当前蛋白身份:V0YYV3 重新检索
本组结构的主要差异维度
构建体不同 组装状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量指标不同

差异标签只比较当前检索结果;所有PDB和assembly原始记录仍分别保留。

相关结构差异明细

一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。

PDB 条目 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法 实验环境 结构质量
6VU3 Cryo-EM structure of Escherichia coli transcription-translation complex A (TTC-A) containing mRNA with a 12 nt long spacer 提交 2020-02-14 Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 58 PDB 声明:66-meric(66) 与全部聚合物一致
链 g 1–66(66 aa)
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
6VYU Escherichia coli transcription-translation complex C2 (TTC-C2) containing a 27 nt long mRNA spacer 提交 2020-02-27 Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 56 PDB 声明:65-meric(65) 与全部聚合物一致
链 g 1–70(70 aa)
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 7.00 Å
6VZ3 Escherichia coli transcription-translation complex D2 (TTC-D2) containing mRNA with a 27 nt long spacer 提交 2020-02-27 Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 56 PDB 声明:65-meric(65) 与全部聚合物一致
链 g 1–66(66 aa)
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 8.90 Å
6VZ7 Escherichia coli transcription-translation complex C1 (TTC-C1) containing a 27 nt long mRNA spacer, NusG, and fMet-tRNAs at P-site and E-site 提交 2020-02-27 Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 56 PDB 声明:65-meric(65) 与全部聚合物一致
链 g 1–66(66 aa)
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 7.00 Å
6VZJ Escherichia coli transcription-translation complex A1 (TTC-A1) containing mRNA with a 15 nt long spacer, fMet-tRNAs at E-site and P-site, and lacking transcription factor NusG 提交 2020-02-28 Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 57 PDB 声明:65-meric(65) 与全部聚合物一致
链 g 1–66(66 aa)
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.10 Å
6YSR Structure of the P+9 stalled ribosome complex 提交 2020-04-23 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 52 PDB 声明:57-meric(57) 与全部聚合物一致
链 6 1–70(70 aa)
未记录 MG MAGNESIUM ION × 332 ZN ZINC ION × 2 CL CHLORIDE ION × 1 NA SODIUM ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4;50 mM HEPES, 30 mM KCl, 7 mM MgCl2
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE;Manual blotting & plunge-freezing
分辨率 3.10 Å
7CPJ ycbZ-stalled 70S ribosome 提交 2020-08-07 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 51 PDB 声明:56-meric(56) 与全部聚合物一致
链 6 1–70(70 aa)
未记录 ILE ISOLEUCINE × 1 PRO PROLINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
7TOS E. coli 70S ribosomes bound with the ALS/FTD-associated dipeptide repeat protein PR20 提交 2022-01-24 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 53 PDB 声明:56-meric(56) 与全部聚合物一致
链 L31 1–66(66 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å