当前蛋白身份:Q9Y279 重新检索
本组结构的主要差异维度
构建体不同 突变/修饰不同 组装状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量指标不同

差异标签只比较当前检索结果;所有PDB和assembly原始记录仍分别保留。

相关结构差异明细

一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。

PDB 条目 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法 实验环境 结构质量
2ICC Extracellular Domain of CRIg 提交 2006-09-12 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 19–137(119 aa) 片段:extracellular domain of CRIG
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 EVAPORATION;pH 6.4;298 K;pH 6.4, EVAPORATION, temperature 298K
分辨率 1.20 Å R-free 0.172
2ICE CRIg bound to C3c 提交 2006-09-12 Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致
链 S 19–137(119 aa)
未记录 CA CALCIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 3.10 Å R-free 0.295
2ICE CRIg bound to C3c 提交 2006-09-12 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致
链 T 19–137(119 aa)
未记录 CA CALCIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 3.10 Å R-free 0.295
2ICF CRIg bound to C3b 提交 2006-09-12 Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 S 19–137(119 aa)
未记录 CA CALCIUM ION × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 EVAPORATION;pH 6.5;293 K;pH 6.5, EVAPORATION, temperature 293K
分辨率 4.10 Å R-free 0.330
5IMK Nanobody targeting human Vsig4 in Spacegroup C2 提交 2016-03-06 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 19–232(214 aa) 片段:UNP residues 19-232
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;0.1M Sodium citrate tribasic dehydrate pH5.6, 20% 2-Propanol, 20% PEG 4000
分辨率 1.23 Å R-free 0.185
5IML Nanobody targeting human Vsig4 in Spacegroup P212121 提交 2016-03-06 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 19–232(214 aa) 片段:UNP residues 19-232
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;(1) 1.2M sodium citrate tribasic dehydrate, 0.1M BIS-TRIS propane pH7.0 and (2) 0.17M Ammonium sulfate, 15% Glycerol, 25.5% PEG 4000
分辨率 1.80 Å R-free 0.226
8TE5 Crystal structure of a multiple lysine-to-arginine substitution mutant of the human CRIg C3b-binding domain 提交 2023-07-05 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 20–137(118 aa)
突变:K15R,K36R,K62R,K72R,K110R 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293 K;0.1 M sodium aaetate (pH 6.5) 0.2 M ammonium acetate 30% (w/v) peg-4000
分辨率 1.50 Å R-free 0.223
8TE6 Crystal structure of a multiple lysine-to-arginine substitution mutant of the human CRIg C3b-binding domain 提交 2023-07-05 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 20–137(118 aa)
突变:K15R,K36R,K62R,K72R,K110R 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293 K;0.1 M sodium acetate (pH 6.5) 0.2 M ammonium acetate 30% (w/v) PEG-4000
分辨率 1.25 Å R-free 0.196
9EZH Structure of single-domain antibody VHH_h4 in complex with human Vsig4 提交 2024-04-12 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 20–137(118 aa)
未记录 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293 K;0,1M Bis-Tris pH 6.0 and 24% PEG3350
分辨率 1.94 Å R-free 0.239
9EZI Structure of single-domain antibody VHH_h5 in complex with human Vsig4 提交 2024-04-12 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 20–137(118 aa)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293 K;0,1M Bis-Tris pH 6.5 and 30% PEG3350
分辨率 1.97 Å R-free 0.243
9EZU Structure of the single-domain antibody VHH_h1 in complex with human Vsig4 提交 2024-04-14 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 20–137(118 aa)
未记录 SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;287 K;0,17M ammonium sulfate 15% glycerol 25,5% PEG 4000
分辨率 1.05 Å R-free 0.176
9EZV Structure of the single-domain antibody VHH_h2 in complex with human Vsig4 提交 2024-04-14 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 20–137(118 aa)
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 8 IPA ISOPROPYL ALCOHOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 5.6;287 K;0,1M Na-citrate pH 5,6 20% 2-propanol 21% PEG 4000
分辨率 1.45 Å R-free 0.215
9EZW Structure of the single-domain antibody VHH_h3 in complex with human Vsig4 提交 2024-04-14 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 20–137(118 aa)
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 5.6;294 K;0,1M Na-citrate pH 5,6 20% 2-propanol 21% PEG 4000
分辨率 1.90 Å R-free 0.228
9EZW Structure of the single-domain antibody VHH_h3 in complex with human Vsig4 提交 2024-04-14 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 C 20–137(118 aa)
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 5.6;294 K;0,1M Na-citrate pH 5,6 20% 2-propanol 21% PEG 4000
分辨率 1.90 Å R-free 0.228
9EZW Structure of the single-domain antibody VHH_h3 in complex with human Vsig4 提交 2024-04-14 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 E 20–137(118 aa)
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 5.6;294 K;0,1M Na-citrate pH 5,6 20% 2-propanol 21% PEG 4000
分辨率 1.90 Å R-free 0.228
9EZW Structure of the single-domain antibody VHH_h3 in complex with human Vsig4 提交 2024-04-14 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 G 20–137(118 aa)
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 4 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 5.6;294 K;0,1M Na-citrate pH 5,6 20% 2-propanol 21% PEG 4000
分辨率 1.90 Å R-free 0.228