当前蛋白身份:Q9Y279
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2ICC Extracellular Domain of CRIg 提交 2006-09-12 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致 |
链 A
19–137(119 aa)
片段:extracellular domain of CRIG
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
EVAPORATION;pH 6.4;298 K;pH 6.4, EVAPORATION, temperature 298K
|
分辨率 1.20 Å R-free 0.172 |
| 2ICE CRIg bound to C3c 提交 2006-09-12 | Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致 |
链 S
19–137(119 aa)
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 3.10 Å R-free 0.295 |
| 2ICE CRIg bound to C3c 提交 2006-09-12 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致 |
链 T
19–137(119 aa)
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 3.10 Å R-free 0.295 |
| 2ICF CRIg bound to C3b 提交 2006-09-12 | Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致 |
链 S
19–137(119 aa)
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
EVAPORATION;pH 6.5;293 K;pH 6.5, EVAPORATION, temperature 293K
|
分辨率 4.10 Å R-free 0.330 |
| 5IMK Nanobody targeting human Vsig4 in Spacegroup C2 提交 2016-03-06 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 A
19–232(214 aa)
片段:UNP residues 19-232
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;0.1M Sodium citrate tribasic dehydrate pH5.6, 20% 2-Propanol, 20% PEG 4000
|
分辨率 1.23 Å R-free 0.185 |
| 5IML Nanobody targeting human Vsig4 in Spacegroup P212121 提交 2016-03-06 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 A
19–232(214 aa)
片段:UNP residues 19-232
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;(1) 1.2M sodium citrate tribasic dehydrate, 0.1M BIS-TRIS propane pH7.0 and (2) 0.17M Ammonium sulfate, 15% Glycerol, 25.5% PEG 4000
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.226 |
| 8TE5 Crystal structure of a multiple lysine-to-arginine substitution mutant of the human CRIg C3b-binding domain 提交 2023-07-05 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致 |
链 A
20–137(118 aa)
|
突变:K15R,K36R,K62R,K72R,K110R | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293 K;0.1 M sodium aaetate (pH 6.5)
0.2 M ammonium acetate
30% (w/v) peg-4000
|
分辨率 1.50 Å R-free 0.223 |
| 8TE6 Crystal structure of a multiple lysine-to-arginine substitution mutant of the human CRIg C3b-binding domain 提交 2023-07-05 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致 |
链 A
20–137(118 aa)
|
突变:K15R,K36R,K62R,K72R,K110R | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293 K;0.1 M sodium acetate (pH 6.5)
0.2 M ammonium acetate
30% (w/v) PEG-4000
|
分辨率 1.25 Å R-free 0.196 |
| 9EZH Structure of single-domain antibody VHH_h4 in complex with human Vsig4 提交 2024-04-12 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 A
20–137(118 aa)
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未记录 | GOL GLYCEROL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293 K;0,1M Bis-Tris pH 6.0 and 24% PEG3350
|
分辨率 1.94 Å R-free 0.239 |
| 9EZI Structure of single-domain antibody VHH_h5 in complex with human Vsig4 提交 2024-04-12 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 A
20–137(118 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293 K;0,1M Bis-Tris pH 6.5 and 30% PEG3350
|
分辨率 1.97 Å R-free 0.243 |
| 9EZU Structure of the single-domain antibody VHH_h1 in complex with human Vsig4 提交 2024-04-14 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 A
20–137(118 aa)
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;287 K;0,17M ammonium sulfate
15% glycerol
25,5% PEG 4000
|
分辨率 1.05 Å R-free 0.176 |
| 9EZV Structure of the single-domain antibody VHH_h2 in complex with human Vsig4 提交 2024-04-14 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 A
20–137(118 aa)
|
未记录 | EDO 1,2-ETHANEDIOL × 8 IPA ISOPROPYL ALCOHOL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 5.6;287 K;0,1M Na-citrate
pH 5,6
20% 2-propanol
21% PEG 4000
|
分辨率 1.45 Å R-free 0.215 |
| 9EZW Structure of the single-domain antibody VHH_h3 in complex with human Vsig4 提交 2024-04-14 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 A
20–137(118 aa)
|
未记录 | EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 5.6;294 K;0,1M Na-citrate
pH 5,6
20% 2-propanol
21% PEG 4000
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.228 |
| 9EZW Structure of the single-domain antibody VHH_h3 in complex with human Vsig4 提交 2024-04-14 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 C
20–137(118 aa)
|
未记录 | EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 5.6;294 K;0,1M Na-citrate
pH 5,6
20% 2-propanol
21% PEG 4000
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.228 |
| 9EZW Structure of the single-domain antibody VHH_h3 in complex with human Vsig4 提交 2024-04-14 | Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 E
20–137(118 aa)
|
未记录 | EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 5.6;294 K;0,1M Na-citrate
pH 5,6
20% 2-propanol
21% PEG 4000
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.228 |
| 9EZW Structure of the single-domain antibody VHH_h3 in complex with human Vsig4 提交 2024-04-14 | Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 G
20–137(118 aa)
|
未记录 | EDO 1,2-ETHANEDIOL × 4 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 5.6;294 K;0,1M Na-citrate
pH 5,6
20% 2-propanol
21% PEG 4000
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.228 |