当前蛋白身份：Q9X4D0
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1D0Q STRUCTURE OF THE ZINC-BINDING DOMAIN OF BACILLUS STEAROTHERMOPHILUS DNA PRIMASE 提交 1999-09-14 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–103（103 aa）
片段：ZINC-BINDING DOMAIN
链 B
1–103（103 aa）
片段：ZINC-BINDING DOMAIN
|
未记录 | ZN ZINC ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.1；298 K；LITHIUM SULFATE, SODIUM CITRATE, ZINC ACETATE, pH 6.1, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298.0K
|
分辨率 1.71 Å R-free 0.225 |
| 1Z8S DnaB binding domain of DnaG (P16) from Bacillus stearothermophilus (residues 452-597) 提交 2005-03-31 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
451–597（147 aa）
片段：P16, Residues 451-597
|
未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 6.8；298 K；离子强度（mmCIF原始值）20mM potassium phosphate, 200mM sodium chloride；压力 ambient
NMR测量条件
pH 6.8；298 K；离子强度（mmCIF原始值）20mM potassium phosphate, 200mM sodium chloride；压力 ambient
NMR测量条件
pH 6.8；298 K；离子强度（mmCIF原始值）20mM potassium phosphate, 200mM sodium chloride；压力 ambient
NMR样品组成
1mM U-15N P16 | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
1mM U-15N U13C P16 | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
0.5mM U-15N P16 | 50% H2O/50% D2O
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分辨率未提供 |
| 2R6A Crystal Form BH1 提交 2007-09-05 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric（9） 与蛋白数一致 |
链 C
455–597（143 aa）
片段：Helicase Binding Domain
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | SO4 SULFATE ION × 12 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 6；298 K；1.0M Lithium Sulfate, 5% MPD, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, temperature 298K
|
分辨率 2.90 Å R-free 0.297 |
| 2R6C Crystal Form BH2 提交 2007-09-05 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：octadecameric（18） 与蛋白数一致 |
链 G
455–597（143 aa）
片段：Helicase Binding Domain
链 H
455–597（143 aa）
片段：Helicase Binding Domain
链 I
455–597（143 aa）
片段：Helicase Binding Domain
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 6.5；298 K；0.5M Sodium Succinate, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, temperature 298K
|
分辨率 4.00 Å R-free 0.344 |
| 4M4W Mechanistic implications for the bacterial primosome assembly of the structure of a helicase-helicase loader complex 提交 2013-08-07 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric（15） 与蛋白数一致 |
链 G
455–597（143 aa）
片段：Helicase Binding Domain (UNP residues 455-597)
链 H
455–597（143 aa）
片段：Helicase Binding Domain (UNP residues 455-597)
链 I
455–597（143 aa）
片段：Helicase Binding Domain (UNP residues 455-597)
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 8；290 K；11-13% w/v PEG3350, 0.2 M lithium sulfate, 50 mM TRIS, pH 8.0-8.3, VAPOR DIFFUSION, temperature 290K
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分辨率 6.10 Å R-free 0.392 |