当前蛋白身份:Q9UK80
重新检索
差异标签只比较当前检索结果;所有PDB和assembly原始记录仍分别保留。
相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2Y5B Structure of USP21 in complex with linear diubiquitin-aldehyde 提交 2011-01-12 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 A
196–565(370 aa)
片段:CATALYTIC DOMAIN, RESIDUES 196-565
|
未记录 | ZN ZINC ION × 1 SO4 SULFATE ION × 8 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 7.4;15% PEG8000, 0.2 M NH4SO4, pH 7.4
|
分辨率 2.70 Å R-free 0.279 |
| 2Y5B Structure of USP21 in complex with linear diubiquitin-aldehyde 提交 2011-01-12 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 E
196–565(370 aa)
片段:CATALYTIC DOMAIN, RESIDUES 196-565
|
未记录 | ZN ZINC ION × 1 SO4 SULFATE ION × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 7.4;15% PEG8000, 0.2 M NH4SO4, pH 7.4
|
分辨率 2.70 Å R-free 0.279 |
| 3I3T Crystal structure of covalent ubiquitin-USP21 complex 提交 2009-06-30 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 A
209–563(355 aa)
片段:Catalytic domain: UNP residues 209-563
|
未记录 | ZN ZINC ION × 1 NEH ETHANAMINE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.5;291 K;13% PEG 3350, 0.1 M Bis-Tris, 0.1 M Ammonium sulfate, 5 mM TCEP, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
|
分辨率 2.59 Å R-free 0.218 |
| 3I3T Crystal structure of covalent ubiquitin-USP21 complex 提交 2009-06-30 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 C
209–563(355 aa)
片段:Catalytic domain: UNP residues 209-563
|
未记录 | ZN ZINC ION × 1 NEH ETHANAMINE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.5;291 K;13% PEG 3350, 0.1 M Bis-Tris, 0.1 M Ammonium sulfate, 5 mM TCEP, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
|
分辨率 2.59 Å R-free 0.218 |
| 3I3T Crystal structure of covalent ubiquitin-USP21 complex 提交 2009-06-30 | Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 E
209–563(355 aa)
片段:Catalytic domain: UNP residues 209-563
|
未记录 | ZN ZINC ION × 1 NEH ETHANAMINE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.5;291 K;13% PEG 3350, 0.1 M Bis-Tris, 0.1 M Ammonium sulfate, 5 mM TCEP, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
|
分辨率 2.59 Å R-free 0.218 |
| 3I3T Crystal structure of covalent ubiquitin-USP21 complex 提交 2009-06-30 | Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 G
209–563(355 aa)
片段:Catalytic domain: UNP residues 209-563
|
未记录 | ZN ZINC ION × 1 NEH ETHANAMINE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.5;291 K;13% PEG 3350, 0.1 M Bis-Tris, 0.1 M Ammonium sulfate, 5 mM TCEP, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
|
分辨率 2.59 Å R-free 0.218 |
| 3MTN Usp21 in complex with a ubiquitin-based, USP21-specific inhibitor 提交 2010-04-30 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 A
209–562(354 aa)
片段:CATALYTIC DOMAIN: UNP RESIDUES 209-562
|
突变:T64G, P68H, L70V | ZN ZINC ION × 1 CL CHLORIDE ION × 3 GOL GLYCEROL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 5.3;291 K;11% PEG 4000, 0.1 M SODIUM CITRATE, 0.1 M AMMONIUM ACETATE, 5 MM TCEP, PH 5.3, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, TEMPERATURE 291K
|
分辨率 2.70 Å R-free 0.273 |
| 3MTN Usp21 in complex with a ubiquitin-based, USP21-specific inhibitor 提交 2010-04-30 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 C
209–562(354 aa)
片段:CATALYTIC DOMAIN: UNP RESIDUES 209-562
|
突变:T64G, P68H, L70V | ZN ZINC ION × 1 CL CHLORIDE ION × 1 GOL GLYCEROL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 5.3;291 K;11% PEG 4000, 0.1 M SODIUM CITRATE, 0.1 M AMMONIUM ACETATE, 5 MM TCEP, PH 5.3, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, TEMPERATURE 291K
|
分辨率 2.70 Å R-free 0.273 |
| 9NY4 USP21 bound to H2AK119ub nucleosome 提交 2025-03-26 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物;蛋白 × 10 PDB 声明:12-meric(12) 与全部聚合物一致 |
链 K
196–565(370 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.98 Å |