当前蛋白身份：Q9X1H0
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一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1VJ2 Crystal structure of a novel family of manganese-containing cupin (tm1459) from thermotoga maritima at 1.65 A resolution 提交 2003-12-03 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–114（114 aa）
链 B
1–114（114 aa）
|
未记录 | MN MANGANESE (II) ION × 2 UNL UNKNOWN LIGAND × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION,SITTING DROP,NANODROP；pH 5.2；293 K；50% (v/v) PEG-200, 0.1M Phosphate-citrate pH 4.2 0.2M NaCl, pH 5.2, VAPOR DIFFUSION,SITTING DROP,NANODROP, temperature 293K
|
分辨率 1.65 Å R-free 0.249 |
| 5WSD Crystal structure of a cupin protein (tm1459) in apo form 提交 2016-12-06 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–114（114 aa）
链 B
1–114（114 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；25% Jeffamine ED-2001, 0.1M MES
|
分辨率 1.20 Å R-free 0.201 |
| 5WSE Crystal structure of a cupin protein (tm1459) in osmium (Os) substituted form I 提交 2016-12-06 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–114（114 aa）
链 D
1–114（114 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | OS OSMIUM ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；25% w/v polyethylene glycol 1500, 0.1M MES
|
分辨率 1.12 Å R-free 0.180 |
| 5WSE Crystal structure of a cupin protein (tm1459) in osmium (Os) substituted form I 提交 2016-12-06 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
1–114（114 aa）
链 C
1–114（114 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | OS OSMIUM ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；25% w/v polyethylene glycol 1500, 0.1M MES
|
分辨率 1.12 Å R-free 0.180 |
| 5WSF Crystal structure of a cupin protein (tm1459) in osmium (Os)-substituted form II 提交 2016-12-06 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–114（114 aa）
链 D
1–114（114 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | OS OSMIUM ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；25% w/v polyethylene glycol 1500, 0.1M MES
|
分辨率 1.11 Å R-free 0.183 |
| 5WSF Crystal structure of a cupin protein (tm1459) in osmium (Os)-substituted form II 提交 2016-12-06 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
1–114（114 aa）
链 C
1–114（114 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | OS OSMIUM ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；25% w/v polyethylene glycol 1500, 0.1M MES
|
分辨率 1.11 Å R-free 0.183 |
| 6L2D Crystal structure of a cupin protein (tm1459) in copper (Cu) substituted form 提交 2019-10-03 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–114（114 aa）
链 B
1–114（114 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | CU COPPER (II) ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；25%(w/v) Jeffamine ED-2001, 0.1M MES
|
分辨率 1.20 Å R-free 0.186 |
| 6L2E Crystal structure of a cupin protein (tm1459, H52A mutant) in copper (Cu) substituted form 提交 2019-10-03 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–114（114 aa）
链 B
1–114（114 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | CU COPPER (II) ION × 3 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；25% w/v Jeffamine ED-2001, 0.1M MES
|
分辨率 1.20 Å R-free 0.179 |
| 6L2F Crystal structure of a cupin protein (tm1459, H54AH58A mutant) in copper (Cu) substituted form 提交 2019-10-03 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–114（114 aa）
链 B
1–114（114 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | CU COPPER (II) ION × 2 P33 3,6,9,12,15,18-HEXAOXAICOSANE-1,20-DIOL × 1 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；25%(w/v) Jeffamine ED-2001, 0.1M MES
|
分辨率 1.23 Å R-free 0.188 |
| 8AWN Crystal structure of a manganese-containing cupin (tm1459) from Thermotoga maritima, variant C106Q 提交 2022-08-30 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–114（114 aa）
|
突变：C106Q | CL CHLORIDE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4；289 K；1 M LiCl
0.1 M citrate pH 4.0
20 % PEG6000
16 mg/ml protein concentration
|
分辨率 1.45 Å R-free 0.173 |
| 8AWO Crystal structure of a manganese-containing cupin (tm1459) from Thermotoga maritima, variant AIFQ (Y7A/M38I/Y83F/C106Q) 提交 2022-08-30 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–114（114 aa）
链 B
1–114（114 aa）
|
突变：Y7A, M38I, Y83F, C106Q 突变：Y7A, M38I, Y83F, C106Q | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；289 K；8 mg/ml protein concentration
0.1 M Tris pH 8.5
2 M ammonium sulfate
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.242 |
| 8AWP Crystal structure of a manganese-containing cupin (tm1459) from Thermotoga maritima, variant 208 (V19I/R23H/M38I/I60F/C106Q) 提交 2022-08-30 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–114（114 aa）
链 B
1–114（114 aa）
|
突变：V19I, R23H, M38I, I60F, C106Q 突变：V19I, R23H, M38I, I60F, C106Q | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；289 K；14.2 mg/ml protein concentration
1.6M Sodium citrate tribasic dihydrate pH 6.5
|
分辨率 1.59 Å R-free 0.208 |
| 8HJX Crystal structure of a cupin protein (tm1459, H52A/H58E mutant) in copper (Cu) substituted form 提交 2022-11-24 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–114（114 aa）
链 B
1–114（114 aa）
|
突变：H52A/H58E 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：H52A/H58E 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | CU COPPER (II) ION × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；25% w/v Jeffamine ED-2001, 0.1M MES pH6.0
|
分辨率 1.15 Å R-free 0.183 |
| 8HJY Crystal structure of a cupin protein (tm1459, H52A/H58E/F104W mutant) in copper (Cu) substituted form 提交 2022-11-24 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–114（114 aa）
链 B
1–114（114 aa）
|
突变：H52A/H58E/F104W 突变：H52A/H58E/F104W | CU COPPER (II) ION × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；25% w/v Jeffamine ED-2001, 0.1M MES pH 6.0
|
分辨率 1.18 Å R-free 0.191 |
| 8HJZ Crystal structure of a cupin protein (tm1459, H52A/H58Q mutant) in copper (Cu) substituted form 提交 2022-11-24 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–114（114 aa）
链 B
1–114（114 aa）
|
突变：H52A/H58Q 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：H52A/H58Q 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | CU COPPER (II) ION × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；25% w/v Jeffamine ED-2001, 0.1M MES pH 6.0
|
分辨率 1.22 Å R-free 0.188 |
| 8ZYG Crystal structure of a cupin protein (tm1459, I49C-4py/H52A/C106D mutant) in copper (Cu) substituted form 提交 2024-06-17 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–114（114 aa）
链 B
1–114（114 aa）
|
突变：I49C/H52A/C106D 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：I49C/H52A/C106D 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | P6G HEXAETHYLENE GLYCOL × 1 CU COPPER (II) ION × 2 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；26-28% w/v Jeffamine ED-2001, 0.1M MES pH6.0
|
分辨率 1.08 Å R-free 0.171 |
| 8ZYH Crystal structure of a cupin protein (tm1459, I49C-4py/H52A/H54A/C106D mutant) in copper (Cu) substituted form 提交 2024-06-17 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–114（114 aa）
链 B
1–114（114 aa）
|
突变：I49C/H52A/H54A/C106D 突变：I49C/H52A/H54A/C106D | P6G HEXAETHYLENE GLYCOL × 1 CU COPPER (II) ION × 3 KN6 4-THIOPYRIDINE × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；26-28% w/v Jeffamine ED-2001, 0.1M MES pH6.0
|
分辨率 1.07 Å R-free 0.163 |
| 9JET Crystal structure of a cupin protein (tm1459) in manganese (Mn) substituted form 提交 2024-09-03 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–114（114 aa）
链 B
1–114（114 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | MN MANGANESE (II) ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；25%(w/v) Jeffamine ED-2001, 0.1M MES
|
分辨率 1.19 Å R-free 0.201 |
| 9JEU Crystal structure of a cupin protein (tm1459) in iron (Fe) substituted form 提交 2024-09-03 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–114（114 aa）
链 B
1–114（114 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | FE FE (III) ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；25%(w/v) Jeffamine ED-2001, 0.1 M MES
|
分辨率 1.19 Å R-free 0.186 |
| 9JEV Crystal structure of a cupin protein (tm1459) in zinc (Zn) substituted form 提交 2024-09-03 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–114（114 aa）
链 B
1–114（114 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | ZN ZINC ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；25%(w/v) Jeffamine ED-2001, 0.1 M MES
|
分辨率 1.12 Å R-free 0.177 |
| 9JEW Crystal structure of a cupin protein (tm1459, C106V mutant) in iron (Fe) substituted form 提交 2024-09-03 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–114（114 aa）
链 B
1–114（114 aa）
|
突变：C106V 突变：C106V | FE FE (III) ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；25%(w/v) Jeffamine ED-2001, 0.1 M MES
|
分辨率 1.08 Å R-free 0.168 |
| 9XS8 Crystal structure of a cupin protein (tm1459, H52A/H54A/H92A/C106E mutant) in ruthenium(p-cymene) bound form 提交 2025-11-20 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–114（114 aa）
链 B
1–114（114 aa）
|
突变：H52A/H54A/H92A/C106E 突变：H52A/H54A/H92A/C106E | MML 1-methyl-4-(1-methylethyl)benzene × 1 RU RUTHENIUM ION × 2 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；25% w/v Jeffamine ED-2001, 0.1M MES
|
分辨率 1.26 Å R-free 0.198 |
| 9XS9 Crystal structure of a cupin protein (tm1459, R39K/H52A/H54A/H92A/C106E mutant) in ruthenium(p-cymene) bound form 提交 2025-11-20 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–114（114 aa）
链 B
1–114（114 aa）
|
突变：R39K/H52A/H54A/H92A/C106E 突变：R39K/H52A/H54A/H92A/C106E | MML 1-methyl-4-(1-methylethyl)benzene × 2 RU RUTHENIUM ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；25% w/v Jeffamine ED-2001, 0.1M MES
|
分辨率 1.09 Å R-free 0.161 |
| 9XSA Crystal structure of a cupin protein (tm1459, R39M/H52A/H54A/H92A/C106E mutant) in ruthenium(p-cymene) bound form 提交 2025-11-20 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–114（114 aa）
链 B
1–114（114 aa）
|
突变：R39M/H52A/H54A/H92A/C106E 突变：R39M/H52A/H54A/H92A/C106E | MML 1-methyl-4-(1-methylethyl)benzene × 2 RU RUTHENIUM ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；25% w/v Jeffamine ED-2001, 0.1M MES
|
分辨率 1.42 Å R-free 0.251 |