当前蛋白身份:Q9YDF8
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1ORQ X-ray structure of a voltage-dependent potassium channel in complex with an Fab 提交 2003-03-14 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 12 PDB 声明:dodecameric(12) 与蛋白数一致 |
链 C
31–253(223 aa)
片段:KvAP
|
突变:Y46C | CD CADMIUM ION × 28 K POTASSIUM ION × 24 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 5;293 K;PEG400, Cadmium chloride, Sodium acetate, pH 5.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
|
分辨率 3.20 Å R-free 0.298 |
| 1ORQ X-ray structure of a voltage-dependent potassium channel in complex with an Fab 提交 2003-03-14 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 24 PDB 声明:24-meric(24) 与蛋白数一致 |
链 C
31–253(223 aa)
片段:KvAP
|
突变:Y46C | CD CADMIUM ION × 56 K POTASSIUM ION × 48 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 5;293 K;PEG400, Cadmium chloride, Sodium acetate, pH 5.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
|
分辨率 3.20 Å R-free 0.298 |
| 1ORS X-ray structure of the KvAP potassium channel voltage sensor in complex with an Fab 提交 2003-03-14 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致 |
链 C
33–160(128 aa)
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;PEG4000, Hepes, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.251 |
| 2A0L Crystal structure of KvAP-33H1 Fv complex 提交 2005-06-16 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 12 PDB 声明:dodecameric(12) 与蛋白数一致 |
链 A
20–259(240 aa)
片段:KvAP K+ channel
链 B
20–259(240 aa)
片段:KvAP K+ channel
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未记录 | K POTASSIUM ION × 8 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 8.5;293 K;sodium citrate, Tric-HCl, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
|
分辨率 3.90 Å R-free 0.392 |
| 2KYH Solution structure of the voltage-sensing domain of KvAP 提交 2010-05-26 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致 |
链 A
18–160(143 aa)
片段:UNP Residues 18-160
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未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 7;318 K;离子强度(mmCIF原始值)40;压力 AMBIENT
NMR样品组成
0.1-0.5 MM [U-98% 15N] ENTITY, 20 MM HEPES, 20 MM POTASSIUM CHLORIDE, 5 MM DIHEPTANOYL PHOSPHATIDYLCHOLINE, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
0.1-0.5 MM [U-100% 13C U- 100% 15N U-80% 2H] ENTITY, 20 MM HEPES, 20 MM POTASSIUM CHLORIDE, 5 MM DIHEPTANOYL PHOSPHATIDYLCHOLINE, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
0.1-0.5 MM [U-98% 13C U-98% 15N] ENTITY, 20 MM HEPES, 20 MM POTASSIUM CHLORIDE, 5 MM DIHEPTANOYL PHOSPHATIDYLCHOLINE, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
0.1-0.5 MM [13CH3/12CD2]-LEU,VAL,[13CH3]-ILE ENTITY, 20 MM HEPES, 20 MM POTASSIUM CHLORIDE, 5 MM DIHEPTANOYL PHOSPHATIDYLCHOLINE, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
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分辨率未提供 |
| 6UWM Single particle cryo-EM structure of KvAP 提交 2019-11-05 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致 |
链 A
25–295(271 aa)
片段:UNP residues 25-295
链 B
25–295(271 aa)
片段:UNP residues 25-295
链 C
25–295(271 aa)
片段:UNP residues 25-295
链 D
25–295(271 aa)
片段:UNP residues 25-295
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未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE;Blot for 4 seconds before plunging.
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分辨率 5.90 Å |