当前蛋白身份：Q9Y5T5
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2I50 Solution Structure of Ubp-M Znf-UBP domain 提交 2006-08-23 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
22–143（122 aa）
片段：Znf-UBP domain, residues 22-143
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未记录 | ZN ZINC ION × 3 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 7；300 K；离子强度（mmCIF原始值）100 mM KCl；压力 1
NMR样品组成
1mM U-15N,13C, 25 mM Sodium Phosphate, 100 mM KCl, 95% H2O, 5% D2O | 95% H2O/5% D2O
NMR样品组成
1mM U-15N, 25 mM Sodium Phosphate, 100 mM KCl, 95% H2O, 5% D2O | 95% H2O/5% D2O
NMR样品组成
1mM U-15N, 13C, 25 mM Sodium Phosphate, 100 mM KCl, 100% D2O | 100% D2O
NMR样品组成
Unlabeled, 25 mM Sodium Phosphate, 100 mM KCl, 100% D2O | 100% D2O
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分辨率未提供 |
| 8WG5 Cryo-EM structure of USP16 bound to H2AK119Ub nucleosome 提交 2023-09-20 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric（12） 与全部聚合物一致 |
链 M
1–823（823 aa）
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未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 3.05 Å |
| 9YCW Crystal structure of USP16 ZnF-UBP domain 提交 2025-09-19 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
22–144（123 aa）
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未记录 | ZN ZINC ION × 3 GOL GLYCEROL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；30% (w/v) Glycerol
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.172 |
| 9YCW Crystal structure of USP16 ZnF-UBP domain 提交 2025-09-19 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
22–144（123 aa）
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未记录 | ZN ZINC ION × 3 GOL GLYCEROL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；30% (w/v) Glycerol
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.172 |
| 9YCW Crystal structure of USP16 ZnF-UBP domain 提交 2025-09-19 | Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 C
22–144（123 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 3 GOL GLYCEROL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；30% (w/v) Glycerol
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分辨率 1.80 Å R-free 0.172 |