当前蛋白身份：Q9Y5Y4
重新检索
差异标签只比较当前检索结果；所有PDB和assembly原始记录仍分别保留。
相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 6D26 Crystal structure of the prostaglandin D2 receptor CRTH2 with fevipiprant 提交 2018-04-13 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–236（236 aa）
片段：CRTH2 (UNP residues 1-236), T4 ligase (UNP residues 2-12,61-161), CRTH2 (UNP residues 238-339)
链 A
238–339（102 aa）
片段：CRTH2 (UNP residues 1-236), T4 ligase (UNP residues 2-12,61-161), CRTH2 (UNP residues 238-339)
|
突变：N25A,G237ADLGLQHR,A1298C 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：N25A,G237ADLGLQHR,A1298C 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | FSY fevipiprant × 1 SO4 SULFATE ION × 9 SIN SUCCINIC ACID × 5 PGE TRIETHYLENE GLYCOL × 1 OLA OLEIC ACID × 1 PGO S-1,2-PROPANEDIOL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
LIPIDIC CUBIC PHASE；pH 6.5；289 K；100 mM MES, pH 6.5, 100 mM ammonium sulfate, 30% PEG400, 2% P400, 1 mM succinic acid
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.280 |
| 6D27 Crystal structure of the prostaglandin D2 receptor CRTH2 with CAY10471 提交 2018-04-13 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–236（236 aa）
片段：CRTH2 (UNP residues 1-236), T4 ligase (UNP residues 2-12,61-161), CRTH2 (UNP residues 238-339)
链 A
238–339（102 aa）
片段：CRTH2 (UNP residues 1-236), T4 ligase (UNP residues 2-12,61-161), CRTH2 (UNP residues 238-339)
|
突变：N25A,G237ADLGLQHR,A1298C 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：N25A,G237ADLGLQHR,A1298C 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | SO4 SULFATE ION × 7 FT4 [(3R)-3-{[(4-fluorophenyl)sulfonyl](methyl)amino}-1,2,3,4-tetrahydro-9H-carbazol-9-yl]acetic acid × 1 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1 OLA OLEIC ACID × 2 PGE TRIETHYLENE GLYCOL × 2 PGO S-1,2-PROPANEDIOL × 4 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
LIPIDIC CUBIC PHASE；pH 6.5；289 K；30% PEG300, 100 mM MES, pH 6.5, 100 mM ammonium sulfate, 2% P400
|
分辨率 2.74 Å R-free 0.280 |
| 7M8W XFEL crystal structure of the prostaglandin D2 receptor CRTH2 in complex with 15R-methyl-PGD2 提交 2021-03-30 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–236（236 aa）
链 A
238–339（102 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | YSS 15R-methyl-prostaglandin D2 × 1 NA SODIUM ION × 1 FLC CITRATE ANION × 1 SO4 SULFATE ION × 5 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
LIPIDIC CUBIC PHASE；pH 6；283 K；sodium chloride, lithium sulphate, sodium citrate tribasic dihydrate, PEG 300, propylene glycol P400, PGD2
|
分辨率 2.61 Å R-free 0.267 |
| 8XXU Cryo-EM Structure of the Prostaglandin D2 Receptor 2 Coupled to G Protein 提交 2024-01-19 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 A
1–346（346 aa）
|
未记录 | A1D5Q [(2~{R})-1-hexadecanoyloxy-3-[oxidanyl-[(2~{S},3~{R},5~{R},6~{S})-2,3,4,5,6-pentakis(oxidanyl)cyclohexyl]oxy-phosphoryl]oxy-propan-2-yl] (~{Z})-octadec-9-enoate × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.54 Å |
| 8XXV Cryo-EM Structure of the Prostaglandin D2 Receptor 2-indomethacin Coupled to G Protein 提交 2024-01-19 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 A
1–348（348 aa）
|
未记录 | A1D5Q [(2~{R})-1-hexadecanoyloxy-3-[oxidanyl-[(2~{S},3~{R},5~{R},6~{S})-2,3,4,5,6-pentakis(oxidanyl)cyclohexyl]oxy-phosphoryl]oxy-propan-2-yl] (~{Z})-octadec-9-enoate × 1 IMN INDOMETHACIN × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.33 Å |
| 9IYB Cryo-EM Structure of the Prostaglandin D2 Receptor 2-PGD2 Coupled to G Protein 提交 2024-07-30 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 A
1–395（395 aa）
|
未记录 | A1D5Q [(2~{R})-1-hexadecanoyloxy-3-[oxidanyl-[(2~{S},3~{R},5~{R},6~{S})-2,3,4,5,6-pentakis(oxidanyl)cyclohexyl]oxy-phosphoryl]oxy-propan-2-yl] (~{Z})-octadec-9-enoate × 1 PG2 PROSTAGLANDIN D2 × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.82 Å |