当前蛋白身份：Q9Y2T5
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 6LI0 Crystal structure of GPR52 in complex with agonist c17 提交 2019-12-10 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
17–236（220 aa）
链 A
261–340（80 aa）
|
突变：A130W,Y1098W,A264L,W278Q,C314P,S318A,N321D,V323T 突变：A130W,Y1098W,A264L,W278Q,C314P,S318A,N321D,V323T | EN6 N-(2-hydroxyethyl)-5-(hydroxymethyl)-3-methyl-1-[2-[[3-(trifluoromethyl)phenyl]methyl]-1-benzothiophen-7-yl]pyrazole-4-carboxamide × 1 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 OLC (2R)-2,3-dihydroxypropyl (9Z)-octadec-9-enoate × 17 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 8 FLC CITRATE ANION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
LIPIDIC CUBIC PHASE；pH 5；293 K；0.13-0.18 M sodium acetate,
0.1 M sodium citrate PH5.0,
32-35% PEG400
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.220 |
| 6LI1 Crystal structure of GPR52 ligand free form with flavodoxin fusion 提交 2019-12-10 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
17–236（220 aa）
链 A
265–341（77 aa）
|
突变：A130W,Y1098W,W278Q,C314P,S318A,N321D,V323T 突变：A130W,Y1098W,W278Q,C314P,S318A,N321D,V323T | OLC (2R)-2,3-dihydroxypropyl (9Z)-octadec-9-enoate × 2 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 PGE TRIETHYLENE GLYCOL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
LIPIDIC CUBIC PHASE；pH 5；293 K；0.1 M potassium acetate, 0.1 M sodium citrate pH 5.0, and 30% PEG400
|
分辨率 2.90 Å R-free 0.267 |
| 6LI2 Crystal structure of GPR52 ligand free form with rubredoxin fusion 提交 2019-12-10 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
17–235（219 aa）
链 A
265–340（76 aa）
|
突变：W278Q, C314P, S318A, N321D, V323T 突变：W278Q, C314P, S318A, N321D, V323T | ZN ZINC ION × 1 OLC (2R)-2,3-dihydroxypropyl (9Z)-octadec-9-enoate × 11 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
LIPIDIC CUBIC PHASE；293 K；0.08-0.1 M magnesium sulphate, 0.1 M sodium cacodylate trihydrate pH 6.2, and 28-31% PEG300
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.263 |
| 6LI3 cryo-EM structure of GPR52-miniGs-NB35 提交 2019-12-10 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 R
1–340（340 aa）
|
突变：A130W, C314P | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.32 Å |
| 8HMP GPR52 with Gs and c17 提交 2022-12-05 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 R
1–324（324 aa）
|
未记录 | EN6 N-(2-hydroxyethyl)-5-(hydroxymethyl)-3-methyl-1-[2-[[3-(trifluoromethyl)phenyl]methyl]-1-benzothiophen-7-yl]pyrazole-4-carboxamide × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.77 Å |
| 9IJR Cryo-EM structure of the orphan GPR52 beta-arrestin 1 complex bound to ligand c17 提交 2024-06-25 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：tetrameric（4） 待复核 |
链 A
1–340（340 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | EN6 N-(2-hydroxyethyl)-5-(hydroxymethyl)-3-methyl-1-[2-[[3-(trifluoromethyl)phenyl]methyl]-1-benzothiophen-7-yl]pyrazole-4-carboxamide × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.86 Å |
| 9IJS Cryo-EM structure of the orphan GPR52 bound to beta-arrestin 1 in ligand-free state 提交 2024-06-25 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：tetrameric（4） 待复核 |
链 A
1–340（340 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.64 Å |