当前蛋白身份:Q9UPP1
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2WWU Crystal structure of the catalytic domain of PHD finger protein 8 提交 2009-10-29 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 A
115–483(369 aa)
片段:CATALYTIC DOMAIN, RESIDUES 115-483
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未记录 | SO4 SULFATE ION × 14 ACT ACETATE ION × 10 NI NICKEL (II) ION × 2 BGC beta-D-glucopyranose × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
1.5 M (NH4)2SO4, 0.1 M SODIUM ACETATE PH 4.25
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分辨率 2.15 Å R-free 0.211 |
| 3KV4 Structure of PHF8 in complex with histone H3 提交 2009-11-29 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 A
37–483(447 aa)
片段:UNP Residues 37-483
|
未记录 | ZN ZINC ION × 2 FE2 FE (II) ION × 1 NI NICKEL (II) ION × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 13 OGA N-OXALYLGLYCINE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 5.6;25% (v/v) polyethylene glycol 3350, 0.2 M NaCl, and 0.1 M NaCitrate pH 5.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
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分辨率 2.19 Å R-free 0.255 |
| 4DO0 Crystal Structure of human PHF8 in complex with Daminozide 提交 2012-02-09 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 A
115–483(369 aa)
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未记录 | DZA DAMINOZIDE × 2 ZN ZINC ION × 2 SO4 SULFATE ION × 12 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 6 ACT ACETATE ION × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION;pH 4.5;277 K;0.1M acetate, 2M ammonium sulfate, pH 4.5, VAPOR DIFFUSION, temperature 277K
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分辨率 2.55 Å R-free 0.265 |
| 7CMZ Crystal Structure of BRCT7/8 in Complex with the APS Motif of PHF8 提交 2020-07-29 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 B
842–863(22 aa)
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未记录 | K POTASSIUM ION × 1 NA SODIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION;289 K;Sodium phosphate monobasic monohydrate, Potassium phosphate dibasic
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分辨率 1.70 Å R-free 0.215 |