当前蛋白身份：Q9UJ41
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1TXU Crystal Structure of the Vps9 Domain of Rabex-5 提交 2004-07-06 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
133–394（262 aa）
片段：VPS9
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | MG MAGNESIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；277 K；PEG 8000, MgCl, TRIS, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 4K
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分辨率 2.35 Å R-free 0.269 |
| 2OT3 Crystal structure of rabex-5 VPS9 domain in complex with nucleotide free RAB21 提交 2007-02-07 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
132–397（266 aa）
片段：residues 132-297
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；277 K；10% PEG 6000, 0.2M MgCl2, 0.05 NaMES Microseeded, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.243 |
| 4N3X Crystal structure of Rabex-5 CC domain 提交 2013-10-08 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
626–672（47 aa）
片段：Rabex-5 CC domain, UNP residues 626-672
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.4；289 K；0.10M NaAc, 17.5% MPD, 2% PEG4000
, pH 5.4, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 289K
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.234 |
| 4N3X Crystal structure of Rabex-5 CC domain 提交 2013-10-08 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
626–672（47 aa）
片段：Rabex-5 CC domain, UNP residues 626-672
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.4；289 K；0.10M NaAc, 17.5% MPD, 2% PEG4000
, pH 5.4, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 289K
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.234 |
| 4N3X Crystal structure of Rabex-5 CC domain 提交 2013-10-08 | Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 C
626–672（47 aa）
片段：Rabex-5 CC domain, UNP residues 626-672
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.4；289 K；0.10M NaAc, 17.5% MPD, 2% PEG4000
, pH 5.4, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 289K
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.234 |
| 4N3X Crystal structure of Rabex-5 CC domain 提交 2013-10-08 | Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 D
626–672（47 aa）
片段：Rabex-5 CC domain, UNP residues 626-672
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.4；289 K；0.10M NaAc, 17.5% MPD, 2% PEG4000
, pH 5.4, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 289K
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.234 |
| 4N3Y Crystal structure of Rabex-5CC and Rabaptin-5C21 complex 提交 2013-10-08 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
630–672（43 aa）
片段：UNP residues 630-672
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；289 K；0.15M MgAc2, 20% PEG3350, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 289K
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分辨率 2.20 Å R-free 0.234 |
| 4N3Z Crystal structure of Rabex-5delta and Rabaptin-5C21 complex 提交 2013-10-08 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
132–455（324 aa）
片段：UNP residues, isoform 2, 132-455
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突变：residues 387-408 deletion mutant | PO4 PHOSPHATE ION × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；289 K；2.0M NaH2PO4/K2HPO4, 0.05% n-octyl-beta-D-galactopyranoside, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 289K
|
分辨率 3.10 Å R-free 0.315 |
| 4Q9U Crystal structure of the Rab5, Rabex-5delta and Rabaptin-5C21 complex 提交 2014-05-01 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8） 与蛋白数一致 |
链 A
132–455（324 aa）
片段：UNP residues 132-455
链 E
132–455（324 aa）
片段：UNP residues 132-455
|
突变：393-407 deletion mutant 突变：393-407 deletion mutant | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
hanging drop；pH 5；289 K；1.0M NaH2PO4/K2HPO4, pH 5.0, hanging drop, temperature 289K
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分辨率 4.62 Å R-free 0.343 |