当前蛋白身份:Q9UK80 重新检索
本组结构的主要差异维度
构建体不同 突变/修饰不同 组装状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量指标不同

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相关结构差异明细

一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。

PDB 条目 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法 实验环境 结构质量
2Y5B Structure of USP21 in complex with linear diubiquitin-aldehyde 提交 2011-01-12 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 196–565(370 aa) 片段:CATALYTIC DOMAIN, RESIDUES 196-565
未记录 ZN ZINC ION × 1 SO4 SULFATE ION × 8 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7.4;15% PEG8000, 0.2 M NH4SO4, pH 7.4
分辨率 2.70 Å R-free 0.279
2Y5B Structure of USP21 in complex with linear diubiquitin-aldehyde 提交 2011-01-12 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 E 196–565(370 aa) 片段:CATALYTIC DOMAIN, RESIDUES 196-565
未记录 ZN ZINC ION × 1 SO4 SULFATE ION × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7.4;15% PEG8000, 0.2 M NH4SO4, pH 7.4
分辨率 2.70 Å R-free 0.279
3I3T Crystal structure of covalent ubiquitin-USP21 complex 提交 2009-06-30 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 209–563(355 aa) 片段:Catalytic domain: UNP residues 209-563
未记录 ZN ZINC ION × 1 NEH ETHANAMINE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.5;291 K;13% PEG 3350, 0.1 M Bis-Tris, 0.1 M Ammonium sulfate, 5 mM TCEP, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
分辨率 2.59 Å R-free 0.218
3I3T Crystal structure of covalent ubiquitin-USP21 complex 提交 2009-06-30 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 C 209–563(355 aa) 片段:Catalytic domain: UNP residues 209-563
未记录 ZN ZINC ION × 1 NEH ETHANAMINE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.5;291 K;13% PEG 3350, 0.1 M Bis-Tris, 0.1 M Ammonium sulfate, 5 mM TCEP, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
分辨率 2.59 Å R-free 0.218
3I3T Crystal structure of covalent ubiquitin-USP21 complex 提交 2009-06-30 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 E 209–563(355 aa) 片段:Catalytic domain: UNP residues 209-563
未记录 ZN ZINC ION × 1 NEH ETHANAMINE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.5;291 K;13% PEG 3350, 0.1 M Bis-Tris, 0.1 M Ammonium sulfate, 5 mM TCEP, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
分辨率 2.59 Å R-free 0.218
3I3T Crystal structure of covalent ubiquitin-USP21 complex 提交 2009-06-30 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 G 209–563(355 aa) 片段:Catalytic domain: UNP residues 209-563
未记录 ZN ZINC ION × 1 NEH ETHANAMINE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.5;291 K;13% PEG 3350, 0.1 M Bis-Tris, 0.1 M Ammonium sulfate, 5 mM TCEP, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
分辨率 2.59 Å R-free 0.218
3MTN Usp21 in complex with a ubiquitin-based, USP21-specific inhibitor 提交 2010-04-30 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 209–562(354 aa) 片段:CATALYTIC DOMAIN: UNP RESIDUES 209-562
突变:T64G, P68H, L70V ZN ZINC ION × 1 CL CHLORIDE ION × 3 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 5.3;291 K;11% PEG 4000, 0.1 M SODIUM CITRATE, 0.1 M AMMONIUM ACETATE, 5 MM TCEP, PH 5.3, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, TEMPERATURE 291K
分辨率 2.70 Å R-free 0.273
3MTN Usp21 in complex with a ubiquitin-based, USP21-specific inhibitor 提交 2010-04-30 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 C 209–562(354 aa) 片段:CATALYTIC DOMAIN: UNP RESIDUES 209-562
突变:T64G, P68H, L70V ZN ZINC ION × 1 CL CHLORIDE ION × 1 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 5.3;291 K;11% PEG 4000, 0.1 M SODIUM CITRATE, 0.1 M AMMONIUM ACETATE, 5 MM TCEP, PH 5.3, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, TEMPERATURE 291K
分辨率 2.70 Å R-free 0.273
9NY4 USP21 bound to H2AK119ub nucleosome 提交 2025-03-26 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物;蛋白 × 10 PDB 声明:12-meric(12) 与全部聚合物一致
链 K 196–565(370 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.98 Å