当前蛋白身份：Q9WYC4
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一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 3QF4 Crystal structure of a heterodimeric ABC transporter in its inward-facing conformation 提交 2011-01-21 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
1–598（598 aa）
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未记录 | ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；293.15 K；29% (w/v) polyethylene glycol 400, 50mM Na-cacodylate, 100mM CaCl2, 2.5mM AMP-PNP, 3mM MgCl2, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293.15K
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分辨率 2.90 Å R-free 0.263 |
| 4Q4A Improved model of AMP-PNP bound TM287/288 提交 2014-04-14 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
1–598（598 aa）
|
未记录 | ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 5.5；293.15 K；29% (w/v) polyethylene glycol 400, 50mM Na-cacodylate, 100mM CaCl2, 2.5mM AMP-PNP, 3mM MgCl2, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, temperature 293.15K
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.268 |
| 4Q4H TM287/288 in its apo state 提交 2014-04-14 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
1–598（598 aa）
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；293.15 K；26 % (w/v) polyethylene glycol (PEG) 400, 50 mM Na-cacodylate, 50 mM CaCl2, 2.5 mM ADP and 3 mM MgCl2, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293.15K
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分辨率 2.53 Å R-free 0.290 |
| 4Q4J Structure of crosslinked TM287/288_S498C_S520C mutant 提交 2014-04-14 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
1–598（598 aa）
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5；293.15 K；32 % PEG 400, 50 mM Na-Acetate pH 5 and 500 mM KCl, 2.5 mM AMP-PNP, 3 mM MgCl2, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293.15K
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分辨率 3.20 Å R-free 0.287 |
| 4Q7L Structure of NBD288 of TM287/288 提交 2014-04-25 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
353–598（246 aa）
片段：unp residues 353-598
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293.15 K；100 mM Tris-HAOAc pH 7.5, 200 mM MgCl2, 8 % PEG550 MME, 8 % PEG20000, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293.15K
|
分辨率 2.35 Å R-free 0.236 |
| 4Q7L Structure of NBD288 of TM287/288 提交 2014-04-25 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
353–598（246 aa）
片段：unp residues 353-598
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未记录 | NI NICKEL (II) ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293.15 K；100 mM Tris-HAOAc pH 7.5, 200 mM MgCl2, 8 % PEG550 MME, 8 % PEG20000, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293.15K
|
分辨率 2.35 Å R-free 0.236 |
| 4Q7L Structure of NBD288 of TM287/288 提交 2014-04-25 | Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 C
353–598（246 aa）
片段：unp residues 353-598
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293.15 K；100 mM Tris-HAOAc pH 7.5, 200 mM MgCl2, 8 % PEG550 MME, 8 % PEG20000, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293.15K
|
分辨率 2.35 Å R-free 0.236 |
| 4Q7M Structure of NBD288-Avi of TM287/288 提交 2014-04-25 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
353–598（246 aa）
片段：unp residues 353-598
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；293.15 K；100 mM Sodium acetate, 6 % PEG550 MME, 6 % PEG20000, 200 mM MgCl2, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293.15K
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.236 |
| 6QUZ Structure of ATPgS-bound outward-facing TM287/288 in complex with sybody Sb_TM35 提交 2019-03-01 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 B
1–598（598 aa）
片段：ABC transporter
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突变：E517A | AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4.6；293 K；0.1M Sodium acetate, 0.035M NaCl, 11.5% (w/v) PEG 6000
|
分辨率 3.21 Å R-free 0.263 |
| 6QUZ Structure of ATPgS-bound outward-facing TM287/288 in complex with sybody Sb_TM35 提交 2019-03-01 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 D
1–598（598 aa）
片段：ABC transporter
|
突变：E517A | AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4.6；293 K；0.1M Sodium acetate, 0.035M NaCl, 11.5% (w/v) PEG 6000
|
分辨率 3.21 Å R-free 0.263 |
| 6QV0 Structure of ATP-bound outward-facing TM287/288 in complex with sybody Sb_TM35 提交 2019-03-01 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 B
1–598（598 aa）
片段：ABC transporter
|
突变：D65A, E517A | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4.6；293 K；0.1M Sodium acetate, 0.025M NaCl, 12% (w/v) PEG 6000
|
分辨率 3.12 Å R-free 0.264 |
| 6QV0 Structure of ATP-bound outward-facing TM287/288 in complex with sybody Sb_TM35 提交 2019-03-01 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 D
1–598（598 aa）
片段：ABC transporter
|
突变：D65A, E517A | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4.6；293 K；0.1M Sodium acetate, 0.025M NaCl, 12% (w/v) PEG 6000
|
分辨率 3.12 Å R-free 0.264 |
| 6QV1 Structure of ATPgS-bound outward-facing TM287/288 in complex with nanobody Nb_TM1 提交 2019-03-01 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 B
1–598（598 aa）
片段：ABC transporter
|
突变：D65A, E517A | AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 9.5；293 K；0.05M Glycine, 0.225M NaCl, 21% (w/v) PEG 550MME
|
分辨率 3.48 Å R-free 0.303 |
| 6QV1 Structure of ATPgS-bound outward-facing TM287/288 in complex with nanobody Nb_TM1 提交 2019-03-01 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 D
1–598（598 aa）
片段：ABC transporter
|
突变：D65A, E517A | AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 9.5；293 K；0.05M Glycine, 0.225M NaCl, 21% (w/v) PEG 550MME
|
分辨率 3.48 Å R-free 0.303 |
| 6QV2 Structure of ATPgS-bound outward-facing TM287/288 in complex with nanobody Nb_TM#2 提交 2019-03-01 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 B
1–598（598 aa）
片段：ABC transporter
|
突变：D65A, E517A | AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；293 K；0.1M TRIS, 0.1M NaCl, 30% (v/v) PEG 400
|
分辨率 4.23 Å R-free 0.330 |
| 6QV2 Structure of ATPgS-bound outward-facing TM287/288 in complex with nanobody Nb_TM#2 提交 2019-03-01 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 D
1–598（598 aa）
片段：ABC transporter
|
突变：D65A, E517A | AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；293 K；0.1M TRIS, 0.1M NaCl, 30% (v/v) PEG 400
|
分辨率 4.23 Å R-free 0.330 |