当前蛋白身份:Q9UNZ2 重新检索
本组结构的主要差异维度
构建体不同 突变/修饰不同 组装状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量指标不同

差异标签只比较当前检索结果;所有PDB和assembly原始记录仍分别保留。

相关结构差异明细

一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。

PDB 条目 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法 实验环境 结构质量
1SS6 Solution structure of SEP domain from human p47 提交 2004-03-23 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 171–270(100 aa) 片段:SEP domain
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 5.6;300 K;离子强度(mmCIF原始值)20mM phosphate buffer NA, 150mM sodium chloride;压力 ambient
NMR测量条件 pH 5.6;300 K;离子强度(mmCIF原始值)20mM phosphate buffer NA, 150mM sodium chloride;压力 ambient
NMR测量条件 pH 5.6;300 K;离子强度(mmCIF原始值)20mM phosphate buffer NA, 150mM sodium chloride;压力 ambient
NMR样品组成 2mM SEP domain U-15N;20mM phosphate buffer NA; 150mM sodium chloride; 90% H2O, 10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 1mM SEP domain U-15N,13C;20mM phosphate buffer NA; 150mM sodium chloride; 90% H2O, 10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 1mM SEP domain U-15N,13C;20mM phosphate buffer NA; 150mM sodium chloride; 100% D2O | 100% D2O
分辨率未提供
8HRZ Crystal structure of the p97-N/D1 hexamer in complex with six p47-UBX domains 提交 2022-12-16 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 24 PDB 声明:24-meric(24) 与蛋白数一致
链 M 287–370(84 aa)
链 N 287–370(84 aa)
链 O 287–370(84 aa)
链 P 287–370(84 aa)
链 Q 287–370(84 aa)
链 R 287–370(84 aa)
链 S 287–370(84 aa)
链 T 287–370(84 aa)
链 U 287–370(84 aa)
链 V 287–370(84 aa)
链 W 287–370(84 aa)
链 X 287–370(84 aa)
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 12 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7;295 K;14% PEG 3350, 0.2M ammonium citrate tribasic (pH 7), 0.01M hexamine cobalt (III) chloride
分辨率 2.70 Å R-free 0.256
9MPU Cryo-EM structure of p47 bound to VCP N-domain (with D1 domain) 提交 2024-12-31 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 B 1–370(370 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.00 Å