当前蛋白身份:Q9YDF8 重新检索
本组结构的主要差异维度
构建体不同 突变/修饰不同 组装状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量指标不同

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相关结构差异明细

一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。

PDB 条目 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法 实验环境 结构质量
1ORQ X-ray structure of a voltage-dependent potassium channel in complex with an Fab 提交 2003-03-14 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 12 PDB 声明:dodecameric(12) 与蛋白数一致
链 C 31–253(223 aa) 片段:KvAP
突变:Y46C CD CADMIUM ION × 28 K POTASSIUM ION × 24 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 5;293 K;PEG400, Cadmium chloride, Sodium acetate, pH 5.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
分辨率 3.20 Å R-free 0.298
1ORQ X-ray structure of a voltage-dependent potassium channel in complex with an Fab 提交 2003-03-14 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 24 PDB 声明:24-meric(24) 与蛋白数一致
链 C 31–253(223 aa) 片段:KvAP
突变:Y46C CD CADMIUM ION × 56 K POTASSIUM ION × 48 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 5;293 K;PEG400, Cadmium chloride, Sodium acetate, pH 5.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
分辨率 3.20 Å R-free 0.298
1ORS X-ray structure of the KvAP potassium channel voltage sensor in complex with an Fab 提交 2003-03-14 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 C 33–160(128 aa)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;PEG4000, Hepes, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
分辨率 1.90 Å R-free 0.251
2A0L Crystal structure of KvAP-33H1 Fv complex 提交 2005-06-16 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 12 PDB 声明:dodecameric(12) 与蛋白数一致
链 A 20–259(240 aa) 片段:KvAP K+ channel
链 B 20–259(240 aa) 片段:KvAP K+ channel
未记录 K POTASSIUM ION × 8 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 8.5;293 K;sodium citrate, Tric-HCl, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
分辨率 3.90 Å R-free 0.392
2KYH Solution structure of the voltage-sensing domain of KvAP 提交 2010-05-26 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 18–160(143 aa) 片段:UNP Residues 18-160
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 7;318 K;离子强度(mmCIF原始值)40;压力 AMBIENT
NMR样品组成 0.1-0.5 MM [U-98% 15N] ENTITY, 20 MM HEPES, 20 MM POTASSIUM CHLORIDE, 5 MM DIHEPTANOYL PHOSPHATIDYLCHOLINE, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 0.1-0.5 MM [U-100% 13C U- 100% 15N U-80% 2H] ENTITY, 20 MM HEPES, 20 MM POTASSIUM CHLORIDE, 5 MM DIHEPTANOYL PHOSPHATIDYLCHOLINE, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 0.1-0.5 MM [U-98% 13C U-98% 15N] ENTITY, 20 MM HEPES, 20 MM POTASSIUM CHLORIDE, 5 MM DIHEPTANOYL PHOSPHATIDYLCHOLINE, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 0.1-0.5 MM [13CH3/12CD2]-LEU,VAL,[13CH3]-ILE ENTITY, 20 MM HEPES, 20 MM POTASSIUM CHLORIDE, 5 MM DIHEPTANOYL PHOSPHATIDYLCHOLINE, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
分辨率未提供
6UWM Single particle cryo-EM structure of KvAP 提交 2019-11-05 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致
链 A 25–295(271 aa) 片段:UNP residues 25-295
链 B 25–295(271 aa) 片段:UNP residues 25-295
链 C 25–295(271 aa) 片段:UNP residues 25-295
链 D 25–295(271 aa) 片段:UNP residues 25-295
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE;Blot for 4 seconds before plunging.
分辨率 5.90 Å