当前蛋白身份:Q9UPP1 重新检索
本组结构的主要差异维度
构建体不同 突变/修饰不同 组装状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量指标不同

差异标签只比较当前检索结果;所有PDB和assembly原始记录仍分别保留。

相关结构差异明细

一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。

PDB 条目 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法 实验环境 结构质量
2WWU Crystal structure of the catalytic domain of PHD finger protein 8 提交 2009-10-29 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 115–483(369 aa) 片段:CATALYTIC DOMAIN, RESIDUES 115-483
未记录 SO4 SULFATE ION × 14 ACT ACETATE ION × 10 NI NICKEL (II) ION × 2 BGC beta-D-glucopyranose × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 1.5 M (NH4)2SO4, 0.1 M SODIUM ACETATE PH 4.25
分辨率 2.15 Å R-free 0.211
3KV4 Structure of PHF8 in complex with histone H3 提交 2009-11-29 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 37–483(447 aa) 片段:UNP Residues 37-483
未记录 ZN ZINC ION × 2 FE2 FE (II) ION × 1 NI NICKEL (II) ION × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 13 OGA N-OXALYLGLYCINE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 5.6;25% (v/v) polyethylene glycol 3350, 0.2 M NaCl, and 0.1 M NaCitrate pH 5.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
分辨率 2.19 Å R-free 0.255
4DO0 Crystal Structure of human PHF8 in complex with Daminozide 提交 2012-02-09 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 115–483(369 aa)
未记录 DZA DAMINOZIDE × 2 ZN ZINC ION × 2 SO4 SULFATE ION × 12 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 6 ACT ACETATE ION × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION;pH 4.5;277 K;0.1M acetate, 2M ammonium sulfate, pH 4.5, VAPOR DIFFUSION, temperature 277K
分辨率 2.55 Å R-free 0.265
7CMZ Crystal Structure of BRCT7/8 in Complex with the APS Motif of PHF8 提交 2020-07-29 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 B 842–863(22 aa)
未记录 K POTASSIUM ION × 1 NA SODIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION;289 K;Sodium phosphate monobasic monohydrate, Potassium phosphate dibasic
分辨率 1.70 Å R-free 0.215