当前蛋白身份：Q9UMR2
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 3EWS Human DEAD-box RNA-helicase DDX19 in complex with ADP 提交 2008-10-16 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
54–475（422 aa）
片段：Helicase ATP-binding domain, Helicase C-terminal domain, UNP residues 54-475
|
未记录 | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；277 K；0.1M ammonium acetate, 0.1M Bis-Tris, 17% PEG-10000, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
|
分辨率 2.70 Å R-free 0.260 |
| 3EWS Human DEAD-box RNA-helicase DDX19 in complex with ADP 提交 2008-10-16 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
54–475（422 aa）
片段：Helicase ATP-binding domain, Helicase C-terminal domain, UNP residues 54-475
|
未记录 | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；277 K；0.1M ammonium acetate, 0.1M Bis-Tris, 17% PEG-10000, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
|
分辨率 2.70 Å R-free 0.260 |
| 3FHC Crystal structure of human Dbp5 in complex with Nup214 提交 2008-12-09 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
68–302（235 aa）
片段：Nterminal RecA-like domain, UNP residues 68-302
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；293 K；50mM MES pH 6.0, 900mM Na citrate, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
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分辨率 2.80 Å R-free 0.260 |
| 3FHT Crystal structure of human Dbp5 in complex with AMPPNP and RNA 提交 2008-12-10 | Assembly 1 蛋白–RNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：dimeric（2） 与全部聚合物一致 |
链 A
68–479（412 aa）
片段：Helicase ATP-binding domain, C-terminal domain, residues 68-479
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未记录 | MG MAGNESIUM ION × 1 GOL GLYCEROL × 1 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；293 K；100mM Tris pH 7.0, 20% PEG 2000 mono-methyl-ether, 3% PEG 3350, 30mM NaF, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
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分辨率 2.20 Å R-free 0.225 |
| 3FHT Crystal structure of human Dbp5 in complex with AMPPNP and RNA 提交 2008-12-10 | Assembly 2 蛋白–RNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：dimeric（2） 与全部聚合物一致 |
链 B
68–479（412 aa）
片段：Helicase ATP-binding domain, C-terminal domain, residues 68-479
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 1 GOL GLYCEROL × 3 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；293 K；100mM Tris pH 7.0, 20% PEG 2000 mono-methyl-ether, 3% PEG 3350, 30mM NaF, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.225 |
| 3FMO Crystal structure of the nucleoporin Nup214 in complex with the DEAD-box helicase Ddx19 提交 2008-12-22 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
1–300（300 aa）
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未记录 | GOL GLYCEROL × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.5；298 K；sodium di-hydrogen phosphate, di-potassium hydrogen phosphate, sodium acetate, pH 4.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
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分辨率 2.51 Å R-free 0.242 |
| 3FMP Crystal structure of the nucleoporin Nup214 in complex with the DEAD-box helicase Ddx19 提交 2008-12-22 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
1–479（479 aa）
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未记录 | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；298 K；PEG 3000, CHES buffer, pH 9.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 3.19 Å R-free 0.283 |
| 3FMP Crystal structure of the nucleoporin Nup214 in complex with the DEAD-box helicase Ddx19 提交 2008-12-22 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 D
1–479（479 aa）
|
未记录 | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；298 K；PEG 3000, CHES buffer, pH 9.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 3.19 Å R-free 0.283 |
| 3G0H Human dead-box RNA helicase DDX19, in complex with an ATP-analogue and RNA 提交 2009-01-28 | Assembly 1 蛋白–RNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：dimeric（2） 与全部聚合物一致 |
链 A
54–475（422 aa）
片段：UNP residues 54-275
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未记录 | ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 GOL GLYCEROL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 8；277 K；14% PEGMME 2000, 0.25M trimethylamine n-oxide, 0.1 M Tris, pH 8, VAPOR DIFFUSION, temperature 277K
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分辨率 2.70 Å R-free 0.275 |
| 6B4I Crystal structure of human Gle1 CTD-Nup42 GBM-DDX19B(ADP) complex 提交 2017-09-26 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 F
54–479（426 aa）
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未记录 | PO4 PHOSPHATE ION × 3 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；13 % (w/v) PEG 3350, 0.2 M sodium potassium phosphate
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分辨率 3.62 Å R-free 0.281 |
| 6B4I Crystal structure of human Gle1 CTD-Nup42 GBM-DDX19B(ADP) complex 提交 2017-09-26 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 E
54–479（426 aa）
|
未记录 | PO4 PHOSPHATE ION × 3 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；13 % (w/v) PEG 3350, 0.2 M sodium potassium phosphate
|
分辨率 3.62 Å R-free 0.281 |
| 6B4J Crystal structure of human Gle1 CTD-Nup42 GBM-DDX19B(AMPPNP) complex 提交 2017-09-26 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 F
54–479（426 aa）
|
未记录 | PO4 PHOSPHATE ION × 4 MG MAGNESIUM ION × 1 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；15 % (w/v) PEG 3350, 0.3 M sodium potassium phosphate pH 6.6
|
分辨率 3.40 Å R-free 0.313 |
| 6B4J Crystal structure of human Gle1 CTD-Nup42 GBM-DDX19B(AMPPNP) complex 提交 2017-09-26 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 E
54–479（426 aa）
|
未记录 | PO4 PHOSPHATE ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；15 % (w/v) PEG 3350, 0.3 M sodium potassium phosphate pH 6.6
|
分辨率 3.40 Å R-free 0.313 |
| 6B4K Crystal structure of human DDX19B(AMPPNP) 提交 2017-09-26 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
54–479（426 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 1 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 MLI MALONATE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；0.1 M MIB buffer pH 5.0 (malonate, imidazole, borate), 13 % (w/v) PEG 1500
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.248 |
| 6B4K Crystal structure of human DDX19B(AMPPNP) 提交 2017-09-26 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
54–479（426 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 1 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 MLI MALONATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；0.1 M MIB buffer pH 5.0 (malonate, imidazole, borate), 13 % (w/v) PEG 1500
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.248 |