当前蛋白身份:Q9YYU8
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 3NFN Recognition of peptide-MHC by a V-delta/V-beta TCR 提交 2010-06-10 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致 |
链 C
134–143(10 aa)
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.5;288 K;0.1M MES monohydrate, pH 6.5, 12% w/v PEG 20000, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 288K
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分辨率 2.39 Å R-free 0.222 |
| 3QZW Plasticity of human CD8 binding to peptide-HLA-A*2402 提交 2011-03-07 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 5 PDB 声明:pentameric(5) 与蛋白数一致 |
链 C
134–143(10 aa)
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.5;288 K;0.1M MES monohydrate, pH 6.5, 12% w/v PEG 20000, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 288K
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分辨率 2.80 Å R-free 0.260 |
| 3QZW Plasticity of human CD8 binding to peptide-HLA-A*2402 提交 2011-03-07 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 5 PDB 声明:pentameric(5) 与蛋白数一致 |
链 F
134–143(10 aa)
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.5;288 K;0.1M MES monohydrate, pH 6.5, 12% w/v PEG 20000, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 288K
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分辨率 2.80 Å R-free 0.260 |
| 3RL2 HIV Nef derived peptide Nef73 complexed to HLA-A*0301 提交 2011-04-19 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致 |
链 C
73–82(10 aa)
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.5;291 K;0.2M calcium acetate hydrate, 0.1M Sodium cacodylate trihydrate, 18%(w/v) Polyethylene glycol 8000, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
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分辨率 2.39 Å R-free 0.265 |
| 3VXN HLA-A24 in complex with HIV-1 Nef134-10(wt) 提交 2012-09-20 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致 |
链 C
134–143(10 aa)
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;5% PEG 8000, 50mM ammonium formate, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
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分辨率 1.95 Å R-free 0.246 |
| 3VXR The complex between H27-14 TCR and HLA-A24 bound to HIV-1 Nef134-10(wt) peptide 提交 2012-09-20 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 5 PDB 声明:pentameric(5) 与蛋白数一致 |
链 C
134–143(10 aa)
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;20% PEG3350, 0.1M ammonium phosphate dibasic, 10mM barium chloride dihydrate, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
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分辨率 2.40 Å R-free 0.242 |
| 4LNR The structure of HLA-B*35:01 in complex with the peptide (RPQVPLRPMTY) 提交 2013-07-12 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致 |
链 C
71–81(11 aa)
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.5;291 K;0.1M MES monohydrate pH 6.5, 12% w/v Polyethylene glycol 20,000, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
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分辨率 2.00 Å R-free 0.208 |
| 4WU5 HLA-A24 in complex with HIV-1 Nef134-8(wt) 提交 2014-10-31 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致 |
链 C
134–141(8 aa)
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;20% PEG 3350, 200 mM sodium nitrate
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分辨率 2.40 Å R-free 0.271 |
| 4WU5 HLA-A24 in complex with HIV-1 Nef134-8(wt) 提交 2014-10-31 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致 |
链 F
134–141(8 aa)
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;20% PEG 3350, 200 mM sodium nitrate
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.271 |