当前蛋白身份:Q9Y263 重新检索
本组结构的主要差异维度
构建体不同 突变/修饰不同 组装状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量指标不同

差异标签只比较当前检索结果;所有PDB和assembly原始记录仍分别保留。

相关结构差异明细

一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。

PDB 条目 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法 实验环境 结构质量
2K89 Solution structure of a novel Ubiquitin-binding domain from Human PLAA (PFUC, Gly76-Pro77 cis isomer) 提交 2008-09-04 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 386–465(80 aa) 片段:UNP residues 386-465
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 6.5;298 K;离子强度(mmCIF原始值)50mM NaCl;压力 ambient
NMR样品组成 1 mM [U-99% 13C; U-99% 15N] PFUC_cis, 90% H2O, 10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 1 mM [U-99% 13C; U-99% 15N] PFUC_cis, 100% D2O | 100% D2O
分辨率未提供
2K8A Solution structure of a novel Ubiquitin-binding domain from Human PLAA (PFUC, Gly76-Pro77 trans isomer) 提交 2008-09-04 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 386–465(80 aa) 片段:UNP residues 386-465
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 6.5;298 K;离子强度(mmCIF原始值)50mM NaCl;压力 ambient
NMR样品组成 1 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] PFUC_trans, 90% H2O, 10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 1 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] PFUC_trans, 100% D2O | 100% D2O
分辨率未提供
2K8B Solution structure of PLAA family ubiquitin binding domain (PFUC) cis isomer in complex with ubiquitin 提交 2008-09-04 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 B 386–465(80 aa) 片段:UNP residues 386-465
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 6.5;298 K;离子强度(mmCIF原始值)50mM NaCl;压力 ambient
NMR样品组成 0.2 mM Ubiquitin, 90% H2O, 10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 0.2 mM PFUC_cis, 90% H2O, 10% D2O | 90% H2O/10% D2O
分辨率未提供
2K8C Solution structure of PLAA family ubiquitin binding domain (PFUC) trans isomer in complex with ubiquitin 提交 2008-09-04 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 B 386–465(80 aa) 片段:UNP residues 386-465
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 6.5;298 K;离子强度(mmCIF原始值)50mM NaCl;压力 ambient
NMR样品组成 0.2 mM [U-100% 15N] Ubiquitin, 90% H2O, 10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 0.2 mM [U-100% 15N] PFUC_trans, 90% H2O, 10% D2O | 90% H2O/10% D2O
分辨率未提供
3EBB PLAP/P97 complex 提交 2008-08-27 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致
链 A 511–794(284 aa) 片段:PUL DOMAIN, residues 511-795
链 B 511–794(284 aa) 片段:PUL DOMAIN, residues 511-795
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8.5;298 K;30% PEG 4000, 0.1 M TRIS, PH 8.50, 0.2 M MGCL2, , VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 1.90 Å R-free 0.248
3EBB PLAP/P97 complex 提交 2008-08-27 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致
链 C 511–794(284 aa) 片段:PUL DOMAIN, residues 511-795
链 D 511–794(284 aa) 片段:PUL DOMAIN, residues 511-795
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8.5;298 K;30% PEG 4000, 0.1 M TRIS, PH 8.50, 0.2 M MGCL2, , VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 1.90 Å R-free 0.248