当前蛋白身份:Q9VSK3 重新检索
本组结构的主要差异维度
构建体不同 突变/修饰不同 组装状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量指标不同

差异标签只比较当前检索结果;所有PDB和assembly原始记录仍分别保留。

相关结构差异明细

一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。

PDB 条目 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法 实验环境 结构质量
4QQB Structural basis for the assembly of the SXL-UNR translation regulatory complex 提交 2014-06-27 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:trimeric(3) 与全部聚合物一致
链 X 185–252(68 aa) 片段:CSD1, UNP residues 185-252
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6;277 K;0.1 M LiSO4, PEG3350 1-5 %, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 2.80 Å R-free 0.236
4QQB Structural basis for the assembly of the SXL-UNR translation regulatory complex 提交 2014-06-27 Assembly 2 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:trimeric(3) 与全部聚合物一致
链 Y 185–252(68 aa) 片段:CSD1, UNP residues 185-252
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6;277 K;0.1 M LiSO4, PEG3350 1-5 %, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 2.80 Å R-free 0.236
6Y4H Solution structure of cold-shock domain 7 and 8 of drosophila Upstream of N-Ras (Unr) 提交 2020-02-21 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 756–922(167 aa)
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 6.4;298 K;离子强度(mmCIF原始值)150;压力 1
NMR样品组成 0.5 mM [U-99% 13C; U-99% 15N] dCSD78, 150 mM sodium chloride, 20 mM sodium phosphate, 1 mM DTT, 95% H2O/5% D2O | 95% H2O/5% D2O
NMR样品组成 0.5 mM [U-99% 13C; U-99% 15N] dCSD78, 150 mM sodium chloride, 20 mM sodium phosphate, 1 mM DTT, 100% D2O | 100% D2O
分辨率未提供
6Y6E drosophila Unr CSD456 提交 2020-02-26 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 424–677(254 aa)
未记录 EMC ETHYL MERCURY ION × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 5.5;293 K;0.1 M tri-sodium citrate (pH 5.5), 20% PEG2000
分辨率 2.02 Å R-free 0.251
6Y6M solution structure of cold-shock domain 1 and 2 of drosophila Upstream of N-Ras (Unr) 提交 2020-02-26 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 186–344(159 aa)
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 6.4;298 K;离子强度(mmCIF原始值)50;压力 1
NMR样品组成 50 mM sodium chloride, 20 mM sodium phosphate, 10 mM DTT, 0.3 mM [U-99% 13C; U-99% 15N] protein, 0.36 mM RNA, 95% H2O/5% D2O | 95% H2O/5% D2O
NMR样品组成 50 mM sodium chloride, 20 mM sodium phosphate, 10 mM DTT, 0.3 mM [U-99% 13C; U-99% 15N] protein, 0.36 mM RNA, 100% D2O | 100% D2O
分辨率未提供
6Y96 solution structure of cold-shock domain 9 of drosophila Upstream of N-Ras (Unr) 提交 2020-03-06 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 899–990(92 aa)
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 6.8;298 K;离子强度(mmCIF原始值)50;压力 1
NMR样品组成 0.24 mM [U-99% 13C; U-99% 15N] protein, 50 mM sodium phosphate, 50 mM sodium chloride, 1 mM DTT, 95% H2O/5% D2O | 95% H2O/5% D2O
NMR样品组成 0.24 mM [U-99% 13C; U-99% 15N] protein, 50 mM sodium phosphate, 50 mM sodium chloride, 1 mM DTT, 100% D2O | 100% D2O
分辨率未提供
7ZHH Complex structure of drosophila Unr CSD789 and a poly(A) RNA sequence 提交 2022-04-06 Assembly 1 蛋白–RNA 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:dimeric(2) 与全部聚合物一致
链 A 756–990(235 aa)
未记录 SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7;293 K;0.1 M Tris-Cl (pH 7.0) 0.2 M lithium sulfate 2 M ammonium sulfate
分辨率 1.60 Å R-free 0.210
7ZHR Complex structure of drosophila Unr CSD789 and pAbp RRM3 提交 2022-04-07 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 756–990(235 aa)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293 K;0.2 M sodium formate 0.1 M bis-tris propane 20 % (w/v) PEG 3350
分辨率 2.99 Å R-free 0.315