当前蛋白身份：Q9Y5X3
重新检索
差异标签只比较当前检索结果；所有PDB和assembly原始记录仍分别保留。
相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1SYS Crystal structure of HLA, B*4403, and peptide EEPTVIKKY 提交 2004-04-01 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 C
257–265（9 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.8；295 K；PEG 4000, 0.2M Ammonium Acetate, 0.2M Sodium Citrate, pH 5.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.271 |
| 5TGH Structure of the SNX5 PX domain in complex with chlamydial protein IncE in space group P32 提交 2016-09-27 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
22–170（149 aa）
片段：UNP residues 22-170
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.5；295 K；1.26 M (NH4)2SO4, acetate (pH 4.5), 0.2 M NaCl
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.254 |
| 5TGH Structure of the SNX5 PX domain in complex with chlamydial protein IncE in space group P32 提交 2016-09-27 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 C
22–170（149 aa）
片段：UNP residues 22-170
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.5；295 K；1.26 M (NH4)2SO4, acetate (pH 4.5), 0.2 M NaCl
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.254 |
| 5TGH Structure of the SNX5 PX domain in complex with chlamydial protein IncE in space group P32 提交 2016-09-27 | Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 E
22–170（149 aa）
片段：UNP residues 22-170
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.5；295 K；1.26 M (NH4)2SO4, acetate (pH 4.5), 0.2 M NaCl
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.254 |
| 5TGH Structure of the SNX5 PX domain in complex with chlamydial protein IncE in space group P32 提交 2016-09-27 | Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 G
22–170（149 aa）
片段：UNP residues 22-170
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.5；295 K；1.26 M (NH4)2SO4, acetate (pH 4.5), 0.2 M NaCl
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.254 |
| 5TGI Structure of the SNX5 PX domain in complex with chlamydial protein IncE in space group P212121 提交 2016-09-28 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
22–170（149 aa）
片段：UNP residues 22-170
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；295 K；0.2 M KSCN, 25% PEG 2K MME, 100 mM sodium acetate (pH 5.5)
|
分辨率 1.98 Å R-free 0.226 |
| 5TGI Structure of the SNX5 PX domain in complex with chlamydial protein IncE in space group P212121 提交 2016-09-28 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
22–170（149 aa）
片段：UNP residues 22-170
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；295 K；0.2 M KSCN, 25% PEG 2K MME, 100 mM sodium acetate (pH 5.5)
|
分辨率 1.98 Å R-free 0.226 |
| 5TGJ Structure of the SNX5 PX domain in complex with chlamydial protein IncE in space group I2 提交 2016-09-28 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
22–170（149 aa）
片段：UNP residues 22-170
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 3.5；295 K；0.1 M NaCl, 0.1 M MgCl2, 0.1 M Nacitrate (pH 3.5), 12 % PEG 4000
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.243 |
| 5TGJ Structure of the SNX5 PX domain in complex with chlamydial protein IncE in space group I2 提交 2016-09-28 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 C
22–170（149 aa）
片段：UNP residues 22-170
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 3.5；295 K；0.1 M NaCl, 0.1 M MgCl2, 0.1 M Nacitrate (pH 3.5), 12 % PEG 4000
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.243 |
| 5WY2 Human Snx5 PX domain in complex with Chlamydia IncE C terminus 提交 2017-01-10 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
20–180（161 aa）
片段：UNP residues 20-180
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.2M Ammonium acetate, 0.1M Sodium acetate pH 4.6, 30% w/v Polyethylene glycol 4000
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.223 |
| 5WY2 Human Snx5 PX domain in complex with Chlamydia IncE C terminus 提交 2017-01-10 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 C
20–180（161 aa）
片段：UNP residues 20-180
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.2M Ammonium acetate, 0.1M Sodium acetate pH 4.6, 30% w/v Polyethylene glycol 4000
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.223 |
| 6N5X Crystal structure of the SNX5 PX domain in complex with the CI-MPR (space group P212121 - Form 1) 提交 2018-11-22 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
22–170（149 aa）
|
未记录 | GOL GLYCEROL × 1 JEF O-(O-(2-AMINOPROPYL)-O'-(2-METHOXYETHYL)POLYPROPYLENE GLYCOL 500) × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 6.5；293 K；75% of 0.2 M (NH4)SO4, 0.1 M MES pH 6.5, 30% (w/v) PEG5000 MME + 15% glycerol + 40% v/v Polypropylene glycol P400
|
分辨率 2.05 Å R-free 0.234 |
| 6N5Y Crystal structure of the SNX5 PX domain in complex with the CI-MPR (space group P212121 - Form 1) 提交 2018-11-22 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
22–170（149 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 6.5；293 K；75% of 0.2 M (NH4)SO4, 0.1 M MES pH 6.5, 30% (w/v) PEG5000 MME + 15% glycerol + 30% v/v (+/-)-2-Methyl-2,4-pentanediol
|
分辨率 2.26 Å R-free 0.235 |
| 6N5Z Crystal structure of the SNX5 PX domain in complex with the Sema4C 提交 2018-11-22 | Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
22–170（149 aa）
链 B
22–170（149 aa）
|
未记录 | CL CHLORIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 8；293 K；25% PEG3350, 0.1 M Tris (pH 8.0), 5% Cymal-7
|
分辨率 2.45 Å R-free 0.274 |
| 8A1G Structure of the SNX1-SNX5 complex 提交 2022-06-01 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 C
195–404（210 aa）
|
未记录 | POL N-PROPANOL × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；292 K；11%PVA, 10% 1-propanol, 100mM Hepes pH 7.5
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.284 |
| 8A1G Structure of the SNX1-SNX5 complex 提交 2022-06-01 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 D
195–404（210 aa）
|
未记录 | POL N-PROPANOL × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；292 K；11%PVA, 10% 1-propanol, 100mM Hepes pH 7.5
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.284 |
| 8ABQ Structure of the SNX1-SNX5 complex, Pt derivative 提交 2022-07-04 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 C
195–404（210 aa）
|
未记录 | PT PLATINUM (II) ION × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；292 K；11% PVA, 10% 1-propanol, 100mM HEPES pH 7.5
|
分辨率 2.81 Å R-free 0.305 |
| 8ABQ Structure of the SNX1-SNX5 complex, Pt derivative 提交 2022-07-04 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 D
195–404（210 aa）
|
未记录 | PT PLATINUM (II) ION × 5 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；292 K；11% PVA, 10% 1-propanol, 100mM HEPES pH 7.5
|
分辨率 2.81 Å R-free 0.305 |
| 8AFZ Architecture of the ESCPE-1 membrane coat 提交 2022-07-18 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 B
1–404（404 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；Incubation time 30s
Blotting time 2s
|
分辨率 10.00 Å |
| 9IAE Structure of a Chimeric Protein Composed of the SNX5 PX Domain and the N-Terminal Region of NCOA7-AS, crystal form I 提交 2025-02-10 | Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
25–170（146 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；291 K；0.2 M Calcium acetate hydrate
0.1 M Sodium Cacodylate pH 6.5
18% PEG 8000
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.240 |
| 9IGY Structure of a Chimeric Protein Composed of the SNX5 PhoX Domain and the N-terminal domain of NCOA7-AS,crystal form II 提交 2025-02-20 | Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
25–170（146 aa）
链 C
25–170（146 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；291 K；0.1 M Sodium citrate tribasic dihydrate pH 5.0, 30% v/v Jeffamine ED-2001 pH 7.0
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.262 |
| 9IGY Structure of a Chimeric Protein Composed of the SNX5 PhoX Domain and the N-terminal domain of NCOA7-AS,crystal form II 提交 2025-02-20 | Assembly 2 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
25–170（146 aa）
链 D
25–170（146 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；291 K；0.1 M Sodium citrate tribasic dihydrate pH 5.0, 30% v/v Jeffamine ED-2001 pH 7.0
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.262 |