当前蛋白身份:Q9WUB0 重新检索
本组结构的主要差异维度
构建体不同 突变/修饰不同 组装状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量指标不同

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相关结构差异明细

一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。

PDB 条目 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法 实验环境 结构质量
3B08 Crystal structure of the mouse HOIL1-L-NZF in complex with linear di-ubiquitin 提交 2011-06-07 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 B 192–250(59 aa) 片段:UNP residues 192-250
未记录 ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;1.3M tri-sodium citrate, 90mM HEPES-NaOH buffer, 100mM potassium sodium tartrate, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
分辨率 1.70 Å R-free 0.211
3B08 Crystal structure of the mouse HOIL1-L-NZF in complex with linear di-ubiquitin 提交 2011-06-07 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 E 192–250(59 aa) 片段:UNP residues 192-250
未记录 ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;1.3M tri-sodium citrate, 90mM HEPES-NaOH buffer, 100mM potassium sodium tartrate, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
分辨率 1.70 Å R-free 0.211
3B08 Crystal structure of the mouse HOIL1-L-NZF in complex with linear di-ubiquitin 提交 2011-06-07 Assembly 3 其他组合 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 H 192–250(59 aa) 片段:UNP residues 192-250
未记录 ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;1.3M tri-sodium citrate, 90mM HEPES-NaOH buffer, 100mM potassium sodium tartrate, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
分辨率 1.70 Å R-free 0.211
3B08 Crystal structure of the mouse HOIL1-L-NZF in complex with linear di-ubiquitin 提交 2011-06-07 Assembly 4 其他组合 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 K 192–250(59 aa) 片段:UNP residues 192-250
未记录 ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;1.3M tri-sodium citrate, 90mM HEPES-NaOH buffer, 100mM potassium sodium tartrate, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
分辨率 1.70 Å R-free 0.211
3B0A Crystal structure of the mouse HOIL1-L-NZF in complex with linear di-ubiquitin 提交 2011-06-07 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 B 192–250(59 aa) 片段:UNP residues 192-250
未记录 TAM TRIS(HYDROXYETHYL)AMINOMETHANE × 1 ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7;293 K;1.45M tri-ammonium citrate (pH 7.0), 3% 1,6-diaminohexane, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 20K, temperature 293K
分辨率 1.90 Å R-free 0.227
3B0A Crystal structure of the mouse HOIL1-L-NZF in complex with linear di-ubiquitin 提交 2011-06-07 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 E 192–250(59 aa) 片段:UNP residues 192-250
未记录 ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7;293 K;1.45M tri-ammonium citrate (pH 7.0), 3% 1,6-diaminohexane, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 20K, temperature 293K
分辨率 1.90 Å R-free 0.227
5Y3T Crystal structure of hetero-trimeric core of LUBAC: HOIP double-UBA complexed with HOIL-1L UBL and SHARPIN UBL 提交 2017-07-31 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 A 1–140(140 aa) 片段:UNP residues 1-140
未记录 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293 K;Magnesium sulfate, MES
分辨率 2.40 Å R-free 0.240
8IM5 Solution structure of the mouse HOIL1-L NZF domain in the free form 提交 2023-03-06 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 192–250(59 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 2 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 7;298 K;离子强度(mmCIF原始值)70;压力 1013.2
NMR测量条件 pH 7;298 K;离子强度(mmCIF原始值)70;压力 1013.2
NMR测量条件 pH 7;298 K;离子强度(mmCIF原始值)40;压力 1013.2
NMR样品组成 1 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] HOIL-1L NZF domain, 20 mM HEPES pH 7.0, 1 mM TCEP, 50 mM sodium chloride, 95% H2O/5% D2O | 95% H2O/5% D2O
分辨率未提供