87–584（498 aa）
链 E
87–584（498 aa）
链 F
87–584（498 aa）
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未记录 | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 5 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 4 MG MAGNESIUM ION × 4 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.20 Å |
| 7S7J Structure of Human SPASTIN-IST1 complex. 提交 2021-09-16 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
112–195（84 aa）
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未记录 | PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 1 CA CALCIUM ION × 1 PGE TRIETHYLENE GLYCOL × 1 CL CHLORIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；278 K；40% v/v PEG 300, 100 mM Sodium cacodylate / Hydrochloric acid pH=6.5, 200 mM Calcium Acetate
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分辨率 1.15 Å R-free 0.157 |