当前蛋白身份:Q9VSK3
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 4QQB Structural basis for the assembly of the SXL-UNR translation regulatory complex 提交 2014-06-27 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:trimeric(3) 与全部聚合物一致 |
链 X
185–252(68 aa)
片段:CSD1, UNP residues 185-252
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6;277 K;0.1 M LiSO4, PEG3350 1-5 %, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.236 |
| 4QQB Structural basis for the assembly of the SXL-UNR translation regulatory complex 提交 2014-06-27 | Assembly 2 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:trimeric(3) 与全部聚合物一致 |
链 Y
185–252(68 aa)
片段:CSD1, UNP residues 185-252
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6;277 K;0.1 M LiSO4, PEG3350 1-5 %, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.236 |
| 6Y4H Solution structure of cold-shock domain 7 and 8 of drosophila Upstream of N-Ras (Unr) 提交 2020-02-21 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致 |
链 A
756–922(167 aa)
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未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 6.4;298 K;离子强度(mmCIF原始值)150;压力 1
NMR样品组成
0.5 mM [U-99% 13C; U-99% 15N] dCSD78, 150 mM sodium chloride, 20 mM sodium phosphate, 1 mM DTT, 95% H2O/5% D2O | 95% H2O/5% D2O
NMR样品组成
0.5 mM [U-99% 13C; U-99% 15N] dCSD78, 150 mM sodium chloride, 20 mM sodium phosphate, 1 mM DTT, 100% D2O | 100% D2O
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分辨率未提供 |
| 6Y6E drosophila Unr CSD456 提交 2020-02-26 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致 |
链 A
424–677(254 aa)
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未记录 | EMC ETHYL MERCURY ION × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 5.5;293 K;0.1 M tri-sodium citrate (pH 5.5), 20% PEG2000
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分辨率 2.02 Å R-free 0.251 |
| 6Y6M solution structure of cold-shock domain 1 and 2 of drosophila Upstream of N-Ras (Unr) 提交 2020-02-26 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致 |
链 A
186–344(159 aa)
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未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 6.4;298 K;离子强度(mmCIF原始值)50;压力 1
NMR样品组成
50 mM sodium chloride, 20 mM sodium phosphate, 10 mM DTT, 0.3 mM [U-99% 13C; U-99% 15N] protein, 0.36 mM RNA, 95% H2O/5% D2O | 95% H2O/5% D2O
NMR样品组成
50 mM sodium chloride, 20 mM sodium phosphate, 10 mM DTT, 0.3 mM [U-99% 13C; U-99% 15N] protein, 0.36 mM RNA, 100% D2O | 100% D2O
|
分辨率未提供 |
| 6Y96 solution structure of cold-shock domain 9 of drosophila Upstream of N-Ras (Unr) 提交 2020-03-06 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致 |
链 A
899–990(92 aa)
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未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 6.8;298 K;离子强度(mmCIF原始值)50;压力 1
NMR样品组成
0.24 mM [U-99% 13C; U-99% 15N] protein, 50 mM sodium phosphate, 50 mM sodium chloride, 1 mM DTT, 95% H2O/5% D2O | 95% H2O/5% D2O
NMR样品组成
0.24 mM [U-99% 13C; U-99% 15N] protein, 50 mM sodium phosphate, 50 mM sodium chloride, 1 mM DTT, 100% D2O | 100% D2O
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分辨率未提供 |
| 7ZHH Complex structure of drosophila Unr CSD789 and a poly(A) RNA sequence 提交 2022-04-06 | Assembly 1 蛋白–RNA 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:dimeric(2) 与全部聚合物一致 |
链 A
756–990(235 aa)
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未记录 | SO4 SULFATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7;293 K;0.1 M Tris-Cl (pH 7.0)
0.2 M lithium sulfate
2 M ammonium sulfate
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分辨率 1.60 Å R-free 0.210 |
| 7ZHR Complex structure of drosophila Unr CSD789 and pAbp RRM3 提交 2022-04-07 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 A
756–990(235 aa)
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293 K;0.2 M sodium formate
0.1 M bis-tris propane
20 % (w/v) PEG 3350
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分辨率 2.99 Å R-free 0.315 |