当前蛋白身份：Q9X2V7
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1PP5 Structure of Antibacterial Peptide Microcin J25: a 21-Residue Lariat Protoknot 提交 2003-06-16 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
38–58（21 aa）
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未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
298 K；离子强度（mmCIF原始值）NA；压力 ambient
NMR样品组成
2mM Microcin J25 U-13C,15N; 99.5% CD3OH, 0.5% H2O | 99.5% CD3OH, 0.5% H2O
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分辨率未提供 |
| 1Q71 The structure of microcin J25 is a threaded sidechain-to-backbone ring structure and not a head-to-tail cyclized backbone 提交 2003-08-14 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
38–58（21 aa）
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未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
298 K；离子强度（mmCIF原始值）0；压力 ambient
NMR样品组成
0.3 mg of microcin J25 | 100% CD3OH
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分辨率未提供 |
| 1S7P Solution structure of thermolysin digested microcin J25 提交 2004-01-30 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
38–47（10 aa）
片段：Residues 38-47
链 B
48–58（11 aa）
片段：Residues 48-58
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未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
295 K；离子强度（mmCIF原始值）0；压力 ambient
NMR样品组成
6mM t-MccJ25 | 100% CD3OH
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分辨率未提供 |
| 2MMT Lasso peptide-based integrin inhibitor: Microcin J25 variant with RGDF substitution of Gly12-Ile13-Gly14-Thr15 提交 2014-03-18 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
38–58（21 aa）
片段：UNP residues 38-58
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突变：G12R/I13G/G14D/T15F | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
298 K；压力 1.0
NMR样品组成
12.6 mM MCCJ25(RGDF), methanol | methanol
|
分辨率未提供 |
| 2MMW LASSO PEPTIDE BASED INTEGRIN INHIBITOR: MICROCIN J25 VARIANT WITH RGD SUBSTITUTION of GLY12-ILE13-GLY14 提交 2014-03-20 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
38–58（21 aa）
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突变：G12R, I13G, G14D | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
298 K；压力 ambient
NMR样品组成
11.6 mM MCCJ25(RGD), methanol | methanol
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分辨率未提供 |
| 4CU4 FhuA from E. coli in complex with the lasso peptide microcin J25 (MccJ25) 提交 2014-03-17 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
38–58（21 aa）
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未记录 | FTT 3-HYDROXY-TETRADECANOIC ACID × 4 DAO LAURIC ACID × 1 MYR MYRISTIC ACID × 1 LDA LAURYL DIMETHYLAMINE-N-OXIDE × 20 3PH 1,2-DIACYL-GLYCEROL-3-SN-PHOSPHATE × 1 DPO DIPHOSPHATE × 2 PO4 PHOSPHATE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 5；20 MM TRIS PH 7.5, 120 MM LITHIUM SULFATE, 100 MM SODIUM CITRATE PH 5, 20 % PEG300
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分辨率 2.30 Å R-free 0.255 |
| 5T56 [3]catenane from MccJ25 G12R/I13C/G21C lasso peptide 提交 2016-08-30 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
38–48（11 aa）
链 B
51–57（7 aa）
链 C
38–48（11 aa）
链 D
51–57（7 aa）
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突变：UNP residues 38-48 突变：UNP residues 51-57 突变：UNP residues 38-48 突变：UNP residues 51-57 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
295 K；压力 ambient
NMR样品组成
3.7 mg/mL [3]catenane from MccJ25 RCC lasso peptide, 95% H2O/5% D2O | 95% H2O/5% D2O
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分辨率未提供 |
| 6N60 Escherichia coli RNA polymerase sigma70-holoenzyme bound to upstream fork promoter DNA and Microcin J25 (MccJ25) 提交 2018-11-23 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：nonameric（9） 与全部聚合物一致 |
链 M
38–58（21 aa）
片段：UNP residues 38-58
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未记录 | MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.8；295 K；0.1 M HEPES, pH 6.7, 0.2 M magnesium chloride, 7% w/v PEG3350, 4% v/v glycerol
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分辨率 3.68 Å R-free 0.306 |