当前蛋白身份:Q9WUB0
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 3B08 Crystal structure of the mouse HOIL1-L-NZF in complex with linear di-ubiquitin 提交 2011-06-07 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 B
192–250(59 aa)
片段:UNP residues 192-250
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未记录 | ZN ZINC ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;1.3M tri-sodium citrate, 90mM HEPES-NaOH buffer, 100mM potassium sodium tartrate, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
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分辨率 1.70 Å R-free 0.211 |
| 3B08 Crystal structure of the mouse HOIL1-L-NZF in complex with linear di-ubiquitin 提交 2011-06-07 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 E
192–250(59 aa)
片段:UNP residues 192-250
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未记录 | ZN ZINC ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;1.3M tri-sodium citrate, 90mM HEPES-NaOH buffer, 100mM potassium sodium tartrate, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.211 |
| 3B08 Crystal structure of the mouse HOIL1-L-NZF in complex with linear di-ubiquitin 提交 2011-06-07 | Assembly 3 其他组合 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 H
192–250(59 aa)
片段:UNP residues 192-250
|
未记录 | ZN ZINC ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;1.3M tri-sodium citrate, 90mM HEPES-NaOH buffer, 100mM potassium sodium tartrate, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
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分辨率 1.70 Å R-free 0.211 |
| 3B08 Crystal structure of the mouse HOIL1-L-NZF in complex with linear di-ubiquitin 提交 2011-06-07 | Assembly 4 其他组合 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 K
192–250(59 aa)
片段:UNP residues 192-250
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未记录 | ZN ZINC ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;1.3M tri-sodium citrate, 90mM HEPES-NaOH buffer, 100mM potassium sodium tartrate, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.211 |
| 3B0A Crystal structure of the mouse HOIL1-L-NZF in complex with linear di-ubiquitin 提交 2011-06-07 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 B
192–250(59 aa)
片段:UNP residues 192-250
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未记录 | TAM TRIS(HYDROXYETHYL)AMINOMETHANE × 1 ZN ZINC ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7;293 K;1.45M tri-ammonium citrate (pH 7.0), 3% 1,6-diaminohexane, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 20K, temperature 293K
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分辨率 1.90 Å R-free 0.227 |
| 3B0A Crystal structure of the mouse HOIL1-L-NZF in complex with linear di-ubiquitin 提交 2011-06-07 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 E
192–250(59 aa)
片段:UNP residues 192-250
|
未记录 | ZN ZINC ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7;293 K;1.45M tri-ammonium citrate (pH 7.0), 3% 1,6-diaminohexane, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 20K, temperature 293K
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分辨率 1.90 Å R-free 0.227 |
| 5Y3T Crystal structure of hetero-trimeric core of LUBAC: HOIP double-UBA complexed with HOIL-1L UBL and SHARPIN UBL 提交 2017-07-31 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致 |
链 A
1–140(140 aa)
片段:UNP residues 1-140
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未记录 | GOL GLYCEROL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293 K;Magnesium sulfate, MES
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分辨率 2.40 Å R-free 0.240 |
| 8IM5 Solution structure of the mouse HOIL1-L NZF domain in the free form 提交 2023-03-06 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致 |
链 A
192–250(59 aa)
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未记录 | ZN ZINC ION × 2 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 7;298 K;离子强度(mmCIF原始值)70;压力 1013.2
NMR测量条件
pH 7;298 K;离子强度(mmCIF原始值)70;压力 1013.2
NMR测量条件
pH 7;298 K;离子强度(mmCIF原始值)40;压力 1013.2
NMR样品组成
1 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] HOIL-1L NZF domain, 20 mM HEPES pH 7.0, 1 mM TCEP, 50 mM sodium chloride, 95% H2O/5% D2O | 95% H2O/5% D2O
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分辨率未提供 |