当前蛋白身份：Q9UY56
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 9K00 Crystal structure of Pyrococcus abyssi AIR synthetase 提交 2024-10-15 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
14–334（321 aa）
链 B
14–334（321 aa）
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；lithium sulfate, poly(acrylic acid sodium salt) 2100, HEPES
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.213 |
| 9K01 Crystal structure of Pyrococcus abyssi AIR synthetase bound to ADP 提交 2024-10-15 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
14–334（321 aa）
链 B
14–334（321 aa）
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；lithium sulfate, poly(acrylic acid sodium salt) 2100, HEPES
|
分辨率 1.60 Å R-free 0.193 |
| 9K02 Crystal structure of Pyrococcus abyssi AIR synthetase bound to ADP and Mg(II) 提交 2024-10-15 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
14–334（321 aa）
链 B
14–334（321 aa）
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；lithium sulfate, poly(acrylic acid sodium salt) 2100, HEPES
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.207 |
| 9K03 Crystal structure of Pyrococcus abyssi AIR synthetase H239A mutant bound to AMPPNP 提交 2024-10-15 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
14–334（321 aa）
链 B
14–334（321 aa）
|
突变：H239A 突变：H239A | ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 2 MN MANGANESE (II) ION × 4 K POTASSIUM ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；potassium chloride, pentaerythritol ethoxylate, glycine
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分辨率 2.25 Å R-free 0.205 |
| 9K04 Crystal structure of Pyrococcus abyssi AIR synthetase H239A mutant bound to ADP and Pi 提交 2024-10-15 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
14–334（321 aa）
链 B
14–334（321 aa）
|
突变：H239A 突变：H239A | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 PO4 PHOSPHATE ION × 2 MN MANGANESE (II) ION × 4 K POTASSIUM ION × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；potassium chloride, pentaerythritol ethoxylate, glycine
|
分辨率 1.60 Å R-free 0.177 |
| 9K05 Crystal structure of Pyrococcus abyssi AIR synthetase N186A mutant bound to FGAR and AMP 提交 2024-10-15 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–334（334 aa）
链 B
1–334（334 aa）
|
突变：N186A 突变：N186A | FGR N-(N-FORMYLGLYCYL)-5-O-PHOSPHONO-BETA-D-RIBOFURANOSYLAMINE × 2 AMP ADENOSINE MONOPHOSPHATE × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；lithium sulfate, poly(acrylic acid sodium salt) 2100, HEPES
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.193 |
| 9K06 Crystal structure of Pyrococcus abyssi AIR synthetase with residues 51-54 replaced by Neisseria gonorrhoeae residues 49-56 提交 2024-10-15 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
14–334（321 aa）
链 B
14–334（321 aa）
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 2 FLC CITRATE ANION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；lithium sulfate, 2-propanol, sodium citrate
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分辨率 1.70 Å R-free 0.196 |
| 9VNU Crystal structure of chimeric AIR synthetase constructed from E. coli (residues 1-168) and Pyrococcus abyssi (residues 163-334) 提交 2025-07-01 | Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
163–334（172 aa）
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；pentaerythritol ethoxylate (3/4 EO/OH), magnesium chloride
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分辨率 2.40 Å R-free 0.223 |
| 9VNV Crystal structure of Pyrococcus abyssi AIR synthetase with an N-terminal 43-residues deletion 提交 2025-07-01 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
44–334（291 aa）
链 B
44–334（291 aa）
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；303 K；sodium thiocyanate, pentaerythritol propoxylate (5/4 PO/OH), HEPES
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分辨率 2.50 Å R-free 0.241 |
| 9VNW Crystal structure of Pyrococcus abyssi AIR synthetase with an N-terminal 54-residues deletion 提交 2025-07-01 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
56–334（279 aa）
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；Jeffamine T-403, Jeffamine ED-2003, Tris
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分辨率 2.50 Å R-free 0.234 |