当前蛋白身份:Q9W2H9 重新检索
本组结构的主要差异维度
构建体不同 突变/修饰不同 组装状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量指标不同

差异标签只比较当前检索结果;所有PDB和assembly原始记录仍分别保留。

相关结构差异明细

一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。

PDB 条目 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法 实验环境 结构质量
6IEW The crystal structure of the dNxf2 UBA domain in complex with Panoramix 提交 2018-09-17 Assembly 1 信息不足 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 315–341(27 aa)
未记录 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;290 K;30%(w/v) PEG3350, 0.1M Tris (pH 9.0), 0.2M sodium acetate trihydrate
分辨率 1.50 Å R-free 0.173
6OPF Crystal structure of dmNxf2 UBA domain fused with Panoramix helix 提交 2019-04-24 Assembly 1 信息不足 同源多聚体;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致
链 A 311–340(30 aa)
链 B 311–340(30 aa)
链 D 311–340(30 aa)
链 F 311–340(30 aa)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;0.095 M Sodium citrate pH 5.6, 19% (v/v) Isopropanol, 19% (w/v) PEG 4000, 5% (v/v) Glycerol
分辨率 2.00 Å R-free 0.246
7K3J Crystal structure of dLC8 in complex with Panoramix TQT+TQ peptide 提交 2020-09-11 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric(6) 与蛋白数一致
链 B 455–480(26 aa) 片段:residues 455-480
链 H 455–480(26 aa) 片段:residues 455-480
未记录 SO4 SULFATE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 8.5;293 K;0.2 M Li2SO4, 0.1 M Tris pH 8.5, 40% (v/v) PEG 400
分辨率 2.50 Å R-free 0.272
7K3J Crystal structure of dLC8 in complex with Panoramix TQT+TQ peptide 提交 2020-09-11 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致
链 D 455–480(26 aa) 片段:residues 455-480
链 F 455–480(26 aa) 片段:residues 455-480
未记录 SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 8.5;293 K;0.2 M Li2SO4, 0.1 M Tris pH 8.5, 40% (v/v) PEG 400
分辨率 2.50 Å R-free 0.272
7K3K Crystal structure of dLC8 in complex with Panoramix TQT peptide 提交 2020-09-11 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致
链 B 455–467(13 aa) 片段:residues 445-467
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;0.1 M NH4Ac, 0.1 M Bis-Tris pH 5.5, 17% (w/v) PEG 10000
分辨率 1.42 Å R-free 0.201
7K3L Crystal structure of dLC8 in complex with Panoramix TQ peptide 提交 2020-09-11 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致
链 B 468–480(13 aa) 片段:residues 468-480
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 6 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;0.1 M KSCN, 30% (w/v) PEG 2000 MME
分辨率 1.79 Å R-free 0.209
7MKK Crystal structure of Drosophila Panoramix in complex with Sov NTD 提交 2021-04-24 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 C 83–109(27 aa)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;0.1 M CHES pH 9.5, 30% (w/v) PEG 3000
分辨率 2.50 Å R-free 0.260
7MKK Crystal structure of Drosophila Panoramix in complex with Sov NTD 提交 2021-04-24 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 D 83–109(27 aa)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;0.1 M CHES pH 9.5, 30% (w/v) PEG 3000
分辨率 2.50 Å R-free 0.260
7MKK Crystal structure of Drosophila Panoramix in complex with Sov NTD 提交 2021-04-24 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 F 83–109(27 aa)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;0.1 M CHES pH 9.5, 30% (w/v) PEG 3000
分辨率 2.50 Å R-free 0.260
7MKK Crystal structure of Drosophila Panoramix in complex with Sov NTD 提交 2021-04-24 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 H 83–109(27 aa)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;0.1 M CHES pH 9.5, 30% (w/v) PEG 3000
分辨率 2.50 Å R-free 0.260