当前蛋白身份:Q9YYU8 重新检索
本组结构的主要差异维度
构建体不同 组装状态不同 实验环境不同 结构质量指标不同

差异标签只比较当前检索结果;所有PDB和assembly原始记录仍分别保留。

相关结构差异明细

一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。

PDB 条目 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法 实验环境 结构质量
3NFN Recognition of peptide-MHC by a V-delta/V-beta TCR 提交 2010-06-10 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 C 134–143(10 aa)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.5;288 K;0.1M MES monohydrate, pH 6.5, 12% w/v PEG 20000, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 288K
分辨率 2.39 Å R-free 0.222
3QZW Plasticity of human CD8 binding to peptide-HLA-A*2402 提交 2011-03-07 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 5 PDB 声明:pentameric(5) 与蛋白数一致
链 C 134–143(10 aa)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.5;288 K;0.1M MES monohydrate, pH 6.5, 12% w/v PEG 20000, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 288K
分辨率 2.80 Å R-free 0.260
3QZW Plasticity of human CD8 binding to peptide-HLA-A*2402 提交 2011-03-07 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 5 PDB 声明:pentameric(5) 与蛋白数一致
链 F 134–143(10 aa)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.5;288 K;0.1M MES monohydrate, pH 6.5, 12% w/v PEG 20000, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 288K
分辨率 2.80 Å R-free 0.260
3RL2 HIV Nef derived peptide Nef73 complexed to HLA-A*0301 提交 2011-04-19 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 C 73–82(10 aa)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.5;291 K;0.2M calcium acetate hydrate, 0.1M Sodium cacodylate trihydrate, 18%(w/v) Polyethylene glycol 8000, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
分辨率 2.39 Å R-free 0.265
3VXN HLA-A24 in complex with HIV-1 Nef134-10(wt) 提交 2012-09-20 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 C 134–143(10 aa)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;5% PEG 8000, 50mM ammonium formate, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
分辨率 1.95 Å R-free 0.246
3VXR The complex between H27-14 TCR and HLA-A24 bound to HIV-1 Nef134-10(wt) peptide 提交 2012-09-20 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 5 PDB 声明:pentameric(5) 与蛋白数一致
链 C 134–143(10 aa)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;20% PEG3350, 0.1M ammonium phosphate dibasic, 10mM barium chloride dihydrate, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
分辨率 2.40 Å R-free 0.242
4LNR The structure of HLA-B*35:01 in complex with the peptide (RPQVPLRPMTY) 提交 2013-07-12 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 C 71–81(11 aa)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.5;291 K;0.1M MES monohydrate pH 6.5, 12% w/v Polyethylene glycol 20,000, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
分辨率 2.00 Å R-free 0.208
4WU5 HLA-A24 in complex with HIV-1 Nef134-8(wt) 提交 2014-10-31 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 C 134–141(8 aa)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;20% PEG 3350, 200 mM sodium nitrate
分辨率 2.40 Å R-free 0.271
4WU5 HLA-A24 in complex with HIV-1 Nef134-8(wt) 提交 2014-10-31 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 F 134–141(8 aa)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;20% PEG 3350, 200 mM sodium nitrate
分辨率 2.40 Å R-free 0.271