当前蛋白身份:Q9WZF8 重新检索
本组结构的主要差异维度
构建体不同 突变/修饰不同 组装状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量指标不同

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相关结构差异明细

一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。

PDB 条目 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法 实验环境 结构质量
2NSA Structures of and interactions between domains of trigger factor from Themotoga maritim 提交 2006-11-03 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 244–405(162 aa)
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) SO4 SULFATE ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION;pH 7.4;293 K;1.35M ammonium sulfate 0.05M TrisCl, pH 7.4, VAPOR DIFFUSION, temperature 293K
分辨率 1.70 Å R-free 0.252
2NSA Structures of and interactions between domains of trigger factor from Themotoga maritim 提交 2006-11-03 Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 244–405(162 aa)
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) SO4 SULFATE ION × 6 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION;pH 7.4;293 K;1.35M ammonium sulfate 0.05M TrisCl, pH 7.4, VAPOR DIFFUSION, temperature 293K
分辨率 1.70 Å R-free 0.252
2NSB Structures of and interactions between domains of trigger factor from Themotoga maritima 提交 2006-11-03 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 1–109(109 aa)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION;pH 6.5;293 K;14% PEG 4000, 0.2M potassium chloride 0.2M, 0.1M MES, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, temperature 293K
分辨率 3.20 Å R-free 0.262
2NSB Structures of and interactions between domains of trigger factor from Themotoga maritima 提交 2006-11-03 Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 1–109(109 aa)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION;pH 6.5;293 K;14% PEG 4000, 0.2M potassium chloride 0.2M, 0.1M MES, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, temperature 293K
分辨率 3.20 Å R-free 0.262
2NSC Structures of and interactions between domains of trigger factor from Themotoga maritima 提交 2006-11-03 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 1–109(109 aa)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 6.5;293 K;15% PEG 4000, 0.2M potassium chloride, 0.1M MES, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K, pH 6.50
分辨率 2.20 Å R-free 0.260
2NSC Structures of and interactions between domains of trigger factor from Themotoga maritima 提交 2006-11-03 Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 1–109(109 aa)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 6.5;293 K;15% PEG 4000, 0.2M potassium chloride, 0.1M MES, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K, pH 6.50
分辨率 2.20 Å R-free 0.260
3GTY Promiscuous Substrate Recognition in Folding and Assembly Activities of the Trigger Factor Chaperone 提交 2009-03-28 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 X 1–425(425 aa)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 5.5;298 K;5-10 % PEG4000, 100 NaOAc, pH 5.5, vapor diffusion, hanging drop, temperature 298K
分辨率 3.40 Å R-free 0.329
3GTY Promiscuous Substrate Recognition in Folding and Assembly Activities of the Trigger Factor Chaperone 提交 2009-03-28 Assembly 2 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 X 1–425(425 aa)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 5.5;298 K;5-10 % PEG4000, 100 NaOAc, pH 5.5, vapor diffusion, hanging drop, temperature 298K
分辨率 3.40 Å R-free 0.329
3GU0 Promiscuous Substrate Recognition in Folding and Assembly Activities of the Trigger Factor Chaperone 提交 2009-03-28 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 1–405(405 aa) 片段:residues 1-405
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8;298 K;10-15% PEG4000, 200 MgCl2, 100 Tris, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 3.50 Å R-free 0.358
6J0A Crystal structure of E. coli methionine aminopeptidase enzyme and chaperone trigger factor fitted into the cryo-EM density map of the complex 提交 2018-12-22 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 Q 1–405(405 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 14.20 Å